Risco de Recorrência de Mutações de Novo: Pesquisa e Quantificação do Mosaicismo Germinal Paterno pelo Uso Combinado de Ferramentas Genômicas (RRMUT)
- Inclusão de 5 famílias As inclusões serão feitas pelo departamento de genética clínica do Hospital Universitário de Rouen (estudo monocêntrico) e corresponderão a trios de pais + filho com anomalias de desenvolvimento inexplicáveis. A inclusão de pacientes será integrada aos cuidados de rotina e terá como benefício imediato para as famílias incluídas a ampla análise do probando e dos genomas de seus pais por meio de técnicas de sequenciamento de leitura curta e longa, que representam os testes diagnósticos mais abrangentes para doenças do desenvolvimento, e que atualmente não estão disponíveis rotineiramente. A inclusão na genética clínica por médicos acostumados a prescrever análises de todo o genoma permitirá informações claras e completas às famílias. Coleta de consentimentos. O DNA do trio já estará disponível no laboratório de genética molecular e uma nova amostra de sangue poderá ser proposta caso seja necessário. Coleta de esperma do pai.
- Identificação de um grande conjunto de mutações de novo. Extração de DNA sanguíneo e envio para sequenciamento do genoma completo ao Centro Nacional de Pesquisa em Genômica Humana (CNRGH, Evry), no âmbito de uma colaboração já iniciada. Análise dos dados de sequenciamento graças à expertise já existente em Rouen. Identificação de cerca de 40-120 mutações de novo por trio. Nesta fase: interpretação das variações identificadas com o objetivo secundário de identificar a causa da doença em crianças. Os genomas de leitura longa permitirão fasear as variantes de novo para o haplótipo paterno ou materno.
- Procure por mutações de novo em amostras de esperma paternas. Extração de DNA espermático. Desenho de um painel de sequenciamento visando as variações genéticas identificadas nos diferentes trios. A preparação das bibliotecas, visada pelo sequenciamento de alto rendimento em grande profundidade graças às técnicas e equipamentos já operacionais. Pesquisa específica para as variações de novo identificadas nos probandos (em 2.), com para cada avaliação de (i) a presença da variação na amostra de esperma, (ii) a quantidade de mosaicismo, refletindo a proporção de espermatozóides portadores e portanto, o risco de recorrência, (iii) a presença de minha variação na amostra de sangue de ambos os pais em sequenciamento profundo.
Visão geral do estudo
Status
Status
Condições
Condições
Intervenção / Tratamento
Intervenção / Tratamento
Tipo de estudo
Tipo de estudo
Inscrição (Real)
Inscrição
Estágio
Estágio
- Não aplicável
Contactos e Locais
Contato de estudo
Contato de estudo
- Nome: François LECOQUIERRE, MD
- Número de telefone: 8858 +3323288
- E-mail: francois.lecoquierre@chu-rouen.fr
Estude backup de contato
- Nome: Julien BLOT
- Número de telefone: +3323288
- E-mail: julien.blot@chu-rouen.fr
Locais de estudo
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Rouen, França
- Rouen University Hospital
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Critérios de participação
Critérios de elegibilidade
Critérios de elegibilidade
Idades elegíveis para estudo
- Filho
- Adulto
- Adulto mais velho
Aceita Voluntários Saudáveis
Descrição
Critério de inclusão:
- Trio composto por uma criança com um distúrbio de desenvolvimento e ambos os pais não afetados
- Ausência de etiologia após perícia clínica e testes genéticos
- Indicação de uma análise de sequenciamento de todo o genoma
- Criança de gravidez espontânea sem tratamento de estimulação da ovulação
- Disponibilidade de amostras de sangue de DNA
- Filiação a um seguro social
- Paciente ou representante legal do paciente que leu e entendeu a carta informativa e assinou o termo de consentimento
Critério de exclusão:
- Falta de indicação para uma análise de todo o genoma no probando
- Etiologia do transtorno do desenvolvimento já identificada
- Probando nascido após fertilização in vitro
- Impossibilidade de coleta não invasiva de esperma do pai
Plano de estudo
Como o estudo é projetado?
Detalhes do projeto
- Finalidade Principal: Diagnóstico
- Alocação: N / D
- Modelo Intervencional: Atribuição de grupo único
- Mascaramento: Nenhum (rótulo aberto)
Número de braços
Armas e Intervenções
Grupo de Participantes / BraçoGrupo de Participantes / Braço |
Intervenção / TratamentoIntervenção / Tratamento |
|---|---|
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Experimental: Indicação para uma análise genómica abrangente no probando
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análises de todo o genoma serão feitas em pacientes e pais (pai, mãe)
A análise de esperma será feita em amostras paternas
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O que o estudo está medindo?
Medidas de resultados primários
Medidas de resultados primários
Medida de resultado |
Prazo |
|---|---|
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Proporção de mutações de novo do paciente detectáveis no esperma do pai
Prazo: Dia 1
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Dia 1
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Medidas de resultados secundários
Medidas de resultados secundários
Medida de resultado |
Prazo |
|---|---|
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Número de pacientes para os quais o diagnóstico molecular foi obtido (causa da deficiência de desenvolvimento identificada) ≥1
Prazo: Dia 1
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Dia 1
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Patrocinador
Investigadores
Investigadores
- Investigador principal: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Publicações e links úteis
Publicações Gerais
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Datas de registro do estudo
Datas Principais do Estudo
Início do estudo (Real)
Início do estudo
Conclusão Primária (Real)
Conclusão Primária
Conclusão do estudo (Real)
Conclusão do estudo
Datas de inscrição no estudo
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Enviado pela primeira vez que atendeu aos critérios de CQ
Primeira postagem (Real)
Primeira postagem
Atualizações de registro de estudo
Última Atualização Postada (Real)
Última Atualização Postada
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última atualização enviada que atendeu aos critérios de controle de qualidade
Última verificação
Última verificação
Mais Informações
Termos relacionados a este estudo
Termos MeSH relevantes adicionais
Outros números de identificação do estudo
Outros números de identificação do estudo
- 2019/0401/HP
Plano para dados de participantes individuais (IPD)
Planeja compartilhar dados de participantes individuais (IPD)?
Informações sobre medicamentos e dispositivos, documentos de estudo
Estuda um medicamento regulamentado pela FDA dos EUA
Estuda um produto de dispositivo regulamentado pela FDA dos EUA
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