イミペネム耐性緑膿菌が定着した慢性閉塞性肺疾患患者の肺微生物叢 (MiPAD)

患者：ランス教育病院の呼吸器科に入院している重症COPD患者（FEV/努力肺活量（FVC）<70%、気管支拡張後FEV<50%）。 組み入れ時には、患者は安定している必要があります。 合計 100 人の患者を必要とする 20 人の患者を含めるには 24 か月かかります。PA および PA 変異体 OprD への定着に関連する因子の研究は、PA キャリアではないことがわかっている患者に対してのみ実施されます。 微生物叢の特徴付けは、PA が定着したすべての患者と、ランダムに選択された非 PA 定着患者に対して実行されます。 PA 定着の COPD 進行への影響の分析は、対象となるすべての患者のサンプリングから 12 か月後に行われます。

評価基準：

• イミペネムに対する緑膿菌耐性の存在（OprD 変異）
• 肺微生物叢: 細菌量 (細菌の総数) と細菌群集の多様性の決定。 次に、運用分類単位 (OTU) の相対存在量が門、綱、目、科レベルで分析されます。
• PA および PA 変異体 OprD の定着に関連する要因：抗生物質、コルチコステロイド、対象となる前の 1 年間の入院、COPD の重症度、咳および喀痰の呼吸器症状、修正呼吸器医学評議会 (MMRC) のアンケートによって評価された労作性呼吸困難。疾病。
• PA 移植 12 か月までの変化に対する PA 変異体 OprD の影響: 増悪の回数、増悪の重症度、入院回数、セント ジョージ呼吸器質問票によって評価された生活の質、死亡、閉塞性換気障害の進展。

調査：

• 対象となるすべての患者に対する呼吸器科診察への参加の提案
• 受け入れに参加する場合（インフォームドコンセントフォームに署名）： 3 つの細菌学的サンプル： 喀痰（通常実施）、洗浄前に水で口腔洗浄（この研究のために特別に作成）。 患者の医療行為（治療、モニタリングなど）に変更はありません。 臨床データ収集: COPDの基準、MMRCスケールで評価された肺機能、呼吸困難および喀痰症状、セントジョージ呼吸器質問票で評価された生活の質、抗生物質治療および過去12か月の入院。 患者の定期モニタリングの一環としてサンプリングの 12 か月後に再評価する (同上)。 すべてのサンプルは、通常サンプルに対して行われるように、細菌学臨床検査室 (CHU Reims) に送られます。サンプルは 2 つの部分に分離されます。1 つの部分は -80 °C で保管され、もう 1 つの部分は通常分析されます。 その後、患者は喀痰分析に基づいて PA または PA 非定着として分類されます。 oprD の変異は、患者を PA または PA OprD 変異キャリアとして分類するための第 2 ステップで特徴付けられます。 PA が定着したすべての患者および無作為に選択された非 PA 定着患者のサンプルは、-80°C で保存され、パスツール・ド・リール研究所の「PEGASE」プレートフォームに送られます。 肺微生物叢の特性評価は、2x300 bp ペアエンドで 2,400 万リードに達するイルミナ「MiSeq」のハイスループット シーケンスによって実行されます。