Risico op herhaling van de Novo-mutaties: onderzoek en kwantificering van vaderlijk germinaal mozaïcisme door het gecombineerde gebruik van genomische hulpmiddelen (RRMUT)
- Inclusie van 5 families Inclusies zullen worden gemaakt door de afdeling klinische genetica van het Universitair Ziekenhuis van Rouen (monocentrische studie) en zullen overeenkomen met trio's van ouders + kind met onverklaarbare ontwikkelingsstoornissen. De opname van patiënten zal worden geïntegreerd in de routinezorg en zal als direct voordeel hebben voor de opgenomen families de uitgebreide analyse van de proband en het genoom van hun ouders door korte en lange leessequencingtechnieken, die de meest uitgebreide diagnostische tests voor ontwikkelingsziekten vertegenwoordigen, en die momenteel niet routinematig beschikbaar zijn. Opname in klinische genetica door clinici die gewend zijn genoombrede analyses voor te schrijven, zal duidelijke en volledige informatie aan families mogelijk maken. Verzameling van toestemmingen. Het DNA van het trio zal al beschikbaar zijn in het laboratorium voor moleculaire genetica en indien nodig kan een nieuw bloedmonster worden voorgesteld. Verzameling van sperma van de vader.
- Identificatie van een groot aantal de novo mutaties. Extractie van bloed-DNA en verzending voor sequentiebepaling van het volledige genoom naar het National Centre for Research in Human Genomics (CNRGH, Evry), in het kader van een reeds gestarte samenwerking. Analyse van de sequentiegegevens dankzij de reeds bestaande expertise in Rouen. Identificatie van ongeveer 40-120 de novo mutaties per trio. In dit stadium: interpretatie van de geïdentificeerde variaties met als secundair doel de oorzaak van de ziekte bij kinderen te identificeren. Long read genomen zullen het mogelijk maken om de de novo varianten te faseren naar het vaderlijke of moederlijke haplotype.
- Zoek naar de novo-mutaties in spermamonsters van de vader. Extractie van spermatisch DNA. Ontwerp van een sequencing-panel gericht op de genetische variaties geïdentificeerd in de verschillende trio's. Voorbereiding van de bibliotheken, gerichte high throughput sequencing op grote diepte dankzij de reeds operationele technieken en apparatuur. Specifiek zoeken naar de de novo variaties geïdentificeerd in de probands (in 2.), met voor elke evaluatie van (i) de aanwezigheid van de variatie in het spermamonster, (ii) de hoeveelheid mozaïekvorming, die het aandeel dragerspermacellen weerspiegelt en daarom het risico op herhaling, (iii) de aanwezigheid van mijn variatie in het bloedmonster van beide ouders bij deep sequencing.
Studie Overzicht
Toestand
Toestand
Conditie
Conditie
Interventie / Behandeling
Interventie / Behandeling
Studietype
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Inschrijving
Fase
Fase
- Niet toepasbaar
Contacten en locaties
Studiecontact
Studiecontact
- Naam: François LECOQUIERRE, MD
- Telefoonnummer: 8858 +3323288
- E-mail: francois.lecoquierre@chu-rouen.fr
Studie Contact Back-up
- Naam: Julien BLOT
- Telefoonnummer: +3323288
- E-mail: julien.blot@chu-rouen.fr
Studie Locaties
-
-
-
Rouen, Frankrijk
- Rouen University Hospital
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
- Kind
- Volwassen
- Oudere volwassene
Accepteert gezonde vrijwilligers
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- Trio bestaande uit een kind met een ontwikkelingsstoornis en beide onaangetaste ouders
- Afwezigheid van etiologie na klinische expertise en genetische testen
- Indicatie van een genoombrede sequencing-analyse
- Kind uit spontane zwangerschap zonder ovulatiestimulatiebehandeling
- Beschikbaarheid van DNA-bloedmonsters
- Aansluiting bij een sociale verzekering
- Patiënt of wettelijke vertegenwoordiger van patiënt die de informatiebrief heeft gelezen en begrepen en het toestemmingsformulier heeft ondertekend
Uitsluitingscriteria:
- Gebrek aan indicatie voor een genoombrede analyse bij de proband
- Etiologie van de ontwikkelingsstoornis reeds geïdentificeerd
- Proband geboren na in-vitrofertilisatie
- Onmogelijkheid van niet-invasieve spermaverzameling van de vader
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
- Primair doel: Diagnostisch
- Toewijzing: NVT
- Interventioneel model: Opdracht voor een enkele groep
- Masker: Geen (open label)
Aantal wapens
Wapens en interventies
Deelnemersgroep / ArmDeelnemersgroep / Arm |
Interventie / BehandelingInterventie / Behandeling |
|---|---|
|
Experimenteel: Indicatie voor een genoombrede analyse bij de proband
|
er zullen genoombrede analyses gebeuren bij patiënten en ouders (vader, moeder)
Sperma-analyse zal worden gedaan in vaderlijke monsters
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Aandeel van de de novo mutaties van de patiënt dat detecteerbaar is in het sperma van de vader
Tijdsspanne: Dag 1
|
Dag 1
|
Secundaire uitkomstmaten
Secundaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Tijdsspanne |
|---|---|
|
Aantal patiënten bij wie een moleculaire diagnose is verkregen (oorzaak van ontwikkelingsstoornis geïdentificeerd) ≥1
Tijdsspanne: Dag 1
|
Dag 1
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Sponsor
Onderzoekers
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (Werkelijk)
Studie start
Primaire voltooiing (Werkelijk)
Primaire voltooiing
Studie voltooiing (Werkelijk)
Studie voltooiing
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (Werkelijk)
Eerst geplaatst
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (Werkelijk)
Laatste update geplaatst
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Aanvullende relevante MeSH-voorwaarden
Andere studie-ID-nummers
Andere studie-ID-nummers
- 2019/0401/HP
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .