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Diagnosi genetica e medicina personalizzata per i pazienti affetti da epilessia

Caratterizzazione di pazienti affetti da epilessia con un approccio integrato di metodi clinici, neurofisiologici, neuroradiologici, neuropsicologici e di laboratorio (esoma) per la medicina personalizzata

Background L'epilessia è un disturbo neurologico comune. Colpisce 50 milioni di persone nel mondo e ha la più alta incidenza in età pediatrica. Secondo l’ultima classificazione dell’ILAE (International League Against Epilepsy), le epilessie si dividono in forme lesionali (sintomatiche) e non lesionali/genetiche. Le cause sintomatiche dell'epilessia possono includere cicatrici, tumori, ictus e disturbi dello sviluppo cerebrale come le displasie. In circa il 30% delle epilessie si può ipotizzare una causa genetica dell'epilessia. Dall’identificazione del primo gene dell’epilessia nel 1995, nei successivi 25 anni sono stati identificati oltre 500 geni associati all’epilessia. L'importanza di molti geni e di molte varianti genetiche identificate in molti geni non è ancora chiara e le mutazioni identificate in diversi geni richiedono conferma con studi funzionali e conferma su serie più ampie di pazienti. Inoltre, il difetto genetico alla base di molti pazienti affetti da epilessia rimane sconosciuto fino ad oggi, nonostante un alto livello di sforzi per il sequenziamento dei geni.

Studi molecolari su questi geni hanno dimostrato come varianti patogene su questi geni determinino una disfunzione proteica che può causare ipereccitabilità neuronale e sincronizzazione patologica delle reti neuronali che portano a crisi epilettiche e disfunzioni cerebrali. Una notevole complicazione nel campo della genetica dell'epilessia è rappresentata dal fatto che il concetto di gene/malattia è valido solo in pochi casi, in quanto esiste un'elevata eterogeneità fenotipica e genotipica per cui un gene può presentare diversi tipi di epilessia anche all'interno della stessa famiglia. Ciò significa che esiste un substrato genetico complesso, multigenico e multifattoriale, per il quale l'impatto di una specifica variante genetica è condizionato da varianti di altri geni. Questo concetto è particolarmente valido per le forme epilettiche più comuni come l'epilessia generalizzata idiopatica.

L’integrazione dell’analisi genetica con la caratterizzazione epilettologica nella pratica clinica è sempre più cruciale per definire una chiara diagnosi molecolare in pazienti la cui causa di malattia rimarrebbe altrimenti sconosciuta, e consente potenzialmente di evitare altre indagini diagnostiche non necessarie. Si prevede quindi che ciò porti ad ottimizzare la gestione clinica e a ridurre i costi complessivi nel tempo. Il reperto genetico può costituire un biomarcatore utile per definire l’esito della malattia e per orientare le decisioni cliniche come la scelta della migliore terapia. Nonostante i vantaggi, prima di iniziare il processo di test genetico, i pazienti e i loro familiari dovrebbero essere informati sulle questioni etiche che possono sorgere dai test genetici, sulle limitazioni tecniche, sugli aspetti legali e sui costi delle indagini genetiche.

Scopo dello studio Caratterizzazione di pazienti affetti da epilessia reclutati presso l'Ospedale Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico di Milano (Italia) e analisi con sequenziamento NGS dell'esoma dei pazienti con la più alta probabilità di diagnosi genetica con esoma (utilizzo di un punteggio di probabilità)

Gli obiettivi di studio sono i seguenti:

  1. Identificazione della causa genetica delle forme di epilessie genetiche con la più alta probabilità di diagnosi molecolare con esoma
  2. Caratterizzazione clinico-strumentale ed epilettologica secondo la classificazione ILAE dei pazienti affetti da epilessia seguiti presso la Fondazione IRCCS Ca' Granda Fondazione Ospedale Maggiore Policlinico
  3. Correlazione dei parametri clinici e strumentali (in particolare EEG e neuropsicologici) dell'epilessia registrati nel database con eziologia, esito e risposta alla terapia

Panoramica dello studio

Stato

Reclutamento

Condizioni

Descrizione dettagliata

Disegno dello studio Interventi non farmacologici (diagnostici), monocentrici, biologici, osservazionali, prospettici

