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Medicina de precisión de enfermedades infecciosas pediátricas mediante la evaluación de secuenciación del LCR (PIPSEC)

6 de noviembre de 2020 actualizado por: IDbyDNA, Inc.

Un ensayo prospectivo para investigar la utilidad clínica y la aplicación de una prueba de secuenciación de próxima generación para la detección de patógenos en muestras de líquido cefalorraquídeo (LCR) para diagnosticar infecciones pediátricas del sistema nervioso central (SNC)

Estudio prospectivo, multisitio, para evaluar la tasa de diagnóstico de la secuenciación de ADN y ARN del líquido cefalorraquídeo para la identificación de patógenos directamente en pacientes que ya se han sometido a una punción lumbar para evaluar si hay infección y se encontró que tenían pleocitosis. La tasa de diagnóstico y la utilidad clínica de las pruebas estándar concurrentes se compararán con la tasa de diagnóstico y la utilidad clínica de la secuenciación de ADN y ARN.

Descripción general del estudio

Estado

Terminado

Condiciones

Descripción detallada

IDbyDNA, Inc. ha desarrollado una sólida base de datos de referencia de secuenciación para virus, bacterias, hongos y parásitos y ha desarrollado métodos de análisis novedosos para analizar datos de secuenciación de próxima generación (NGS) para identificar rápidamente agentes infecciosos. Este conjunto de tecnología, conocido como la plataforma Explify™, promete mejorar la atención al paciente y guiar de manera eficiente la planificación del tratamiento del proveedor para quienes padecen enfermedades infecciosas.

El ensayo PIPSEC, desarrollado por médicos pediatras que se especializan en medicina genómica, tiene como objetivo facilitar la adquisición de bioespecímenes clínicamente anotados y de alta calidad con el propósito de descubrimiento de investigación. Este proyecto pretende avanzar en la metagenómica, la genética microbiana, la bioinformática y el análisis de datos para la detección de patógenos utilizando muestras de líquido cefalorraquídeo (LCR) para contribuir al diagnóstico de agentes infecciosos que afectan el sistema nervioso central entre los pacientes pediátricos. Los especímenes anotados clínicamente facilitarán el desarrollo y la validación continuos de la prueba Explify y su utilidad clínica para los proveedores que tratan infecciones del sistema nervioso central (SNC).

El objetivo principal es evaluar la utilidad clínica de la prueba Explify en comparación con las pruebas estándar de atención concurrentes para identificar patógenos del líquido cefalorraquídeo en una población de pacientes pediátricos.

Tipo de estudio

De observación

Inscripción (Actual)

71

Contactos y Ubicaciones

Esta sección proporciona los datos de contacto de quienes realizan el estudio e información sobre dónde se lleva a cabo este estudio.

Ubicaciones de estudio

    • California
      • Orange, California, Estados Unidos, 92868
        • CHOC Children's Hospital Orange County
      • San Diego, California, Estados Unidos, 92123
        • Rady Children's Hospital
    • Florida
      • Miami, Florida, Estados Unidos, 33155
        • Nicklaus Children's Hospital

Criterios de participación

Los investigadores buscan personas que se ajusten a una determinada descripción, denominada criterio de elegibilidad. Algunos ejemplos de estos criterios son el estado de salud general de una persona o tratamientos previos.

Criterio de elegibilidad

Edades elegibles para estudiar

1 segundo a 17 años (Niño)

Acepta Voluntarios Saludables

No

Géneros elegibles para el estudio

Todos

Método de muestreo

Muestra de probabilidad

Población de estudio

Este proyecto inscribirá a niños que se someten a una evaluación de infección del sistema nervioso central (SNC) y ya se han sometido a una punción lumbar para obtener líquido cefalorraquídeo (LCR) para evaluar la infección y la respuesta inmunitaria del huésped. Como tal, los pacientes inscritos se someterán a una evaluación por sospecha de meningitis, encefalitis, ventriculitis e infección de la derivación VP.

Los pacientes a los que les quede LCR después de que se hayan obtenido las pruebas estándar y que cumplan con los demás criterios de inclusión serán abordados para la inscripción en el estudio.

