Pathogenübertragung und Gesundheitsergebnismodelle enterischer Erkrankungen (PATHOME)

LERNZIELE

Die allgemeine Hypothese der PATHOME-Studie ist, dass die gemeinsame Modellierung von enterischen Pathomen über Haushalte und Nachbarschaften hinweg, die Kontraste in der städtischen gesellschaftlichen Entwicklung darstellen, zeigen wird, dass die Entwicklung zu einer Pathom-Evolution von komplexen zu einfachen Gemeinschaftsstrukturen und damit zu niedrigeren Nachweisfrequenzen für einzelne Pathogen-Taxa führt . Die Studie zielt darauf ab, (1) raumzeitliche und bahnbezogene statistische Modelle zu entwickeln, um die komplexen Expositionsrisiken für Säuglinge durch das enterische Pathom zu verstehen; (2) Umwelt-, Verhaltens-, räumliche, wirtschaftliche und mikrobielle Daten zu sammeln, um das enterische Pathom entlang der Krankheitsverbreitungswege und der Kreuzung von Menschen und Tieren mit diesen Wegen zu charakterisieren; und (3) agentenbasierte Modelle (ABMs) entwickeln und validieren, um vorherzusagen, welche sozialen und ökologischen Stadtentwicklungsmaßnahmen (z. Tiergehege, Bau von Latrinen oder Abflüssen, Betonböden) verhindern am besten die Übertragung mehrerer Krankheitserreger auf Säuglinge in Ländern mit hoher Krankheitslast, indem etablierte kenianische Studienzentren als Modell verwendet werden.

Um die Modellierungs- und Berechnungsziele zu erfüllen, werden umfassende, miteinander verknüpfte Daten benötigt, die derzeit nicht vorhanden sind. Zum Beispiel gibt es nur wenige Daten über die Gesundheit von Kindern und die Exposition gegenüber enterischen Krankheitserregern in der Mittelschicht in Städten, die einen epidemiologischen Übergang von einer Infektions- zu einer nicht übertragbaren Krankheitslast durchlaufen, um sie den reichlicheren Daten von Kindern in städtischen Gebieten mit niedrigem Einkommen gegenüberzustellen. Räumliche Daten darüber, wo Kinder exponiert sein können und wie lange eine vollständige Lücke besteht. Daher werden die Ermittler eine empirische Datenerhebungsstudie in zwei verschiedenen Städten in Kenia durchführen, die eine breite Palette von sozioökonomischen, verhaltensbezogenen, räumlichen, Kindergesundheits-, zoonotischen Vektorgesundheits-, Umweltverschmutzungs-, Verhaltens- und Klimadaten in Stadtteilen sammelt, die hoch und niedrig infektiös sind Krankheitsübertragungspotential. Dieses Protokoll beschreibt speziell das Studiendesign, das angewendet wird, um Gesundheits- und Expositionsdaten von Säuglingen nach Studiengruppe vor der weiteren Modellentwicklung zu sammeln, zusammenzufassen und zu melden. Ziel der epidemiologischen Studie ist es, nach Stadt (Nairobi, Kisumu) und Nachbarschaft sozioökonomisches Entwicklungsniveau (niedriges versus mittleres Einkommen) zu bewerten:

1. Unterschiede in der Prävalenz des Nachweises enterischer Pathogene im Säuglingskot, Durchfall und andere Gesundheitssymptome, Wachstumsverzögerung und Auszehrung, Umfang der mittleren Oberarme und Frühgeburtenstatus
2. Unterschiede in Expositionsverhalten, Umweltkontamination und Nachweis von Darmpathogenen im Kot von Haustieren, die Säuglinge Darmpathogenen aussetzen könnten

