EUpertstrain 4 -tutkimus Bordetella Pertussis -isolaateista
torstai 22. kesäkuuta 2017 päivittänyt: Qiushui He, University of Turku
Tämä tutkimus keskittyy kliinisten B. pertussis -isolaattien geneettisiin muutoksiin.
Tätä varten B. pertussis -isolaatteja on kerätty neljän ajanjakson aikana eri Euroopan maista.
Tutkimuksen yleiskatsaus
Tila
Valmis
Interventio / Hoito
Yksityiskohtainen kuvaus
B. pertussista pidetään monomorfisena patogeenina. Kuitenkin geneettisiä muutoksia on havaittu useissa nykyisiin soluttomiin hinkuyskärokotteisiin sisältyvissä antigeeneissä (hinkuyskätoksiini, pertaktiini, filamenttinen hemagglutiniini ja fimbriat) rokotekantojen ja kiertävien isolaattien välillä.
B. pertussis -populaatioiden geneettisten muutosten tutkimiseksi Euroopassa on kerätty neljä erillistä paneelia: EUpert I vuosina 1999-2001 sisältäen 102 isolaattia, EUpert II vuosina 2004-2005 mukaan lukien 154 isolaattia, EUpert III vuosina 2007-2009 ja 140 isolaattia EUpert IV vuosina 2012–2015, mukaan lukien 265 isolaattia. Valintakriteerit ovat säilyneet ennallaan kaikissa neljässä kokoelmassa, mikä mahdollistaa B. pertussis -populaatioiden muutosten tutkimisen viimeisen 15 vuoden aikana.
Opintotyyppi
Havainnollistava
Ilmoittautuminen (Todellinen)
265
Yhteystiedot ja paikat
Tässä osiossa on tutkimuksen suorittajien yhteystiedot ja tiedot siitä, missä tämä tutkimus suoritetaan.
Opiskelupaikat
-
-
-
Turku, Suomi, 20014
- University of Turku
-
-
Osallistumiskriteerit
Tutkijat etsivät ihmisiä, jotka sopivat tiettyyn kuvaukseen, jota kutsutaan kelpoisuuskriteereiksi. Joitakin esimerkkejä näistä kriteereistä ovat henkilön yleinen terveydentila tai aiemmat hoidot.
Kelpoisuusvaatimukset
Opintokelpoiset iät
- Lapsi
- Aikuinen
- Vanhempi Aikuinen
Hyväksyy terveitä vapaaehtoisia
Ei
Sukupuolet, jotka voivat opiskella
Kaikki
Näytteenottomenetelmä
Ei-todennäköisyysnäyte
Tutkimusväestö
Tutkimuspopulaatio koostuu hinkuyskäviljelypositiivisista potilaista yhdeksästä Euroopan maasta.
Tästä populaatiosta kerätään ja tutkitaan kliinisiä B. pertussis -isolaatteja.
Kuvaus
Sisällyttämiskriteerit:
- Kliiniset B. pertussis -isolaatit tulisi kerätä eri alueilta olevilta koehenkilöiltä, eivätkä ne ole epidemiologisesti sukua keskenään.
- Rokotetuista ja rokottamattomista henkilöistä tulee kerätä yhtä suuri määrä isolaatteja. Optimaalisesti isolaatit valitaan edullisesti alle 5-vuotiaista yksilöistä.
- Maista, joiden kokoelmissa on suuri määrä isolaatteja, isolaatit tulisi valita satunnaisesti yllä olevien kriteerien mukaisesti.
Poissulkemiskriteerit:
- Tälle tutkimukselle ei ole tiukkoja poissulkemiskriteerejä
Opintosuunnitelma
Tässä osiossa on tietoja tutkimussuunnitelmasta, mukaan lukien kuinka tutkimus on suunniteltu ja mitä tutkimuksella mitataan.
Miten tutkimus on suunniteltu?
Suunnittelun yksityiskohdat
Kohortit ja interventiot
Ryhmä/Kohortti |
Interventio / Hoito |
|---|---|
|
Painon eristäminen nenänielusta
Ryhmä kulttuuripositiivisia hinkuyskäpotilaita.
|
B. pertussis -kantoja on kerätty potilaiden nenänielusta kliinisen käynnin aikana
|
Mitä tutkimuksessa mitataan?