Descripción

Criterios de inclusión:

  • Edad 0-17 años de edad (todavía no 18)
  • Evaluación clínica para infección del SNC
  • Recuento de glóbulos blancos (WBC) en LCR > 15 células/µL cuando hay menos de 5000 RBC en el mismo
  • Admitido en un centro de estudio participante
  • LCR obtenido por protocolo estándar
  • 1 ml de LCR adecuadamente almacenado está disponible después de completar todas las pruebas estándar de atención

Criterio de exclusión:

  • LCR Recuento de glóbulos rojos (RBC) > 5000 células/µL en la misma muestra de LCR que con pleocitosis
  • No se puede obtener el consentimiento

Plan de estudios

Esta sección proporciona detalles del plan de estudio, incluido cómo está diseñado el estudio y qué mide el estudio.

¿Cómo está diseñado el estudio?

Detalles de diseño

¿Qué mide el estudio?

Medidas de resultado primarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Tasa de diagnóstico
Periodo de tiempo: 24 meses
Comparación de la sensibilidad, la especificidad, los valores predictivos positivos y negativos de los resultados de IDbyDNA NGS con la plataforma de diagnóstico Explify en comparación con la atención estándar.
24 meses

Medidas de resultado secundarias

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Utilización Clínica
Periodo de tiempo: 24 meses

Cambio de manejo resultante del diagnóstico de NGS versus diagnóstico basado en el estándar de atención. El cambio de administración es un binario (sí o no) basado en las asignaciones realizadas por el PI o la persona designada en cada sitio utilizando los siguientes dominios:

  • Diagnóstico tratamiento farmacológico específico
  • Manejo específico del diagnóstico
  • Intervenciones de apoyo específicas para el diagnóstico Un cambio en cualquiera de estos dominios se considerará un cambio de manejo clínico para propósitos de utilización.
24 meses

Otras medidas de resultado

Medida de resultado
Medida Descripción
Periodo de tiempo
Análisis Post-Hoc - Evaluación Económica (1)
Periodo de tiempo: 24 meses

Evaluación económica del costo de las pruebas estándar de atención en comparación con el costo económico de las pruebas NGS:

Determinación de qué diagnóstico realizado podría haberse realizado con las mejores pruebas clínicas disponibles actualmente.

24 meses
Análisis Post-Hoc - Evaluación Económica (2)
Periodo de tiempo: 24 meses
Análisis de costos de lo que habría costado la mejor prueba disponible.
24 meses
Análisis post-hoc - Respuesta del anfitrión
Periodo de tiempo: 24 meses
Secuenciación de ARN para determinar si existe una respuesta específica del huésped a etiologías infecciosas o no infecciosas específicas.
24 meses

Colaboradores e Investigadores

Aquí es donde encontrará personas y organizaciones involucradas en este estudio.

Publicaciones y enlaces útiles

La persona responsable de ingresar información sobre el estudio proporciona voluntariamente estas publicaciones. Estos pueden ser sobre cualquier cosa relacionada con el estudio.

Enlaces Útiles

Fechas de registro del estudio

Estas fechas rastrean el progreso del registro del estudio y los envíos de resultados resumidos a ClinicalTrials.gov. Los registros del estudio y los resultados informados son revisados ​​por la Biblioteca Nacional de Medicina (NLM) para asegurarse de que cumplan con los estándares de control de calidad específicos antes de publicarlos en el sitio web público.

Fechas importantes del estudio

Inicio del estudio (Actual)

22 de enero de 2019

Finalización primaria (Actual)

7 de octubre de 2020

Finalización del estudio (Actual)

7 de octubre de 2020

Fechas de registro del estudio

Enviado por primera vez

19 de diciembre de 2018

Primero enviado que cumplió con los criterios de control de calidad

3 de enero de 2019

Publicado por primera vez (Actual)

8 de enero de 2019

Actualizaciones de registros de estudio

Última actualización publicada (Actual)

10 de noviembre de 2020

Última actualización enviada que cumplió con los criterios de control de calidad

6 de noviembre de 2020

Última verificación

1 de noviembre de 2020

Más información

Términos relacionados con este estudio

Palabras clave

Otros números de identificación del estudio

  • PIPSEC - 01

Plan de datos de participantes individuales (IPD)

¿Planea compartir datos de participantes individuales (IPD)?

INDECISO

Información sobre medicamentos y dispositivos, documentos del estudio

Estudia un producto farmacéutico regulado por la FDA de EE. UU.

No

Estudia un producto de dispositivo regulado por la FDA de EE. UU.

No

Esta información se obtuvo directamente del sitio web clinicaltrials.gov sin cambios. Si tiene alguna solicitud para cambiar, eliminar o actualizar los detalles de su estudio, comuníquese con register@clinicaltrials.gov. Tan pronto como se implemente un cambio en clinicaltrials.gov, también se actualizará automáticamente en nuestro sitio web. .

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