METHODEN

Studiendesign. Die PATHOME-Studie ist eine prospektive 14-tägige Kohortenstudie mit vier Gruppen. Zu den Gruppen gehören jeweils ein Viertel mit niedrigem und mittlerem Einkommen in den Städten Kisumu und Nairobi. Altersberechtigte Säuglingsteilnehmer und ihre Betreuer, die im Einzugsgebiet eines teilnehmenden Community Health Volunteers leben, werden durch zufällige Auswahl einer Überwachungsdatenbank identifiziert, die durch monatliche Aktualisierungen von CHVs über altersberechtigte Säuglinge, die in ihrem Einzugsgebiet leben, gepflegt werden. Bei einer Stichprobengröße von 248 Säuglingen und ihren Betreuern entspricht dies 124 Teilnehmern in Nairobi (62 mit niedrigem Einkommen, 62 mit mittlerem Einkommen) und denselben in Kisumu. Um eine ausgewogene Altersrepräsentation zu gewährleisten, wird die Auswahl der Säuglinge aus der Datenbank für die Aufnahme in die Studie durch Identifizierung einer geraden Anzahl von Säuglingen in den Altersgruppen von 0 bis 3, 4 bis 6, 7 bis 9 und 10-12 Monaten durchgeführt Alter. Nach Abschluss der Einverständniserklärung wird das Studienteam einen Zeitpunkt für den Beginn der Datenerhebung festlegen. Voraussetzung für die Einschreibung ist die Beschaffung einer Kotprobe von Einschreibungskindern. Nach der Registrierung wird das Team Säuglinge und Betreuer vierzehn Tage lang nachverfolgen, um die Datenerfassung wie unten beschrieben abzuschließen. Um Verzerrungen durch saisonale Effekte bei beobachteten Darmerkrankungen zu begrenzen, wird die Registrierung in jeder Stadt 12 aufeinanderfolgende Monate umfassen, zuerst in Nairobi (21. Nov. - 22. Nov.), gefolgt von Kisumu (23. Jan. - 23. Dez.). Die Ermittler werden drei Haushalte pro Woche rekrutieren, mit einer einwöchigen Pause bei der Registrierung jede fünfte Woche, wenn Kontaminationsbewertungen für öffentliche Bereiche durchgeführt werden. Dieser fünfwöchige Zyklus wird systematisch bis zu 11 Mal wiederholt oder bis die Anforderungen an die Stichprobengröße erfüllt sind.

Zeitachse der Datenerhebung

Am Tag der Einschreibung (Tag 1) wird die Säuglingspflegekraft gebeten, an einer 45-minütigen Umfrage zu ihren sozioökonomischen Bedingungen, Hygienepraktiken und der Gesundheit des Säuglings teilzunehmen. Dann erhält sie ein 14-tägiges Bildtagebuch und wird gebeten, Tage in den nächsten zwei Wochen zu markieren, an denen das Kind Durchfallsymptome hat. Schließlich erhält sie eine Packung Windeln, die nach dem Gewicht des Säuglings bemessen sind, und wird gebeten, sie für die nächste Woche bei dem Säugling zu verwenden, wobei alle Windeln mit Säuglingskot aufbewahrt werden. Das Team wird eine Zeit für die Rückkehr am nächsten Tag vereinbaren, um die Windel mit Kot zu holen und die nächste Phase der Expositionsbewertung der Datenerfassung durchzuführen.

Am zweiten Tag kehren die Zähler mittags zurück und verbringen etwa fünf Stunden mit den Betreuern und den Säuglingen. Zuerst sammeln Zähler die Windel mit einer Säuglingsstuhlprobe, die als Kotprobe bei der Registrierung oder vor der Exposition angesehen wird. Dann legen die Zähler den Säuglingen ein Geotracking-Fußkettchen an und bestätigen den bequemen Sitz. Geotracker werden auch an zwei Haustieren des Haushalts angebracht (separate IACUC-Zulassung für Tierversuche). Zweitens sammeln sie sonst die Windel mit Stuhlgang während der Beobachtung. Drittens stellen sie der Pflegeperson ein neues steriles Kinderspielzeug wie einen Beißring oder eine Rassel zur Verfügung, die sie dem Säugling zum Spielen geben kann. Viertens beginnen Zähler mit einer fünfstündigen Phase der strukturierten Beobachtung des Säuglings und notieren alle Personen oder Dinge, mit denen der Säugling interagiert, sowie alle Orte, an denen der Säugling Zeit verbringt. Am Ende des Besuchs nehmen die Zähler eine Handspülung der primären Bezugsperson und eine Bodenprobe und bitten die Bezugsperson, die Windeln weiterhin zum Sammeln von Säuglingsstuhl zu verwenden. Schließlich wird eine Zeit für die Rückkehr am nächsten Tag festgelegt, um das Geotracking-Gerät, alle Stuhlproben und das Spielzeug abzuholen und eine weitere fünfstündige Beobachtung durchzuführen. Die Stuhl- und Umweltproben werden zur Verarbeitung für mikrobielle Assays ins Labor transportiert. Die Geotracker bleiben über Nacht an Ort und Stelle. Wenn die Pflegekraft sie jedoch zum Schlafen vom Säugling entfernen möchte, wird sie gebeten, das Gerät neben, aber außerhalb der Reichweite des Säuglings zu platzieren und das Gerät dann zu ersetzen, wenn der Säugling aufwacht.