Ensisijaiset tulostoimenpiteet
Tulosmittaus |
Toimenpiteen kuvaus |
Aikaikkuna |
|---|---|---|
|
Rokotteen antigeenipuutteiset (VAD) B. pertussis -kliiniset isolaatit
Aikaikkuna: 24 kuukautta
|
Seuloimme paneelin, jossa oli 265 kliinistä B. pertussis -isolaattia, jotka kerättiin 9 Euroopan maasta.
Mittaimme hinkuyskätoksiinin (PT), filamenttihemagglutiniinin (FHA), pertaktiinin (PRN) ja fimbriae 2&3 (Fim2&3) antigeeniekspressiota aiemmin kehitetyllä ELISA:lla.
Lisäksi käytimme sekvensointia bakteerien pertaktiinigeenin edelleen karakterisointiin.
|
24 kuukautta
|
|
B. pertussiksen genomisisällön geneettisten muutosten tutkimus spesifisillä molekyylimenetelmillä mitattuna
Aikaikkuna: 24 kuukautta
|
Tutkimme geneettisiä muutoksia B. pertussiksen päävirulenssigeeneissä.
Genotyypisimme pertussistoksiinin promoottorin (ptxP), pertaktiinin (PRN), fimbriae3:n (Fim3) ja hinkuyskätoksiinin alayksikön A (ptxA).
Fimbriaen serotyypitystä (Fim), pulssikenttägeelielektroforeesia (PFGE) ja Multiple-Locus Variable Number -tandem-toistoanalyysiä (MLVA) käytettiin lisägenomianalyysiin.
|
24 kuukautta
|
|
Rokoteantigeenipuutteisten (VAD) B. pertussis -kliinisten isolaattien yhteys ja niiden yhteys soluttomaan hinkuyskärokotukseen (ACV)
Aikaikkuna: 24 kuukautta
|
Tutkimme kliinisten VAD B. pertussis -isolaattien esiintymistiheyden ja niiden yhteyttä ACV:n käyttöönoton välillä.
Tiedot rokotusaikatauluista maittain ja VAD-isolaattien lukumäärän mukaan kerättiin ja niitä verrattiin.
|
24 kuukautta
|
Yhteistyökumppanit ja tutkijat
Täältä löydät tähän tutkimukseen osallistuvat ihmiset ja organisaatiot.
Sponsori
Tutkijat
- Päätutkija: Qiushui He, MD, PhD, University of Turku
Julkaisuja ja hyödyllisiä linkkejä
Tutkimusta koskevien tietojen syöttämisestä vastaava henkilö toimittaa nämä julkaisut vapaaehtoisesti. Nämä voivat koskea mitä tahansa tutkimukseen liittyvää.
Yleiset julkaisut
- Advani A, Hallander HO, Dalby T, Krogfelt KA, Guiso N, Njamkepo E, von Konnig CH, Riffelmann M, Mooi FR, Sandven P, Lutynska A, Fry NK, Mertsola J, He Q. Pulsed-field gel electrophoresis analysis of Bordetella pertussis isolates circulating in Europe from 1998 to 2009. J Clin Microbiol. 2013 Feb;51(2):422-8. doi: 10.1128/JCM.02036-12. Epub 2012 Nov 21.
- Bouchez V, Brun D, Cantinelli T, Dore G, Njamkepo E, Guiso N. First report and detailed characterization of B. pertussis isolates not expressing Pertussis Toxin or Pertactin. Vaccine. 2009 Oct 9;27(43):6034-41. doi: 10.1016/j.vaccine.2009.07.074. Epub 2009 Aug 8.
- Barkoff AM, Mertsola J, Guillot S, Guiso N, Berbers G, He Q. Appearance of Bordetella pertussis strains not expressing the vaccine antigen pertactin in Finland. Clin Vaccine Immunol. 2012 Oct;19(10):1703-4. doi: 10.1128/CVI.00367-12. Epub 2012 Aug 22. No abstract available.
- Mooi FR, van Loo IH, van Gent M, He Q, Bart MJ, Heuvelman KJ, de Greeff SC, Diavatopoulos D, Teunis P, Nagelkerke N, Mertsola J. Bordetella pertussis strains with increased toxin production associated with pertussis resurgence. Emerg Infect Dis. 2009 Aug;15(8):1206-13. doi: 10.3201/eid1508.081511.
