Hengityselinten mikrobiomi ja keuhkoahtaumatauti (RESMECOPD) (RESMECOPD)

Tämän koordinoidun hankkeen globaalina tavoitteena on testata seuraavia hypoteeseja: 1) keuhkojen mikrobiomi kroonisessa obstruktiivisessa keuhkosairaudessa (COPD) on erilainen potilailla, jotka kärsivät toistuvista pahenemisvaiheista (FE) verrattuna potilaisiin, jotka eivät kärsi (NE ); 2) FE-potilaiden mikrobiprofiili liittyy erilaiseen paikalliseen ja systeemiseen tulehduskuvioon; ja 3) suoliston mikrobiomi moduloi COPD:n tulehduksellisia ja immuuniominaisuuksia.

Projekti perustuu bronkoalveolaariseen huuhteluun (BAL) keuhkojen mikrobiomin näytteenottoon, ja se sisältää alueellisen vaihtelun (intrapulmonaarisen) ja ajallisen vaihtelun analyysin. Hankkeessa arvioidaan myös proksimaalisista hengitysteistä (suuontelosta, suunielusta ja ysköksestä) otettujen BAL-näytteiden korrelaatiota ja keuhkojen mikrobiomin edustavuutta niissä. COPD-potilaiden kohortti (n = 50 FE; n = 50 NE) ja terveitä koehenkilöitä (n = 30) iän, sukupuolen ja tupakankulutuksen mukaan. Hengityksen eritenäytteet kerätään kliinisissä stabiiliusnäytteissä, ja uudelleennäytteet otetaan neljännekseltä osallistujista 6-9 kuukauden iässä. Koordinaattoriprojekti: Bakteeri- ja sienimikrobisto määritetään 16S rRNA:n ja ITS:n monistuksella ja sekvensoinnilla. Viromi ja toiminnallinen metagenomiikka analysoidaan neljänneksellä osallistujista. Osaprojektit: Selvitetään keuhkojen alueellista vaihtelua, paikallista ja systeemistä tulehdusvastetta sekä suoliston mikrobiomin ja taudin tulehduksellisten ja kliinisten ominaisuuksien suhdetta. Tulosten integrointi suoritetaan verkkolääketieteen metodologioilla. Tämän projektin tulokset auttavat ymmärtämään keuhkoahtaumataudin ja sen pahenemisvaiheiden patogeneesiä, ja lopullisena tavoitteena on löytää uusia hoitokohteita.