An Tag 3 kehren die Zähler früh morgens zurück, entnehmen eine zweite Kotprobe und führen einen zweiten fünfstündigen Block strukturierter Beobachtung durch. Am Ende der Beobachtung rufen sie den Geotracker des Säuglings (und der Haustiere) ab und bestätigen, dass der Durchfallkalender auf dem neuesten Stand ist. Das Kinderspielzeug wird herausgenommen und in einem sterilen Beutel auf Eispackungen in eine Kühlbox gelegt, um es zusammen mit der Kotprobe für mikrobielle Tests ins Labor zu transportieren. Ein neues Ersatzspielzeug für die ständige Aufbewahrung der Bezugsperson wird bereitgestellt. Die Größe und das Gewicht des Säuglings werden aufgezeichnet. Vor der Abreise werden die Zähler die Pflegekräfte daran erinnern, weiterhin Säuglingskot zu sammeln und einen weiteren Besuch in etwa 48 Stunden zu vereinbaren, um eine dritte Kotprobe zu entnehmen.

Am Tag 5 kehren die Zähler zurück, um die dritte Windel mit Fäkalien zu holen, den Durchfallkalender auf Vollständigkeit zu überprüfen und die Pflegekraft zu ermutigen, weiterhin Windeln zum Sammeln von Säuglingsstuhl zu verwenden.

Am Tag 8 kehren die Zähler zurück, um die vierte Windel mit Fäkalien zu holen und den Durchfallkalender auf Vollständigkeit zu überprüfen.

Am Tag 14 kehren die Zähler zurück, um die fünfte Windel mit Fäkalien und den 14-Tage-Durchfallkalender zu holen.

