Imipenem에 내성인 P. Aeruginosa가 집락화된 만성폐쇄성폐질환 환자의 폐미생물총 (MiPAD)

환자: Reims 교육 병원의 폐과에 입원한 중증 COPD 환자(FEV/강제 폐활량(FVC) < 70% 및 기관지확장 후 FEV < 50%). 포함 시 환자는 안정적이어야 합니다. 총 100명의 환자가 필요한 20명의 환자를 포함하려면 24개월이 소요됩니다. PA 및 PA 돌연변이 OprD에 대한 집락화와 관련된 요인에 대한 연구는 PA 보인자가 아닌 것으로 알려진 환자에 대해서만 수행됩니다. Microbiota 특성화는 PA로 식민지화 된 모든 환자와 PA로 식민지화되지 않은 환자에서 무작위로 선택하여 수행됩니다. COPD 진화에 대한 PA 집락화 영향 분석은 포함된 모든 환자에 대해 샘플링 후 12개월에 수행될 것입니다.

평가 기준:

• imipenem에 대한 P. aeruginosa 내성의 존재(OprD 돌연변이)
• 폐 미생물총: 세균 부하(박테리아의 총 수) 및 세균 공동체 다양성의 결정. 그런 다음 OTU(Opertional Taxonomic Unit) 상대 풍부도를 문, 강, 목 및 과 수준에서 분석합니다.
• PA 및 PA 돌연변이 OprD의 집락화와 관련된 요인: 항생제, 코르티코스테로이드, 포함 전 1년 동안의 입원, COPD의 중증도, 기침 및 객담의 호흡기 증상, 수정된 호흡기 의료 위원회(MMRC) 설문지로 평가된 운동성 호흡곤란, 공동 질병.
• PA 포팅 영향 및 PA 돌연변이 OprD가 12개월로 변경: 악화 횟수, 악화 정도, 입원 횟수, 세인트 조지 호흡기 설문지로 평가한 삶의 질, 사망, 폐색성 환기 장애의 진행.

조사:

• 폐학 상담에서 모든 적격 환자에게 참여 제안
• 수락에 참여하는 경우(서명된 정보에 입각한 동의서 양식): 3개의 세균학적 샘플: 객담(일반적으로 수행됨), 세척 전 물로 구강 세척(이 연구를 위해 특별히 제작됨). 환자의 의료 서비스(치료, 모니터링 등...)에는 변화가 없습니다. 임상 데이터 수집: COPD, 폐 기능, 호흡곤란 및 가래 증상에 대한 기준, MMRC 척도로 평가, St George's 호흡기 설문으로 평가한 삶의 질, 이전 12개월 동안의 항생제 요법 및 입원. 정기적인 환자 모니터링의 일환으로 샘플링 후 12개월 후 재평가(이전과 동일). 모든 샘플은 일반적으로 샘플에 대해 수행되는 것처럼 세균학 임상 실험실(CHU Reims)로 보내집니다: 샘플을 2개 부분으로 분리: -80 °C에 보관된 1개 부분과 일반적으로 분석된 1개 부분. 그런 다음 환자는 객담 분석을 기반으로 PA 또는 비 집락화된 PA로 분류됩니다. oprD의 돌연변이는 환자를 PA 또는 PA OprD 돌연변이 보인자로 분류하기 위한 두 번째 단계에서 특성화됩니다. PA로 콜로니화된 모든 환자의 샘플과 -80°C에서 보관된 무작위로 선택된 PA 콜로니화되지 않은 환자의 샘플은 Institut Pasteur de Lille의 "PEGASE" 플랫폼으로 전송됩니다. 폐 미생물군의 특성화는 Illumina "MiSeq"의 고처리량 시퀀싱으로 수행되어 2x300 bp 페어드 엔드에서 2,400만 판독에 도달할 수 있습니다.