- ICH GCP
- Register voor klinische proeven in de VS.
- Klinische proef NCT03452787
Epigenomische en metabolomische handtekeningen van het APOA2-gen door interactie met verzadigd vet
Meta-analyse van epigenomische en metabolomische handtekeningen van het APOA2-gen door verzadigd vet
Studie Overzicht
Gedetailleerde beschrijving
Achtergrond: Apolipoproteïne A-II (APOA2) is een belangrijk bestanddeel van high-density lipoproteins (HDL) met een ongedefinieerde biologische rol. Van een vermoedelijke functionele variant, -265 T>C (rs5082) binnen de APOA2-promoter, is aangetoond dat deze consistent interageert met de inname van verzadigd vet (SFA) om het risico op obesitas te beïnvloeden.
Doelstelling: Deze studie zal een integratieve benadering implementeren om de moleculaire basis van deze interactie te karakteriseren.
Opzet: De onderzoekers zullen een epigenoombrede scan uitvoeren op 80 deelnemers die ofwel het rs5082 minder voorkomende genotype (CC) of het meest voorkomende genotype (TT) dragen en ofwel een laag (<22 g/d) of hoog (≥22 g/d) consumeren. /d) SFA-dieet, afgestemd op leeftijd, geslacht, BMI en diabetesstatus in de Boston Puerto Rican Health Study (BPRHS). De onderzoekers zullen vervolgens de bevindingen valideren bij geselecteerde deelnemers aan het Genetics of Lipid Lowering Drugs and Diet Network (GOLDN) (n=379) en de Framingham Heart Study (FHS) (n=243). Transcriptie- en metabolomics-analyses zullen worden uitgevoerd om de relatie tussen epigenetische status, APOA2-mRNA-expressie en bloedmetabolieten te bepalen.
Data bronnen. De Boston Puerto Rican Health Study (BPRHS), de Genetics of Lipid Lowering Drugs and Diet Network (GOLDN) en de Framingham Heart Study (FHS) Studieselectie: In BPRHS, 40 deelnemers met CC-genotype bij APOA2 -265T>C (rs5082 ) worden geselecteerd, waarbij 20 een lage SFA-inname rapporteren (<22 g/d) en 20 een hoge SFA-inname aangeven (≥22 g/d). Door leeftijd, geslacht, SFA-inname, type 2-diabetesstatus en BMI voor de 40 deelnemers met CC-genotype te matchen, zal de tweede set van 40 deelnemers met TT-genotype van APOA2 -265T>C uit dezelfde populatie worden geselecteerd. In GOLDN zullen 107 deelnemers met CC-genotype en 272 met TT-genotype voor APOA2 -265T>C, die geen medicatie gebruikten voor hypertensie, dyslipidemie of diabetes, worden geselecteerd om de bevindingen van BPRHS te valideren. In FHS zullen de onderzoekers 73 niet-verwante deelnemers met CC-genotype en 170 met TT-genotype bij APOA2 -265T>C opnemen, die geen medicatie namen voor hypertensie, dyslipidemie of diabetes. Deelnemers van elk genotype worden verder onderverdeeld in twee subgroepen op basis van SFA-inname: laag, <22 gram/dag, hoog, ≥22 gram/dag.
Data-extractie. Genoombrede DNA-methylatie van geïsoleerde DNA-monsters in BPRHS en GOLDN werd gekwantificeerd met behulp van Illumina Infinium® menselijke methylatie 450K-arrays (Illumina, San Diego, CA, VS). Het methyleringssignaal op elke methyleringsplaats wordt geschat als een β-score, het aandeel van het totale methyleringsspecifieke signaal en de detectie-P-waarde als de waarschijnlijkheid dat de totale intensiteit voor een bepaalde sonde binnen de achtergrondsignaalintensiteit valt na normalisatie en kwantiteit controle controleren. FHS-methylome-gegevens van dbGaP, accession#:phg000492.v2, waar de methylatiestatussen van 2.741 deelnemers werden gemeten in monsters genomen van deelnemers die tussen 2005 en 2008 hun bezoek aan examen 8 bijwoonden, met behulp van Illumina Infinium® menselijke methylatie 450K-array. Methyleringssignalen zullen worden verwerkt en genormaliseerd zoals voor BPRHS en GOLDN. De onderzoekers zullen FHS-transcriptoomgegevens verkrijgen van dbGaP onder toetreding phe00002.v6. Metabole profilering van plasmamonsters van die 80 deelnemers aan BPRHS voor wie de methylome-analyse zal worden uitgevoerd door Metabolon, Inc. (Durham, NC, VS). Resultaten: Body mass index is de enige uitkomst. Gegevens synthese. (1) Epigenoom-brede analyse van APOA2-genotype, door hoge en lage SFA-inname, zal worden uitgevoerd in 80 gematchte case/control-deelnemers van BPRHS, gerepliceerd in geselecteerde deelnemers van GOLDN en FHS met behulp van lineaire gemengde modellen. (2) Er zal een meta-analyse van de resultaten van de drie populaties worden uitgevoerd met behulp van het meta-R-pakket. uitgevoerd met SAS 9.4 met behulp van een t-toets. (3) Associaties tussen epigenetische varianten en APOA2-genotypes met APOA2-mRNA-expressie zullen worden getest in FHS. (4) Metabolome-analyse zal worden uitgevoerd in dezelfde 80 gematchte case/control-deelnemers van BPRHS, en metabolieten zullen worden gecorreleerd met epigenetische varianten op de APOA2-locus. (5) Verrijkte metabole routes zullen worden onderzocht in relatie tot geïdentificeerde epigenetische varianten in de APOA2-regio.