Datenerhebungsmethoden

1. Umfragen. Eine vorab getestete Umfrage mit 76 Fragen dokumentiert Vermögens-, Einkommens- und Infrastrukturentwicklungsindikatoren der Haushalte, Demografie der Bewohner, Bildung und Beruf der Mutter, Haltung und Haltung von Haustieren, Arten von Pflegekräften, Pflegeverhalten, Säuglingsstillen und Nahrungsergänzung, Impfung und kürzlich aufgetretene Krankheitssymptome und entsprechende Inanspruchnahme der Gesundheitsversorgung, einschließlich der Verwendung von Antibiotika für teilnehmende Säuglinge und andere Haushaltsbewohner.
2. Entnahme und Analyse von Kotproben von Säuglingen und Zoonosen. Während der Studie werden bis zu 1.240 Säuglingskotproben (248 Säuglinge * fünf aufeinanderfolgende Kotproben) und 496 Tierkotproben (248 Haushalte * 2 Tierkotproben pro Haushalt) gesammelt. Windeln werden verwendet, um Kotproben von Säuglingen zu sammeln, um den Kot vor Kontamination durch Erde (z. aus dem Boden geschöpft) oder Töpfchen, die von mehreren Kindern benutzt werden. Tierkot wird von seinem Standort in sterilen WhirlPak-Beuteln gesammelt, wobei darauf zu achten ist, Kot aus der Mitte des Haufens zu sammeln, um eine Kontamination durch Erde zu vermeiden. Eine 1-Gramm-Portion wird mit der gleichen Menge Cary-Blair-Konservierungsmedien gevortext und in einem Ultratiefkühlschrank im African Population and Health Research Center für die zukünftige Isolierung von Krankheitserregern gelagert. In einer Biosicherheitswerkbank wird eine 300-mg-Portion jeder Säuglings- oder Tierkotprobe aus der Windel in einen Zymo Shield-Konservierungsbehälter mit Keramikperlen für die Zelllyse geschöpft. Die Röhrchen werden zwei Minuten lang gevortext und dann in einem Ultratiefkühlschrank eingefroren. DNA und RNA werden parallel mit dem Miniprep-Kit von Zymobiomics extrahiert und bis zur Verwendung in einem Ultratiefkühlschrank gelagert. Eine extrinsische Negativkontrolle wird jeden Tag der Stuhlverarbeitung der Umgebung des Biosicherheitsschranks ausgesetzt, um mögliche Hintergrundkontaminationsprobleme zu überwachen, die die Ergebnisse beeinflussen könnten. DNA und RNA werden auf einer TaqMan Array-Karte analysiert, die Primer und Sonden für eine Reihe enterischer Pathogene enthält, einschließlich, aber nicht beschränkt auf Norovirus GI und GII, Adenovirus 40/41, SARS-Cov2, Rotavirus, Salmonella enterica, Shigella spp., Campylobacter jejuni/coli, Listeria monocytogenes, Clostridium difficile, enterotoxigene Escherichia coli (ETEC) LT/ST, enteropathogene Escherichia coli (EPEC), enteroaggregative Escherichia coli (EAEC) und Shiga-ähnliches Toxin produzierende E. coli (STEC) stx1/ stx2 einschließlich E. coli O157. Der Schwellenwert des qRT-PCR-Zyklus wird verwendet, um den positiven oder negativen Status des Kots zu bestimmen.
3. Sammlung und Analyse von Umweltproben. Boden (992 Haushalte, 160 Nachbarschaft), Hände (248), Spielzeug (~372) und Oberflächenwasser (80) werden steril gesammelt und auf Eisbeuteln in Kühlern zum APHRC-Labor transportiert. Quantitative Daten zur mikrobiellen Kontamination werden durch Messen von drei zehnfachen seriellen Verdünnungen jedes Probenvolumens in gepuffertem Peptonwasser zur Voranreicherung über Nacht bei 37–41 °C erhalten. Ein Teil dieser primären Anreicherung wird in selektive sekundäre Anreicherungsmedien zur Isolierung von Salmonella und Shigella spp., Listeria monocytogenes, Campylobacter jejuni und Escherichia coli überführt. Selektive Medien werden einer fünfstündigen Inkubation bei 37 bis 41 °C unterzogen, mit Ausnahme von Campylobacter-Medien, gefolgt vom Ausplattieren von Aliquots auf Differenzial- und Selektivmedien. Die Inkubation von C. jejuni/coli erfolgt in anaeroben Kammern. Die Identität jedes mutmaßlichen Darmbakterien-Phänotyps wird durch Polymerase-Kettenreaktionsassays für Genindikatoren für die pathogenspezifische Identität isolierter Kolonien verifiziert. Die Kolonien werden auch als Glycerolvorräte für eine spätere erneute Isolierung und Analyse aufbewahrt. Die Konzentration mutmaßlicher mikrobieller Arten wird unter Verwendung der Methode der wahrscheinlichsten Zahl und der Erkennungsmuster über die drei getesteten Volumina der Umweltprobe hinweg bestimmt. Die Ergebnisse werden als Anzahl der validierten bakteriellen Pathogene pro Gramm/Milliliter/Hände/Spielzeug angegeben.
4. Erhebung und Analyse von Verhaltensdaten. Quantitative Verhaltensdaten zu Interaktionen von Säuglingen mit Betreuern, anderen Menschen, Haustieren und Umweltkeimen im Haushalt und in der Nachbarschaft werden durch strukturierte Beobachtung mit einem vorgetesteten Tablet-basierten Tool gemessen. Individuelle Verhaltensweisen werden als mittlere oder mittlere Häufigkeit pro Stunde zusammengefasst.
5. Erhebung und Analyse von Geotracking-Daten. Wo Säuglinge Umweltkeimen und anderen Menschen ausgesetzt sein können und wie lange sie sich in öffentlichen und privaten Bereichen aufhalten, wird gemessen, indem gemäß einem vorab getesteten Protokoll ein tragbarer, leichter Geotracker für 24 Stunden an ihrem Knöchel oder ihrer Taille angebracht wird . Der Geotracker umfasst sowohl GPS- als auch mobile Datenfunktionen, die Datum, Uhrzeit und Standort in Fünf-Minuten-Intervallen auf einen Server hochladen. Diese Daten werden in Bezug auf Arten von Orten, an denen eine Exposition auftreten kann, Zeitdauer nach Ort und in anonymisierten Karten zusammengefasst, die Reiseverläufe zeigen.
6. Sammlung und Analyse von 14-tägigem Durchfall. Betreuer markieren Tage, an denen ihr Kind Durchfall hat, in einem 14-tägigen Bildkalender. Dies wird als Gesamtanteil der Säuglinge, die in einem Zeitraum von 14 Tagen an Durchfall leiden, sowie als Anzahl der aufeinanderfolgenden Tage mit Symptomen zusammengefasst.
7. Erhebung und Analyse anthropometrischer Daten. Das Gewicht des Säuglings wird gemessen, indem die Differenz zwischen dem Gewicht der Pflegekraft plus dem Säugling und dem Gewicht der Pflegekraft allein auf einer digitalen Waage subtrahiert wird. Die Säuglingslänge wird anhand von Längentafeln gemäß den Standardrichtlinien der WHO gemessen.

