Efficacité du traitement de transplantation microbienne fécale chez les adultes atteints de dermatite atopique

Étude prospective croisée en simple aveugle contre placebo, chez des patients adultes atteints de dermatite atopique (DA) modérée à sévère, insuffisamment répondeurs aux traitements topiques et systémiques. Tous les patients reçoivent 2 transplantations placebo à 2 semaines d'intervalle suivies de 4 transplantations microbiennes fécales (FMT) provenant de donneurs sains à 2 semaines d'intervalle. Les patients ont été autorisés à poursuivre leur traitement médical topique de base, y compris les hydratants et les glucocorticoïdes, pendant la période d'étude, mais aucun nouveau traitement n'a été commencé. La sévérité de la MA et le profil du microbiome fécal ont été évalués par le Scoring Atopic Dermatitis Score (SCORAD score), et l'utilisation hebdomadaire de corticostéroïdes topiques, au début de l'étude, avant chaque FMT, et 1 à 6 mois après le dernier FMT .

Au cours de la période d'étude, les patients n'étaient autorisés à utiliser qu'un traitement topique comprenant des émollients et des glucocorticoïdes ou des inhibiteurs de la calcineurine.

Préparation et livraison FMT :

Les donneurs volontaires étaient des adultes en bonne santé, non enceintes, âgés de 18 à 50 ans, avec un indice de masse corporelle normal. Les donneurs volontaires ont été exclus pour tout antécédent médical significatif ou pour toute utilisation d'antibiotiques au cours des 3 mois précédents. Les candidats étaient éligibles selon les directives du ministère israélien de la Santé, qui comprennent un examen physique et des tests de dépistage en laboratoire, notamment des agents pathogènes entériques fécaux, des anticorps sériques contre les hépatites A, B et C ; virus de l'immunodéficience humaine; HTLV et Treponema pallidum ainsi que coeliaque, CBC (et tests supplémentaires conformes aux directives du ministère israélien de la Santé). Les selles ont été livrées quelques minutes après la défécation dans un récipient en plastique propre et fermé et ont été traitées à la banque de selles du centre médical de Tel Aviv pour préparer la FMT capsulée. En bref, la matière fécale a été diluée avec une solution saline normale (600 ml/100 g de matière fécale), filtrée et concentrée la préparation dans une centrifugeuse. Le culot a été mis en suspension dans une solution saline stérile et du glycérol (20 %) qui a été ajouté comme cryoprotecteur bactérien. Ce matériau a ensuite été pipeté dans des capsules résistantes aux acides, qui ont été fermées puis scellées secondairement avec un ensemble supplémentaire de capsules. Les capsules ont été conservées congelées à -80°C. Les capsules de placebo avaient un aspect visuel identique et ne contenaient que du glycérol dilué.

Procédure FMT encapsulée :

La FMT a été administrée en deux doses de 15 gélules de FMT sur deux jours consécutifs (un total de 30 gélules), à la clinique de bactériothérapie du centre médical de Tel Aviv (TLVMC). Le jour de l'administration, les capsules congelées à -80°C ont été sorties du congélateur et transportées à la clinique sur de la glace. Quinze capsules ont été remises individuellement au patient et le patient a ingéré les capsules immédiatement avec un peu d'eau. Les patients ont été invités à jeûner pendant la nuit avant la prise de la capsule.

Analyse microbienne fécale :

Afin d'examiner si l'effet clinique peut être médié par la colonisation de nouvelles souches bactériennes, les chercheurs ont développé une méthode robuste et sensible pour calculer la dissemblance de séquences d'ADN par paires entre les souches bactériennes de la même espèce dans des échantillons métagénomiques distincts. Les échantillons de selles des donneurs qui ont été utilisés pour les capsules FMT et les échantillons de selles qui ont été prélevés sur les patients au cours de la période d'étude ont été séquencés en lectures métagénomiques. Les lectures qui ont été cartographiées ont été empilées pour obtenir des informations sur les variantes par position pour chaque espèce détectée. La différence dans la variante d'une espèce particulière à une position donnée entre deux échantillons a été définie comme n'ayant aucune intersection entre l'ensemble d'allèles détectés dans les deux échantillons comparés. La dissimilitude de séquence d'ADN d'espèce estimée pour une paire d'échantillons est alors le nombre de positions différentes divisé par le nombre total de positions comparées.