  1. Raccolta dei dati clinici e strumentali dei pazienti con epilessia alla prima visita ambulatoriale (tempo 0) e al follow-up ad un anno: età, sesso, istruzione, età di insorgenza delle crisi, nuova diagnosi/controllo, tipologia di crisi a seconda alla classificazione ILAE, tipo di epilessia secondo la classificazione ILAE, frequenza delle crisi epilettiche, eziologia, per i casi ad eziologia genetica/probabilmente genetica applicazione di un punteggio ad hoc per determinare la probabilità di un esito positivo per la ricerca dell'esoma, oggettività neurologica , presenza di comorbidità, parametri di attività di fondo EEG, parametri relativi ad anomalie EEG interictali, parametri relativi ad anomalie EEG critiche, parametri di risonanza magnetica, terapie utilizzate, efficacia delle terapie utilizzate, effetti collaterali delle terapie, durata della terapia, dosaggi della terapia, esito neuropsicologico e psicologico (punteggio ai test/questionari standard somministrati in base all'età come previsto dallo standard di cura), esito funzionale espresso con la scala Rankin modificata; verranno raccolti dati clinico-strumentali anche per i genitori malati o sani di pazienti affetti da epilessia che verranno individuati per l'analisi dell'esoma del trio (probando + genitori) in fase di reclutamento (non al follow-up), mentre non verranno raccolti dati sensibili relativi ai genitori dei pazienti che non sono stati sottoposti ad esoma (parte osservativa dello studio).
  2. Valutazione qualitativa dell'EEG secondo le linee guida ACNS e quando possibile attraverso l'analisi quantitativa dei parametri EEG al tempo 0 e al follow-up a 1 anno. Nell'analisi quantitativa verranno utilizzati algoritmi ad hoc per estrarre le caratteristiche del dominio temporale e di frequenza delle tracce EEG.
  3. Sequenziamento e analisi dell'esoma di almeno 30 pazienti e dei loro genitori naturali (più eventuali altri parenti di primo grado affetti da epilessia o condizione genetica correlata all'epilessia) per un totale di almeno 90 esomi.

Ad eccezione del sequenziamento WES, le altre procedure diagnostico-valutative rientrano nella normale gestione clinica dei pazienti.

Correlazioni genotipo-fenotipo Il WES sarà valutato in relazione al quadro clinico sulla base di una stretta collaborazione tra clinici (neurologi), biologi, genetisti, bioinformatici coinvolti nel progetto. I dati acquisiti verranno utilizzati anche per definire il rischio di recidiva, la prognosi, il monitoraggio delle complicanze e l'individuazione di possibili trattamenti mirati.

Tipo di studio

Interventistico

Iscrizione (Stimato)

500

Fase

  • Non applicabile

Contatti e Sedi

Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.

Contatto studio

Luoghi di studio

      • Milano, Italia, 20122
        • Reclutamento
        • Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico
        • Contatto:

Criteri di partecipazione

I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.

Criteri di ammissibilità

Età idonea allo studio

  • Bambino
  • Adulto
  • Adulto più anziano

Accetta volontari sani

Descrizione

Criterio di inclusione:

Popolazione in studio: pazienti con epilessia.

Verranno inclusi i pazienti che soddisfano tutti i seguenti criteri:

  • Pazienti sia minori che adulti con diagnosi di epilessia;
  • di entrambi i sessi;
  • seguiti presso gli ambulatori di epilessia ed elettroencefalografia pediatrica e dell'adulto dell'U.O.C. Neurofisiopatologia - IRCCS Ca' Granda Fondazione Ospedale Maggiore Policlinico;
  • Consenso informato del paziente se maggiorenne e in grado di prestare il consenso in autonomia o dei genitori o tutori legali in caso di minore/individuo non in grado di prestare il consenso in autonomia.

Criteri di inclusione per i pazienti candidati all'esoma:

  • Disponibilità di campioni di DNA del paziente e di entrambi i genitori naturali;
  • Previsione della diagnosi genetica alta positiva I pazienti con diagnosi di epilessia verranno reclutati tra quelli seguiti presso gli ambulatori di epilessia ed elettroencefalografia pediatrici e dell'adulto dell'U.O.C. Neurofisiopatologia - Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico, previa firma del consenso.

Criteri di esclusione:

  • Saranno esclusi i pazienti che possiedono almeno uno dei seguenti criteri:
  • Pazienti che arrivano alla valutazione con il sospetto iniziale di epilessia e che durante l'iter diagnostico sono risultati affetti da una patologia diversa;
  • Pazienti che hanno rifiutato il consenso a partecipare allo studio.

Piano di studio

Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.

Come è strutturato lo studio?