ANMELDUNG UND SICHERHEIT DER TEILNEHMER

Teilnehmerregistrierung. Geeignete Säuglinge werden durch vierteljährliche Überwachungsberichte von Community Health Volunteers (CHV), die Mitarbeiter des kenianischen Gesundheitsministeriums (MOH) in Kenia sind, über Alter und Aufenthaltsort von Säuglingen, die in ihrem demografischen Überwachungsgebiet leben, identifiziert und rekrutiert. Dieses Gebiet entspricht typischerweise einem Dorf innerhalb der Nachbarschaft. Gemäß ihrer Standardpraxis wenden sie sich an alle Haushalte mit schwangeren Frauen oder kleinen Kindern, um sicherzustellen, dass sie Gesundheitsinformationen erhalten und Unterstützung beim Zugang zur Gesundheitsversorgung erhalten. Wenn CHVs solche Haushalte identifizieren, registrieren sie sie in einer Liste, die dem Community Health Extension Worker, einer formellen Krankenschwester, die mit der Gesundheitsversorgung eines größeren Einzugsgebiets beauftragt ist, zur Verfügung gestellt wird. Das African Population Health and Research Center (APHRC) wird mit CHVs in den ausgewählten Stadtteilen von Kisumu und Nairobi zusammenarbeiten, um diese Aufzeichnungen monatlich zu überwachen und Informationen über altersberechtigte Kinder zu aktualisieren. Dies ist notwendig, da Migration innerhalb und in/aus diesen Nachbarschaften üblich ist.

Das APHRC-Forschungsteam erstellt zwei separate Listen für die Stadtteile mit niedrigem und mittlerem Einkommen einer Stadt und wählt jeden Monat zufällig 6 Kinder aus jeder Liste aus, was ein bis zwei Kleinkindern pro Altersgruppe (0-3 Monate, 4-6 Jahre) entspricht Monate, 7-9 Monate, 10-12 Monate). CHVs und das APHRC-Team wenden sich dann an Haushalte mit Betreuern berechtigter Kinder, um deren Alter anhand des Personalausweises zu überprüfen und festzustellen, ob sie an einer Teilnahme interessiert sind. Der erwachsene Proband/die primäre Bezugsperson wird über die Studienaktivitäten informiert, einschließlich einer Einschreibungsumfrage, Probenahmen aus der Umgebung des Haushalts, Geotracking von Säuglingen und der Verwendung einer strukturierten Beobachtung ihrer Interaktionen mit dem Säugling. Das Team wird am nächsten Tag zurückkehren, um die Zustimmung der primären Bezugsperson eines Kindes zur Teilnahme an der Studie einzuholen, indem es der Bezugsperson in Anwesenheit ihres CHV als Zeuge Formulare auf Englisch oder Suaheli vorliest, wenn sie nicht fließend Englisch sprechen. Einwilligungsformulare werden von der Pflegekraft mit Unterschrift oder Daumenabdruck und von ihrem CHV-Zeugen unterzeichnet. Eine Kopie des Einwilligungsformulars wird für die dauerhaften Aufzeichnungen der Pflegekraft zur Verfügung gestellt. Wenn die Zustimmung erteilt wird, wird ein Gegenbesuch geplant, um die Registrierungsumfrage, die strukturierte Beobachtung und die Probenahme durchzuführen. Wenn keine Einwilligung erteilt wird, wählt das Team ein neues potenzielles Kind im gleichen Alter aus der Liste aus.

