Riesgo de recurrencia de mutaciones de novo: investigación y cuantificación del mosaicismo germinal paterno mediante el uso combinado de herramientas genómicas (RRMUT)
- Inclusión de 5 familias Las inclusiones serán realizadas por el departamento de genética clínica del Hospital Universitario de Rouen (estudio monocéntrico) y corresponderán a tríos de padres + hijo con alteraciones del desarrollo inexplicables. La inclusión de pacientes se integrará en la atención de rutina y tendrá como beneficio inmediato para las familias incluidas el análisis extenso del genoma del probando y de sus padres mediante técnicas de secuenciación de lectura corta y larga, que representan las pruebas de diagnóstico más completas para enfermedades del desarrollo. y que actualmente no están disponibles de forma rutinaria. La inclusión en la genética clínica por parte de médicos acostumbrados a prescribir análisis de todo el genoma permitirá una información clara y completa a las familias. Recogida de consentimientos. El ADN del trío ya estará disponible en el laboratorio de genética molecular, y se puede proponer una nueva muestra de sangre si es necesario. Colección de esperma del padre.
- Identificación de un gran conjunto de mutaciones de novo. Extracción de ADN de sangre y envío para secuenciación del genoma completo al Centro Nacional de Investigación en Genómica Humana (CNRGH, Evry), en el marco de una colaboración ya iniciada. Análisis de los datos de secuenciación gracias a la experiencia ya existente en Rouen. Identificación de alrededor de 40-120 mutaciones de novo por trío. En esta etapa: interpretación de las variaciones identificadas con el objetivo secundario de identificar la causa de la enfermedad en los niños. Los genomas de lectura larga permitirán clasificar las variantes de novo en el haplotipo paterno o materno.
- Búsqueda de mutaciones de novo en muestras de esperma paterno. Extracción de ADN espermático. Diseño de un panel de secuenciación dirigido a las variaciones genéticas identificadas en los diferentes tríos. Preparación de las bibliotecas, secuenciación dirigida de alto rendimiento a gran profundidad gracias a las técnicas y equipos ya operativos. Búsqueda específica de las variaciones de novo identificadas en los probandos (en 2.), con para cada evaluación de (i) la presencia de la variación en la muestra de esperma, (ii) la cantidad de mosaicismo, reflejando la proporción de espermatozoides portadores y por lo tanto el riesgo de recurrencia, (iii) la presencia de mi variación en la muestra de sangre de ambos padres en secuenciación profunda.
Descripción general del estudio
Estado
Estado
Condiciones
Condiciones
Intervención / Tratamiento
Intervención / Tratamiento
Tipo de estudio
Tipo de estudio
Inscripción (Actual)
Inscripción
Fase
Fase
- No aplica
Contactos y Ubicaciones
Estudio Contacto
Estudio Contacto
- Nombre: François LECOQUIERRE, MD
- Número de teléfono: 8858 +3323288
- Correo electrónico: francois.lecoquierre@chu-rouen.fr
Copia de seguridad de contactos de estudio
- Nombre: Julien BLOT
- Número de teléfono: +3323288
- Correo electrónico: julien.blot@chu-rouen.fr
Ubicaciones de estudio
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Rouen, Francia
- Rouen University Hospital
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Criterios de participación
Criterio de elegibilidad
Criterio de elegibilidad
Edades elegibles para estudiar
- Niño
- Adulto
- Adulto Mayor
Acepta Voluntarios Saludables
Descripción
Criterios de inclusión:
- Trío formado por un niño con un trastorno del desarrollo y ambos padres no afectados
- Ausencia de etiología después de la experiencia clínica y las pruebas genéticas
- Indicación de un análisis de secuenciación del genoma completo
- Niño de embarazo espontáneo sin tratamiento de estimulación de la ovulación
- Disponibilidad de muestras de sangre de ADN
- Afiliación a un seguro social
- Paciente o representante legal del paciente que ha leído y entendido la carta de información y ha firmado el formulario de consentimiento
Criterio de exclusión:
- Falta de indicación para un análisis de todo el genoma en el probando
- Etiología del trastorno del desarrollo ya identificado
- Proband nacido después de la fecundación in vitro
- Imposibilidad de recogida no invasiva de semen del padre
Plan de estudios
¿Cómo está diseñado el estudio?
Detalles de diseño
- Propósito principal: Diagnóstico
- Asignación: N / A
- Modelo Intervencionista: Asignación de un solo grupo
- Enmascaramiento: Ninguno (etiqueta abierta)
Número de brazos
Armas e Intervenciones
Grupo de participantes/brazoGrupo de participantes/brazo |
Intervención / TratamientoIntervención / Tratamiento |
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Experimental: Indicación para un análisis de genoma completo en el probando
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Se realizarán análisis de todo el genoma en pacientes y padres (padre, madre)
El análisis de esperma se realizará en muestras paternas.
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¿Qué mide el estudio?
Medidas de resultado primarias
Medidas de resultado primarias
Medida de resultado |
Periodo de tiempo |
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Proporción de mutaciones de novo del paciente detectables en el esperma del padre
Periodo de tiempo: Día 1
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Día 1
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Medidas de resultado secundarias
Medidas de resultado secundarias
Medida de resultado |
Periodo de tiempo |
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Número de pacientes para los que se ha obtenido un diagnóstico molecular (causa de la discapacidad del desarrollo identificada) ≥1
Periodo de tiempo: Día 1
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Día 1
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Colaboradores e Investigadores
Patrocinador
Patrocinador
Investigadores
Investigadores
- Investigador principal: François LECOQUIERRE, MD, University Hospital, Rouen
Publicaciones y enlaces útiles
Publicaciones Generales
- Lecoquierre F, Drouot N, Coutant S, Quenez O, Fourneaux S, Jumeau F, Rives N, Charbonnier F, Derambure C, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Goldenberg A, Guerrot AM, Charbonnier C, Nicolas G. Parental germline mosaicism in genome-wide phased de novo variants: Recurrence risk assessment and implications for precision genetic counselling. PLoS Genet. 2025 Mar 31;21(3):e1011651. doi: 10.1371/journal.pgen.1011651. eCollection 2025 Mar.
- Lecoquierre F, Quenez O, Fourneaux S, Coutant S, Vezain M, Rolain M, Drouot N, Boland A, Olaso R, Meyer V, Deleuze JF, Dabbagh D, Gilles I, Gayet C, Saugier-Veber P, Goldenberg A, Guerrot AM, Nicolas G. High diagnostic potential of short and long read genome sequencing with transcriptome analysis in exome-negative developmental disorders. Hum Genet. 2023 Jun;142(6):773-783. doi: 10.1007/s00439-023-02553-1. Epub 2023 Apr 19.
Fechas de registro del estudio
Fechas importantes del estudio
Inicio del estudio (Actual)
Inicio del estudio
Finalización primaria (Actual)
Finalización primaria
Finalización del estudio (Actual)
Finalización del estudio
Fechas de registro del estudio
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Más información
Términos relacionados con este estudio
Términos MeSH relevantes adicionales
Otros números de identificación del estudio
Otros números de identificación del estudio
- 2019/0401/HP
Plan de datos de participantes individuales (IPD)
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Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio
Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.
Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.
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