Dettagli di progettazione

  • Scopo principale: Diagnostico
  • Assegnazione: N / A
  • Modello interventistico: Assegnazione di gruppo singolo
  • Mascheramento: Nessuno (etichetta aperta)

Armi e interventi

Gruppo di partecipanti / Arm
Intervento / Trattamento
Sperimentale: Pazienti epilettici reclutati per lo studio osservazionale
Pazienti con epilessia reclutati per lo studio di osservazione. Quando i criteri per l'epilessia genetica saranno soddisfatti, verranno sottoposti a test per l'indagine genetica attraverso il sequenziamento dell'esoma NGS
Il paziente selezionato per lo studio genetico sarà sottoposto alla raccolta di campioni di sangue per l'estrazione del DNA, la conservazione nella biobanca e lo studio WES

Cosa sta misurando lo studio?

Misure di risultato primarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Identificazione della causa genetica in pazienti con epilessia genetica clinicamente probabile mediante WES
Lasso di tempo: 1 anno dopo l'iscrizione
Identificazione della causa genetica di pazienti con forme di epilessia ad alta probabilità mediante eziologia genetica, selezionati dalla coorte di pazienti epilettici seguiti presso Fondazione IRCCS Ca' Ospedale Maggiore Policlinico, mediante WES
1 anno dopo l'iscrizione

Misure di risultato secondarie

Misura del risultato
Misura Descrizione
Lasso di tempo
Caratterizzazione clinica ed epilettologica dei pazienti con epilessia secondo la classificazione delle crisi ILAE e dell'epilessia
Lasso di tempo: 1 anno dopo l'iscrizione
Caratterizzazione clinica ed epilettologica secondo la classificazione ILAE della popolazione di pazienti affetti da epilessia seguita presso la Fondazione IRCCS Ca' Ospedale Maggiore Policlinico
1 anno dopo l'iscrizione
Caratterizzazione delle caratteristiche qualitative dell'elettroencefalografia (EEG) di pazienti con diversi tipi di epilessia
Lasso di tempo: 1 anno dopo l'iscrizione
Valutazione elettroencefalografica delle tracce EEG di pazienti con diversi tipi di epilessia una valutazione EEG qualitativa strutturata eseguita da un neurofisiologo clinico qualificato
1 anno dopo l'iscrizione
Caratterizzazione quantitativa dell'EEG (qEEG) di pazienti con diversi tipi di epilessia
Lasso di tempo: 3 anni dopo l'iscrizione
Analisi delle tracce EEG di pazienti con diversi tipi di epilessia utilizzando gli strumenti dell'EEG quantitativo (aEEG), come l'analisi dello spettro di potenza, da parte di un ingegnere del segnale EEG qualificato
3 anni dopo l'iscrizione
Caratterizzazione delle caratteristiche cliniche e strumentali di pazienti con eziologia genetica specifica
Lasso di tempo: 1 anno dopo l'iscrizione
Caratterizzazione delle caratteristiche cliniche e strumentali dei pazienti con eziologia genetica specifica da parte di un epilettologo esperto
1 anno dopo l'iscrizione

Collaboratori e investigatori

Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.

Investigatori

  • Investigatore principale: Robertino Dilena, MD, Fondazione IRCCS Ca' Granda Ospedale Maggiore Policlinico, Milan

Studiare le date dei record

Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.

Studia le date principali

Inizio studio (Effettivo)

2 agosto 2021

Completamento primario (Stimato)

2 agosto 2025

Completamento dello studio (Stimato)

31 dicembre 2026

Date di iscrizione allo studio

Primo inviato

4 marzo 2024

Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità

13 marzo 2024

Primo Inserito (Effettivo)

20 marzo 2024

Aggiornamenti dei record di studio

Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)

20 marzo 2024

Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC

13 marzo 2024

Ultimo verificato

1 marzo 2024

Maggiori informazioni

Termini relativi a questo studio

Piano per i dati dei singoli partecipanti (IPD)

Hai intenzione di condividere i dati dei singoli partecipanti (IPD)?

NO

Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio

Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti

No

Queste informazioni sono state recuperate direttamente dal sito web clinicaltrials.gov senza alcuna modifica. In caso di richieste di modifica, rimozione o aggiornamento dei dettagli dello studio, contattare register@clinicaltrials.gov. Non appena verrà implementata una modifica su clinicaltrials.gov, questa verrà aggiornata automaticamente anche sul nostro sito web .

Prove cliniche su Sequenziamento dell'intero esoma (WES)

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