Teilnehmersicherheit. Die primären Risiken im Zusammenhang mit der Teilnahme an der Studie sind Unbehagen des Säuglings beim Tragen des Geotrackers oder während der Längenmessung. Um die Risiken für Säuglingsbeschwerden während Geotracking oder Anthropometrie zu mindern, werden klare Standardarbeitsanweisungen (SOPs) und Aufsichtsmechanismen befolgt, um die konsequente Anwendung guter Technik und das Recht der Studienteilnehmer sicherzustellen, Geotracking oder Anthropometrie-Datenerfassung ohne Strafe zu beenden . Speziell für das Geotracking umfasst das Protokoll einen von der Pflegekraft geleiteten Prozess zur Auswahl, wo und wie der Tracker am Säugling angebracht werden soll, und eine klare Anweisung, das Gerät zu entfernen, wenn das Kind Anzeichen von Stress im Zusammenhang mit dem Tragen zeigt. Betreuer werden gebeten, das Gerät, wenn es entfernt wird, an sich selbst oder in der Nähe, aber außerhalb der Reichweite des Säuglings anzubringen.

Betreuer fühlen sich möglicherweise unwohl bei der Beantwortung sensibler Fragen zu ihren Hygienepraktiken während der Datenerfassung oder sind besorgt über soziale Wahrnehmungen oder Konflikte im Zusammenhang mit anderen, die wissen, dass sie an einer Forschungsstudie teilnehmen. Der Verlust der Privatsphäre kann zu sozialen oder familiären Konflikten führen. Dies stellt jedoch ein minimales Risiko für die Probanden dar. Die SARS-CoV-2-Pandemie kann im Verlauf dieser Studie Monate oder Jahre andauern, und die Probanden sind möglicherweise besorgt darüber, dass das Studienpersonal das Virus an ihre Familie weitergibt. Die Privatsphäre der Probanden wird geschützt, indem (1) Daten immer an einem privaten Ort gesammelt werden, an dem keine anderen Erwachsenen oder älteren Kinder anwesend sind, die die Antworten der Probanden belauschen könnten, (2) alle Papier- und elektronischen Formulare, die ihre Informationen enthalten, durch das Sammeln sicher verwaltet und gespeichert werden Daten auf passwortgeschützten Tablets und Beschränkung des Zugangs zu identifizierbaren Daten auf eine begrenzte Anzahl qualifizierter Personen, (3) Vernichtung aller Formulare mit individuellen Identifizierungsinformationen nach fünf Jahren, (4) Schulung aller Mitarbeiter in ethischen Praktiken für die Erforschung und Herstellung von Menschen die Konsequenzen für die Verletzung dieser Praktiken deutlich machen und (5) den Probanden darüber informieren, dass es ihm freisteht, die Studie jederzeit zu verlassen oder sich zu weigern, Fragen zu beantworten, die ihm unangenehm sind.

Bei Säuglingen kann es während des Einschreibungszeitraums zu Durchfallerkrankungen kommen. Für den Fall, dass ein CHV oder ein Teammitglied das Haus besucht und das Kind in Not beobachtet oder dass Betreuer telefonisch oder persönlich melden, dass das Kind in Not ist, werden sie angewiesen, Betreuer an örtliche Gesundheitszentren zu verweisen und zu melden das unerwünschte Ereignis an das klinische Forschungsteam von APHRC und der University of Iowa. Leiden können Durchfall, schwere Unterernährung oder andere Symptome sein. Ziel wird es sein, sicherzustellen, dass CHVs weiterhin die Standardversorgung anbieten. Das klinische Forschungspersonal wird sich dann rechtzeitig mit den Pflegekräften in Verbindung setzen, um weitere medizinische Beratung anzubieten. Alle beobachteten oder gemeldeten Kinderkrankheiten werden vom APHRC-Team dokumentiert und im Rahmen von zweimonatlichen Telefonkonferenzen mit dem gesamten Team besprochen.

