Rezidivrisiko von De-novo-Mutationen: Erforschung und Quantifizierung des väterlichen Keimmosaiks durch die kombinierte Verwendung genomischer Werkzeuge (RRMUT)
- Aufnahme von 5 Familien Die Aufnahme erfolgt durch die Abteilung für klinische Genetik des Universitätsklinikums Rouen (monozentrische Studie) und entspricht Trios von Eltern + Kind mit ungeklärten Entwicklungsanomalien. Der Einschluss von Patienten wird in die Routineversorgung integriert und hat als unmittelbaren Vorteil für die eingeschlossenen Familien die umfassende Analyse der Probanden- und ihrer Elterngenome durch Short- und Long-Read-Sequenzierungstechniken, die die umfassendsten diagnostischen Tests für Entwicklungskrankheiten darstellen. und die derzeit nicht routinemäßig verfügbar sind. Die Aufnahme in die klinische Genetik durch Kliniker, die daran gewöhnt sind, genomweite Analysen zu verschreiben, wird den Familien klare und vollständige Informationen ermöglichen. Einholung von Einwilligungen. Die DNA des Trios wird bereits im Molekulargenetik-Labor verfügbar sein, und bei Bedarf kann eine neue Blutprobe vorgeschlagen werden. Sammlung von Spermien beim Vater.
- Identifizierung einer großen Menge von De-novo-Mutationen. Extraktion von Blut-DNA und Einsendung des vollständigen Genoms zur Sequenzierung an das Nationale Zentrum für Humangenomforschung (CNRGH, Evry) im Rahmen einer bereits begonnenen Zusammenarbeit. Analyse der Sequenzierungsdaten dank der bereits vorhandenen Expertise in Rouen. Identifizierung von etwa 40–120 De-novo-Mutationen pro Trio. In dieser Phase: Interpretation der identifizierten Variationen mit dem sekundären Ziel, die Ursache der Krankheit bei Kindern zu identifizieren. Long-read-Genome werden es ermöglichen, die De-novo-Varianten dem väterlichen oder dem mütterlichen Haplotyp anzupassen.
- Suche nach De-novo-Mutationen in väterlichen Spermienproben. Extraktion von Sperma-DNA. Design eines Sequenzierungspanels, das auf die genetischen Variationen abzielt, die in den verschiedenen Trios identifiziert wurden. Vorbereitung der Bibliotheken, gezielte Hochdurchsatz-Sequenzierung in großer Tiefe dank der bereits eingesetzten Techniken und Geräte. Gezielte Suche nach den in den Probanden identifizierten De-novo-Variationen (in 2.), wobei für jede Bewertung (i) das Vorhandensein der Variation in der Spermienprobe, (ii) die Menge an Mosaizismus, die den Anteil an Trägerspermien widerspiegelt, und daher das Risiko eines erneuten Auftretens, (iii) das Vorhandensein meiner Variation in der Blutprobe beider Elternteile bei der Tiefensequenzierung.
Studienübersicht
Status
Status
Bedingungen
Bedingungen
Intervention / Behandlung
Intervention / Behandlung
Studientyp
Studientyp
Einschreibung (Tatsächlich)
Einschreibung
Phase
Phase
- Unzutreffend
Kontakte und Standorte
Studienkontakt
Studienkontakt
- Name: François LECOQUIERRE, MD
- Telefonnummer: 8858 +3323288
- E-Mail: francois.lecoquierre@chu-rouen.fr
Studieren Sie die Kontaktsicherung
- Name: Julien BLOT
- Telefonnummer: +3323288
- E-Mail: julien.blot@chu-rouen.fr
Studienorte
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Rouen, Frankreich
- Rouen University Hospital
-
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Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
- Kind
- Erwachsene
- Älterer Erwachsener
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Beschreibung
Einschlusskriterien:
- Trio bestehend aus einem Kind mit einer Entwicklungsstörung und beiden nicht betroffenen Eltern
- Fehlen der Ätiologie nach klinischer Expertise und Gentests
- Hinweis auf eine genomweite Sequenzierungsanalyse
- Kind aus Spontanschwangerschaft ohne Ovulationsstimulationsbehandlung
- Verfügbarkeit von DNA-Blutproben
- Anschluss an eine Sozialversicherung
- Patient oder gesetzlicher Vertreter des Patienten, der das Informationsschreiben gelesen und verstanden und die Einwilligungserklärung unterschrieben hat
Ausschlusskriterien:
- Fehlende Indikation für eine genomweite Analyse beim Probanden
- Ätiologie der bereits identifizierten Entwicklungsstörung
- Proband, geboren nach In-vitro-Fertilisation
- Unmöglichkeit der nicht-invasiven Spermiengewinnung beim Vater
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Hauptzweck: Diagnose
- Zuteilung: N / A
- Interventionsmodell: Einzelgruppenzuweisung
- Maskierung: Keine (Offenes Etikett)
Anzahl der Arme
Waffen und Interventionen
Teilnehmergruppe / ArmTeilnehmergruppe / Arm |
Intervention / BehandlungIntervention / Behandlung |
|---|---|
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Experimental: Indikation für eine genomweite Analyse des Probanden
|
Genomweite Analysen werden bei Patienten und Eltern (Vater, Mutter) durchgeführt
Die Spermienanalyse wird in väterlichen Proben durchgeführt
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Zeitfenster |
|---|---|
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Anteil der im Sperma des Vaters nachweisbaren De-novo-Mutationen des Patienten
Zeitfenster: Tag 1
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Tag 1
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Sekundäre Ergebnismessungen
Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Zeitfenster |
|---|---|
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Anzahl der Patienten, bei denen eine molekulare Diagnose gestellt wurde (Ursache der Entwicklungsstörung identifiziert) ≥1
Zeitfenster: Tag 1
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Tag 1
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Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Sponsor
Ermittler
Ermittler
- Hauptermittler: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Studienbeginn
Primärer Abschluss (Tatsächlich)
Primärer Abschluss
Studienabschluss (Tatsächlich)
Studienabschluss
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Zuerst gepostet
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes Update gepostet
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
Zuletzt verifiziert
Mehr Informationen
Begriffe im Zusammenhang mit dieser Studie
Zusätzliche relevante MeSH-Bedingungen
Andere Studien-ID-Nummern
Andere Studien-ID-Nummern
- 2019/0401/HP
Plan für individuelle Teilnehmerdaten (IPD)
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Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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