Kennisvertalingsplan: De resultaten zullen worden verspreid via interactieve presentaties op lokale, nationale en internationale wetenschappelijke bijeenkomsten en publicatie in tijdschriften met een hoge impactfactor. Doelgroepen zijn onder meer de volksgezondheid en wetenschappelijke gemeenschappen met interesse in voeding, diabetes, obesitas en hart- en vaatziekten. Feedback zal worden opgenomen en gebruikt om de volksgezondheidsboodschap te verbeteren en er zullen sleutelgebieden voor toekomstig onderzoek worden gedefinieerd. Beslissers van aanvragers/mede-aanvragers zullen netwerken onder opinieleiders om het bewustzijn te vergroten en als commissieleden rechtstreeks deel te nemen aan de ontwikkeling van toekomstige richtlijnen.
Voorlopige bevindingen: In BPRHS identificeerden de onderzoekers de methyleringsplaats cg04436964 als significante verschillen tussen CC- en TT-deelnemers die een dieet met een hoog SFA-gehalte gebruikten, maar niet tussen degenen die een laag SFA-gehalte consumeerden. Vergelijkbare resultaten werden waargenomen in GOLDN en FHS. Bovendien was cg04436964-methylering in FHS negatief gecorreleerd met APOA2-expressie bij deelnemers die een dieet met een hoog SFA-gehalte gebruikten. Bovendien hadden CC-dragers bij het consumeren van een dieet met een hoog SFA-gehalte een lagere APOA2-expressie in vergelijking met degenen met het TT-genotype, maar de expressieniveaus waren vergelijkbaar bij het consumeren van een dieet met een laag SFA-gehalte. Ten slotte identificeerde de metabolomische analyse vier routes als oververtegenwoordigd door metabolietverschillen tussen CC- en TT-genotypes met een hoge SFA-inname.
Betekenis: De onderzoekers zullen multi-omics-benaderingen toepassen om de mechanistische grondslagen van het APOA2-265T>C-genotype te onderzoeken door SFA-interactie gekoppeld aan de ontwrichtende toestand van obesitas. de onderzoekers kunnen plausibele ontregeling van verschillende metabolische routes ontdekken. Deze studie zal de effectiviteit illustreren van meerdere omics-benaderingen van gevestigde interacties tussen genen en voeding, en zal nieuw bewijs leveren voor lopende verkenningen van de impact van verzadigd vet op de menselijke gezondheid.
Studietype
Inschrijving (Werkelijk)
Contacten en locaties
Studie Locaties
-
-
Massachusetts
-
Boston, Massachusetts, Verenigde Staten, 02111
- JM-USDA-HNRCA at Tufts University
-
-
Deelname Criteria
Geschiktheidscriteria
Leeftijden die in aanmerking komen voor studie
Accepteert gezonde vrijwilligers
Geslachten die in aanmerking komen voor studie
Bemonsteringsmethode
Studie Bevolking
Beschrijving
Inclusiecriteria:
- proefpersonen met het apoA2 genotype TT of CC
Uitsluitingscriteria:
- alle andere genotypen
Studie plan
Hoe is de studie opgezet?
Ontwerpdetails
Cohorten en interventies
Groep / Cohort |
Interventie / Behandeling |
---|---|
Boston Puerto Ricaanse gezondheidsstudie (NCT01231958)
40 met CC en 40 met TT-genotypen bij APOA2 rs5082.