- Barkoff AM, Guiso N, Guillot S, Xing D, Markey K, Berbers G, Mertsola J, He Q. A rapid ELISA-based method for screening Bordetella pertussis strain production of antigens included in current acellular pertussis vaccines. J Immunol Methods. 2014 Jun;408:142-8. doi: 10.1016/j.jim.2014.06.001. Epub 2014 Jun 10.
- Caro V, Njamkepo E, Van Amersfoorth SC, Mooi FR, Advani A, Hallander HO, He Q, Mertsola J, Riffelmann M, Vahrenholz C, Von Konig CH, Guiso N. Pulsed-field gel electrophoresis analysis of Bordetella pertussis populations in various European countries with different vaccine policies. Microbes Infect. 2005 Jun;7(7-8):976-82. doi: 10.1016/j.micinf.2005.04.005.
- Heikkinen E, Xing DK, Olander RM, Hytonen J, Viljanen MK, Mertsola J, He Q. Bordetella pertussis isolates in Finland: serotype and fimbrial expression. BMC Microbiol. 2008 Sep 25;8:162. doi: 10.1186/1471-2180-8-162.
- van Amersfoorth SC, Schouls LM, van der Heide HG, Advani A, Hallander HO, Bondeson K, von Konig CH, Riffelmann M, Vahrenholz C, Guiso N, Caro V, Njamkepo E, He Q, Mertsola J, Mooi FR. Analysis of Bordetella pertussis populations in European countries with different vaccination policies. J Clin Microbiol. 2005 Jun;43(6):2837-43. doi: 10.1128/JCM.43.6.2837-2843.2005.
Opintojen ennätyspäivät
Nämä päivämäärät seuraavat ClinicalTrials.gov-sivustolle lähetettyjen tutkimustietueiden ja yhteenvetojen edistymistä. National Library of Medicine (NLM) tarkistaa tutkimustiedot ja raportoidut tulokset varmistaakseen, että ne täyttävät tietyt laadunvalvontastandardit, ennen kuin ne julkaistaan julkisella verkkosivustolla.
Opi tärkeimmät päivämäärät
Opiskelun aloitus (Todellinen)
Maanantai 12. lokakuuta 2015
Ensisijainen valmistuminen (Todellinen)
Lauantai 31. joulukuuta 2016
Opintojen valmistuminen (Todellinen)
Lauantai 31. joulukuuta 2016
Opintoihin ilmoittautumispäivät
Ensimmäinen lähetetty
Tiistai 13. kesäkuuta 2017
Ensimmäinen toimitettu, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 22. kesäkuuta 2017
Ensimmäinen Lähetetty (Todellinen)
Perjantai 23. kesäkuuta 2017
Tutkimustietojen päivitykset
Viimeisin päivitys julkaistu (Todellinen)
Perjantai 23. kesäkuuta 2017
Viimeisin lähetetty päivitys, joka täytti QC-kriteerit
Torstai 22. kesäkuuta 2017
Viimeksi vahvistettu
Torstai 1. kesäkuuta 2017
Lisää tietoa
Tähän tutkimukseen liittyvät termit
Muita asiaankuuluvia MeSH-ehtoja
Muut tutkimustunnusnumerot
- EUpert IV
Yksittäisten osallistujien tietojen suunnitelma (IPD)
Aiotko jakaa yksittäisten osallistujien tietoja (IPD)?
EI
Lääke- ja laitetiedot, tutkimusasiakirjat
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää lääkevalmistetta
Ei
Tutkii yhdysvaltalaista FDA sääntelemää laitetuotetta
Ei
Nämä tiedot haettiin suoraan verkkosivustolta clinicaltrials.gov ilman muutoksia. Jos sinulla on pyyntöjä muuttaa, poistaa tai päivittää tutkimustietojasi, ota yhteyttä register@clinicaltrials.gov. Heti kun muutos on otettu käyttöön osoitteessa clinicaltrials.gov, se päivitetään automaattisesti myös verkkosivustollemme .
Kliiniset tutkimukset Painon eristäminen nenänielusta
-
Gadjah Mada UniversityAktiivinen, ei rekrytointiTurvallisuus asiatIndonesia
-
Oncolytics BiotechValmisKarsinooma, ei-pienisoluinen keuhkoYhdysvallat
-
Oncolytics BiotechValmisKarsinooma, pään ja kaulan okasolusoluYhdysvallat, Kanada, Espanja, Belgia, Yhdistynyt kuningaskunta, Kreikka, Saksa, Unkari, Puola, Slovenia, Ranska, Italia, Venäjän federaatio