Falls ein unerwünschtes Ereignis beobachtet wird, das eher mit der Studie als mit einer zufälligen Erkrankung in Verbindung zu stehen scheint, benachrichtigt das APHRC-Team unverzüglich den PI von APHRC, der das APHRC-IRB-Komitee und die Studienleiterin Kelly K. Baker benachrichtigt. Die Aufnahme des Probanden in die Studie wird mit seiner Überweisung an einen geeigneten klinischen Anbieter zur Langzeitüberwachung beendet. PI Baker wird unverzüglich das IRB-Komitee der University of Iowa benachrichtigen und weitere Ratschläge für eine angemessene Reaktion einholen. Stuhlproben werden mit Windeln gesammelt, die der Mutter zum Tragen durch das Kind zur Verfügung gestellt werden. Es werden keine Rektalabstriche durchgeführt und keine medizinische Behandlung durchgeführt. Es werden keine anderen biologischen Proben gesammelt.

Die Ermittler werden das Risiko einer Übertragung von Covid-19 minimieren, indem sie das Personal regelmäßig und streng auf Symptome untersuchen, bevor sie sich mit der Gemeinschaft befassen, und gegebenenfalls testen, wodurch die Anzahl der Mitarbeiter begrenzt wird, die eng mit den Teilnehmern interagieren, Masken und/oder Gesichtsschutz und anderes erfordern Hygiene-PSA während der Datenerhebung, soziale Distanzierung von 2 Metern während der Datenerhebung, Sterilisierung aller Materialien, die in den und aus dem Haushalt des Probanden gebracht werden, und Bereitstellung von Masken für Probanden für Umfragen, wenn sie keinen eigenen haben.

VERTRAULICHKEIT UND DATENVERWALTUNG

Vertraulichkeit. Die Daten werden vertraulich behandelt, um den Verlust der Privatsphäre zu vermeiden. Alle für dieses Projekt eingestellten Mitarbeiter müssen an einem fünftägigen Intensivschulungskurs teilnehmen, der eine Schulung in ethischen Praktiken für die Durchführung von Forschungen an menschlichen Themen umfasst. Jede Verletzung der Vertraulichkeit eines Subjekts führt zur sofortigen Kündigung und möglichen weiteren Konsequenzen. Von Außendienstmitarbeitern gesammelte Papierformulare werden am Ende jedes Datenerfassungstages sofort den Vorgesetzten vorgelegt und bis zum Transport zu APHRC in einem verschlossenen Schrank in einem sicheren Büro im Landbüro aufbewahrt. Gedruckte Formulare werden dann bis zu fünf Jahre in einem verschlossenen Schrank in einem verschlossenen Büro bei APHRC aufbewahrt, danach werden sie vernichtet. Elektronische Dateien werden in einer verschlüsselten und passwortgeschützten Datenbank auf einem sicheren Server bei APHRC und der University of Iowa gespeichert. Nur die Hauptforscher und zugelassenen Mitglieder des Forschungsteams haben Zugriff auf Informationen, die mit Subjektidentifikatoren verknüpft sind. Die Informationen werden in einer verschlüsselten (gemäß den vorgeschriebenen IT-Sicherheitsstandards) passwortgeschützten Datenbank gespeichert und enthalten Subjektidentifikatoren wie Name, Adresse, Geburtsdatum und Krankenaktennummern. Diese Informationen sind notwendig, um den Kontakt zu den Probanden während des gesamten Studienjahres aufrechtzuerhalten. Nur der Hauptforscher und die Mitglieder des Forschungsteams, die die Probanden kontaktieren, haben Zugriff auf Informationen, die mit Probandenidentifikatoren verknüpft sind.

Datenmanagement. Aufzeichnungen in Papierform/Papier (gedruckte Umfragen, Fragebögen, Fallberichtsformulare, Bilder usw.) – Ein Datenbankmanager beim APHRC druckt regelmäßig Listen geeigneter Säuglinge und Kontaktinformationen für Rekrutierungszwecke und zur Nachverfolgung während der 14 Tage aus Zeitraum, in dem Fächer eingeschrieben sind. Diese wird von APHRC-Betreuern aufbewahrt, bis die Studie abgeschlossen ist, und dann durch Schreddern vernichtet. Einwilligungsformulare werden auf Papierformularen gesammelt und in verschlossenen Aktenschränken in verschlossenen Büros im APHRC aufbewahrt. Ebenso werden die 14-Tage-Diarrhoe-Kalender nur durch die zufällige Haushalts-ID identifiziert, aber dennoch nach der Abholung in einem verschlossenen Büro bei APHRC aufbewahrt.

