Détection des anaérobies dans différents échantillons cliniques

Les infections causées par des bactéries anaérobies sont courantes et peuvent être graves et potentiellement mortelles. Obligatoirement, les bactéries anaérobies ne se développent pas sur des milieux solides dans l'air ambiant (0,04 % de dioxyde de carbone et 21 % d'oxygène) ; les bactéries anaérobies facultatives peuvent se développer en présence ou en l'absence d'air. Les bactéries microaérophiles ne se développent pas du tout en aérobie ou se développent mal, mais se développent mieux sous 10% de dioxyde de carbone ou en anaérobie. Les bactéries anaérobies peuvent être divisées en anaérobies stricts qui ne peuvent pas se développer en présence de plus de 0,5 % d'oxygène et en bactéries anaérobies modérées qui sont capables de se développer entre 2 et 8 % d'oxygène. Les bactéries anaérobies ne possèdent généralement pas de catalase, mais certaines peuvent générer de la superoxyde dismutase qui les protège de l'oxygène.

Les anaérobies sont les composants prédominants de la flore bactérienne de la peau et des muqueuses humaines normales, et sont donc une cause fréquente d'infections bactériennes d'origine endogène. Les infections dues aux bactéries anaérobies peuvent évoluer dans tous les systèmes et sites de l'organisme. Les principales sont : les infections abdominales, pelviennes, respiratoires, cutanées et des tissus mous. En raison de leur nature exigeante, ils sont difficiles à isoler des sites infectieux et sont souvent négligés. Le fait de ne pas orienter le traitement contre ces organismes conduit souvent à des échecs cliniques. Leur isolement nécessite des méthodes appropriées de collecte, de transport et de culture des spécimens. Le traitement de l'infection bactérienne anaérobie est compliqué par la croissance lente de ces organismes, qui ne rend possible le diagnostic en laboratoire qu'après plusieurs jours, par leur nature souvent polymicrobienne et par la résistance croissante des bactéries anaérobies à l'agent antimicrobien.

Presque toutes les infections anaérobies proviennent de la propre microflore du patient. Un mauvais apport sanguin et une nécrose tissulaire diminuent le potentiel d'oxydo-réduction et favorisent la croissance des anaérobies. Toute condition qui réduit l'apport sanguin dans une zone touchée peut prédisposer à une infection anaérobie. Par conséquent, un corps étranger, une malignité, une intervention chirurgicale, un œdème, un choc, un traumatisme et une maladie vasculaire peuvent prédisposer à une infection anaérobie. Une infection antérieure par des organismes aérobies ou facultatifs peut également rendre les conditions tissulaires locales plus favorables à la croissance d'organismes anaérobies. Les mécanismes de défense humains peuvent également être altérés par des conditions anaérobies.