Utilisation d'antibiotiques et transport de staphylocoques résistants à la méthicilline chez les patients communautaires (StaphMRG)

Justification : La propagation récente du Staphylococcus aureus d'origine communautaire résistant à la méthicilline (CA-MRSA) représente un problème majeur de santé publique. Les staphylocoques à coagulase négative MR (MR-CoNS) sont un réservoir probable du déterminant MR Staphylococcal Cassette Chromosome mec (SCCmec) pour S. aureus (SA). L'amoxicilline-acide clavulanique, les pénicillines M, les macrolides et la synergistine sont les antibiotiques antistaphylococciques les plus prescrits dans la communauté française, mais leurs impacts respectifs sur la colonisation nasale par MR-CoNS et SA n'ont pas été étudiés dans cette population.

Objectif principal : Comparer le taux d'acquisition de portage nasal de MR-CoNS chez des patients communautaires traités par β-lactamines (amoxicilline-acide clavulanique ou pénicillines M), macrolides, synergistine ou fluoroquinolones en fin d'antibiothérapie.

Objectifs secondaires : (i) Comparer le taux d'acquisition de portage nasal de MR-CoNS chez des patients communautaires traités par β-lactamines (amoxicilline-acide clavulanique ou pénicillines M), macrolides, synergistine ou fluoroquinolones 23 à 45 jours après la fin de l'antibiothérapie ; (ii) Décrire la fréquence de co-colonisation par SA et MR-CoNS après l'utilisation d'antibiotiques ; (iii) Comparer la pression de sélection de ces 4 classes d'antibiotiques en termes de résistances aux antibiotiques associées aux MR dans les souches porteuses de staphylocoques (iv) Évaluer la biodiversité de SCCmec dans les MR-ConS d'origine communautaire.

Conception et méthodes de l'étude : les chercheurs proposent de réaliser une étude prospective multicentrique du portage des staphylocoques RM chez les patients communautaires recevant des antibiotiques prescrits par leur médecin généraliste (MG). Les patients de plus de 18 ans, traités par β-lactamines (amoxicilline-acide clavulanique ou pénicillines M), macrolides, synergistine ou fluoroquinolones pendant une durée minimale prévue de 5 jours (quelle que soit l'indication) et consentant au protocole de l'étude seront éligibles à l'inclusion. Une hospitalisation dans les 6 mois précédents, une antibiothérapie dans les 2 mois précédents et une antibiothérapie de deuxième ligne après inclusion constitueront des critères d'exclusion. Des données démographiques et médicales seront recueillies à l'inclusion. Trois échantillons de flore nasale doivent être obtenus pour chaque patient inclus : (i) le premier avant l'exposition aux antibiotiques (à l'inclusion, par le médecin généraliste du patient) (ii) les deuxième et troisième au cabinet du médecin généraliste à la fin et de 23 à 45 jours après la fin de l'antibiothérapie, respectivement. Les patients inscrits participeront à l'étude pendant 5 à 7 semaines, selon la durée de l'antibiothérapie. Les échantillons seront transférés à l'unité de bactériologie de l'hôpital BICHAT-Claude Bernard pour le dépistage des porteurs de MR-CoNS et de S. aureus, les tests de sensibilité aux antibiotiques et la caractérisation des SCCmec par PCR multiplex.

Nombre de patients (durée de l'étude), analyse statistique : Le taux de portage de MR-CoNS dans la communauté est de 10 % à 20 %. Les taux d'acquisition attendus sont de 20 % pour les patients traités par pénicilline M et amoxicilline-acide clavulanique, et inférieurs à 5 % pour les patients traités par synergistine. Le taux d'acquisition n'est pas prévisible dans le groupe des macrolides. Pour démontrer une différence significative des taux d'acquisition (puissance = 90 %, risque α = 5 %), 578 patients doivent être définitivement inclus (141 dans chaque groupe, dont un taux anticipé de 25 % de patients perdus de vue), pour une durée totale d'étude de 22 mois.

Nombre de médecins généralistes participants : 48 médecins généralistes de Paris et sa banlieue, et rattachés au service de médecine générale de la faculté de médecine BICHAT-Université Paris 7.