Elektronische Aufzeichnungen (Computerdateien, elektronische Datenbanken usw.) – Daten werden mit mobiler Technologie unter Verwendung von ODK-Software auf passwortgeschützten Tablets erfasst. Diese Tafeln werden jeden Morgen von den Vorgesetzten an die Zähler ausgegeben und jeden Abend wieder abgeholt. Daten von Tablets werden vom APHRC-Supervisor über das Internet oder Mobilfunkdaten auf einen HIPPA-konformen APHRC-Shared-Server hochgeladen und dann vom Tablet gelöscht, um zu verhindern, dass private Informationen zu Personen auf einem im Feld verwendeten Gerät angesammelt werden. Elektronische Aufzeichnungen mit identifizierbaren Informationen, die auf dem Server gespeichert sind, sind nur für das UI- und APHRC-Führungsteam zugänglich. PHI müssen aus allen Daten entfernt werden, die von anderen Personen verwendet werden und die auf privaten Laptops oder Computern gespeichert werden sollen. Datenqualitätsprüfungen werden in die Datenerfassungssoftware eingebaut, um sicherzustellen, dass keine fehlenden Informationen oder unplausible Werte akzeptiert werden. Sobald alle abgeschlossenen Interviews auf jedem Tablet vom Feldteamleiter validiert und zur Synchronisierung freigegeben wurden, überträgt jeder Datenerfasser die Daten in seinem Tablet über eine Internetverbindung an einen zentralen Server. Dadurch wird sichergestellt, dass die Daten danach nicht manipuliert werden und die Möglichkeit von Datenverlusten im Verlauf der Datenerfassung, die durch menschliches Versagen oder Geräteausfall oder -verlust entstehen können, minimiert wird. Synchronisierte Daten, sobald sie auf dem Server sind, werden weiter auf Inkonsistenzen überprüft, indem täglich Datenqualitätsskripts ausgeführt werden, die alle Fehlerberichte zur sofortigen Weitergabe an die Außendienstteams zur weiteren Überprüfung und Korrektur generieren, wenn dies erforderlich sein kann, während die Außendienstteams noch an der Studie arbeiten Bereiche, in denen Daten mit Fehlern notiert wurden. Nach Abschluss der Felddatenerfassung werden die Daten verifiziert, validiert und gründlich bereinigt. Alle Daten werden (über eine Internetverbindung) auf einem sicheren physischen Server mit Standardverfahren für Zugriff, Sicherheit und Datensicherung gespeichert.

Zu den Sicherheitsfunktionen gehört der Fernzugriff, der über Passwörter und nur von registrierten Computern aus erfolgt. Alle gespeicherten Daten werden zusammen mit der verschlüsselten Datenübertragung mit SSL-Transportschichtverschlüsselung verschlüsselt, um die Übertragung von Datenpaketen zu sichern, die inkrementell auf einen dedizierten Mobile Dispatch Server (MDS) hochgeladen werden.

Biologische Proben – Wenn Stuhlproben in Haushalten gesammelt werden, werden sie nur mit einer zufällig ausgewählten Barcode-ID gekennzeichnet, die durch Scannen des Barcodes in eine Tablet-basierte Datei, die mit den identifizierenden Informationen des Probanden verknüpft ist, mit einzelnen Haushalten verknüpft wird. Von diesem Zeitpunkt an behalten die Stuhlproben die zufällige ID von der Verarbeitung im APHRC-Labor bis zur molekularen Analyse im UI-Labor. Labortechniker werden gegenüber der Subjektidentität geblendet. Die endgültigen Ergebnisse der Stuhlanalyse für jede zufällige ID werden vom UI-Labor an den Datenbankmanager gesendet, der sie in der letzten Phase nach zufälliger ID in den Gesamtdatensatz einfügt, der identifizierbare Informationen enthält. Somit werden biologische Proben in allen Phasen identifiziert, mit Ausnahme der Entnahmestelle und der Analysestelle.

FINANZIERUNG Die PATHOME-Studie wird von den US-amerikanischen National Institutes of Health Fogarty Institute R01TW011795 an die University of Iowa, PIs Kelly K. Baker und Daniel Sewell finanziert. Es wurde von Prüfgremien für Humansubjekte an der University of Iowa, dem African Population and Health Research Center, AMREF und NACOSTI genehmigt.