Deelnemers van elk genotype worden verder onderverdeeld in twee subgroepen op basis van SFA-inname: laag, <22 gram/dag, hoog, ≥22 gram/dag.
|
dit is een metanalyse van eerder verkregen waarnemingsgegevens.
er is geen interventie op een van de cohorten.
|
GOUD (NCT00083369)
107 deelnemers met CC-genotype en 272 met TT-genotype voor APOA2 rs5082.
|
dit is een metanalyse van eerder verkregen waarnemingsgegevens.
er is geen interventie op een van de cohorten.
|
Framingham-hartonderzoek (NCT00005121)
73 met CC en 170 met TT-genotypen bij APOA2 rs5082.
Deelnemers van elk genotype worden verder onderverdeeld in twee subgroepen op basis van SFA-inname: laag, <22 gram/dag, hoog, ≥22 gram/dag.
|
dit is een metanalyse van eerder verkregen waarnemingsgegevens.
er is geen interventie op een van de cohorten.
|
Wat meet het onderzoek?
Primaire uitkomstmaten
Uitkomstmaat |
Maatregel Beschrijving |
Tijdsspanne |
---|---|---|
Lichaamsmassa-index (BMI)
Tijdsspanne: Eén tijdstip tijdens het eerste bezoek van de deelnemers aan de onderzoeken die voor de meta-analyses zijn gebruikt.
|
BMI berekend op basis van gewicht (kg) en lengte (meters) informatie van elke deelnemer met behulp van de vergelijking BMI=kg/m2
|
Eén tijdstip tijdens het eerste bezoek van de deelnemers aan de onderzoeken die voor de meta-analyses zijn gebruikt.
|
Medewerkers en onderzoekers
Sponsor
Onderzoekers
- Hoofdonderzoeker: Jose M Ordovas, PHD, JM-USDA-HNRCA at Tufts University
Publicaties en nuttige links
Algemene publicaties
- Delgado-Lista J, Perez-Jimenez F, Tanaka T, Perez-Martinez P, Jimenez-Gomez Y, Marin C, Ruano J, Parnell L, Ordovas JM, Lopez-Miranda J. An apolipoprotein A-II polymorphism (-265T/C, rs5082) regulates postprandial response to a saturated fat overload in healthy men. J Nutr. 2007 Sep;137(9):2024-8. doi: 10.1093/jn/137.9.2024.
- Corella D, Peloso G, Arnett DK, Demissie S, Cupples LA, Tucker K, Lai CQ, Parnell LD, Coltell O, Lee YC, Ordovas JM. APOA2, dietary fat, and body mass index: replication of a gene-diet interaction in 3 independent populations. Arch Intern Med. 2009 Nov 9;169(20):1897-906. doi: 10.1001/archinternmed.2009.343.
- Smith CE, Ordovas JM, Sanchez-Moreno C, Lee YC, Garaulet M. Apolipoprotein A-II polymorphism: relationships to behavioural and hormonal mediators of obesity. Int J Obes (Lond). 2012 Jan;36(1):130-6. doi: 10.1038/ijo.2011.24. Epub 2011 Mar 8.
- Corella D, Tai ES, Sorli JV, Chew SK, Coltell O, Sotos-Prieto M, Garcia-Rios A, Estruch R, Ordovas JM. Association between the APOA2 promoter polymorphism and body weight in Mediterranean and Asian populations: replication of a gene-saturated fat interaction. Int J Obes (Lond). 2011 May;35(5):666-75. doi: 10.1038/ijo.2010.187. Epub 2010 Oct 26.
- Corella D, Arnett DK, Tsai MY, Kabagambe EK, Peacock JM, Hixson JE, Straka RJ, Province M, Lai CQ, Parnell LD, Borecki I, Ordovas JM. The -256T>C polymorphism in the apolipoprotein A-II gene promoter is associated with body mass index and food intake in the genetics of lipid lowering drugs and diet network study. Clin Chem. 2007 Jun;53(6):1144-52. doi: 10.1373/clinchem.2006.084863. Epub 2007 Apr 19.
- Tucker KL, Mattei J, Noel SE, Collado BM, Mendez J, Nelson J, Griffith J, Ordovas JM, Falcon LM. The Boston Puerto Rican Health Study, a longitudinal cohort study on health disparities in Puerto Rican adults: challenges and opportunities. BMC Public Health. 2010 Mar 1;10:107. doi: 10.1186/1471-2458-10-107.
- Lai CQ, Wojczynski MK, Parnell LD, Hidalgo BA, Irvin MR, Aslibekyan S, Province MA, Absher DM, Arnett DK, Ordovas JM. Epigenome-wide association study of triglyceride postprandial responses to a high-fat dietary challenge. J Lipid Res. 2016 Dec;57(12):2200-2207. doi: 10.1194/jlr.M069948. Epub 2016 Oct 24.
- DAWBER TR, MEADORS GF, MOORE FE Jr. Epidemiological approaches to heart disease: the Framingham Study. Am J Public Health Nations Health. 1951 Mar;41(3):279-81. doi: 10.2105/ajph.41.3.279. No abstract available.
- Lai CQ, Smith CE, Parnell LD, Lee YC, Corella D, Hopkins P, Hidalgo BA, Aslibekyan S, Province MA, Absher D, Arnett DK, Tucker KL, Ordovas JM. Epigenomics and metabolomics reveal the mechanism of the APOA2-saturated fat intake interaction affecting obesity. Am J Clin Nutr. 2018 Jul 1;108(1):188-200. doi: 10.1093/ajcn/nqy081.
Studie record data
Bestudeer belangrijke data
Studie start (WERKELIJK)
Primaire voltooiing (WERKELIJK)
Studie voltooiing (WERKELIJK)
Studieregistratiedata
Eerst ingediend
Eerst ingediend dat voldeed aan de QC-criteria
Eerst geplaatst (WERKELIJK)
Updates van studierecords
Laatste update geplaatst (WERKELIJK)
Laatste update ingediend die voldeed aan QC-criteria
Laatst geverifieerd
Meer informatie
Termen gerelateerd aan deze studie
Trefwoorden
Andere studie-ID-nummers
- APOA2_SATFAT_META_ANALYSIS
Plan Individuele Deelnemersgegevens (IPD)
Bent u van plan om gegevens van individuele deelnemers (IPD) te delen?
Beschrijving IPD-plan
Informatie over medicijnen en apparaten, studiedocumenten
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd geneesmiddel
Bestudeert een door de Amerikaanse FDA gereguleerd apparaatproduct
Deze informatie is zonder wijzigingen rechtstreeks van de website clinicaltrials.gov gehaald. Als u verzoeken heeft om uw onderzoeksgegevens te wijzigen, te verwijderen of bij te werken, neem dan contact op met register@clinicaltrials.gov. Zodra er een wijziging wordt doorgevoerd op clinicaltrials.gov, wordt deze ook automatisch bijgewerkt op onze website .
Klinische onderzoeken op Body Mass Index
-
Hillel Yaffe Medical CenterOnbekendBody Mass IndexIsraël
-
Assistance Publique - Hôpitaux de ParisVoltooidFysieke activiteit | Body Mass IndexFrankrijk
-
National Cancer Institute (NCI)VoltooidOrale gezondheid | Microbiota | Body Mass IndexVerenigde Staten
-
Centre Hospitalier Durécu LavoisierVoltooidRevalidatie | Totale knieartroplastiek | Body Mass Index
-
IVI MadridVoltooidLeeftijd van de patiënten en de Body Mass Index in beide groepen
-
Cardenal Herrera UniversityVoltooidSpierkracht | Geriatrische beoordeling | Body Mass Index | HoudingsevenwichtSpanje
-
Cairo UniversityNog niet aan het wervenKwaliteit van het leven | Narcose | Body Mass Index | Children With Special Health Care Needs
-
MARCELLUS SIMADIBRATAVoltooidOndervoeding | Voedingsstatus | Body Mass Index | Voedingsbeoordeling | Handkracht | ZiekenhuisIndonesië
-
The University of Texas Health Science Center,...National Cancer Institute (NCI)WervingSuikerziekte | Verhoogde Body Mass IndexVerenigde Staten
-
Virginia Commonwealth UniversityAanmelden op uitnodiging
Klinische onderzoeken op Geen, cohortstudies
-
Y Biologics Inc.Novotech (Australia) Pty LimitedActief, niet wervendGeavanceerde solide tumorenKorea, republiek van, Thailand, Australië
-
Institut du Cancer de Montpellier - Val d'AurelleNog niet aan het werven
-
Kangabio AUSTRALIA LTD PTYNog niet aan het wervenGevorderde of gemetastaseerde solide tumorenAustralië
-
MedImmune LLCVoltooidGezondVerenigde Staten, Australië, Spanje, Duitsland, Canada, Finland, Zuid-Afrika, Brazilië, Israël
-
XOMA (US) LLCVoltooidAangeboren hyperinsulinismeVerenigd Koninkrijk, Verenigde Staten
-
AstraZenecaActief, niet wervendCOVID-19, SARS-CoV-2Japan
-
Alopexx Vaccine, LLCVoltooidPNAG tot expressie brengend vaccin tegen pathogene microbenVerenigde Staten
-
PfizerVoltooid
-
Centre Leon BerardThe Biostatistics and Therapy Evaluation Unit; BEC (Department of Clinical Sciences)VoltooidBorstkanker | LongkankerFrankrijk