Predisposição genética para formas graves de COVID-19 (infecção por SARS-CoV2) (COVIDGEN)

O principal objetivo desta parte do projeto é identificar os fatores genéticos germinativos que discriminam as formas benignas e graves da infecção por SARS-CoV2 (CoVID-19) no contexto da atual epidemia de SARS-CoV2 (HCOVID-19). Os argumentos científicos do projeto estão descritos no ANEXO. Nossa hipótese é que variantes patogênicas em genes que codificam fatores cruciais envolvidos na interação HOST PATHOGEN poderiam explicar a suscetibilidade de alguns pacientes à doença grave, mesmo na ausência de comorbidades. O desafio é identificar aqueles dos fatores genéticos que podem estar relacionados com problemas respiratórios e potencialmente mais mortes. Com base em nossa experiência anterior em sarcoidose, uma doença multifatorial que predispõe a infecções oportunistas, focaremos particularmente a regulação da apoptose e autofagia, resposta imune à infecção viral e resposta ao estresse do retículo endoplasmático (ER STRESS), que está intimamente ligada à apoptose. Defeitos genéticos nessas vias podem diminuir a depuração de partículas virais e induzir a invasão progressiva pelo SARS-CoV2 e a destruição do parênquima pulmonar. Nossa estratégia será semelhante à descrita em nossos estudos anteriores sobre sarcoidose, recentemente publicados. Combinaremos uma análise comparativa de genótipos por SEQUENCIAMENTO DE EXOME (WES) de formas benignas e graves de infecção por SARS-CoV2 por meio de subgrupos clínicos definidos pelos especialistas em doenças infecciosas e uma análise bioinformática das redes funcionais identificadas pelo painel de genes que compartilham variantes patogênicas e discriminar as formas graves das doenças. Os dados do WES serão cuidadosamente analisados ​​e relacionados a todo o processo fisiológico intracelular e também às vias funcionais envolvidas na interação patógeno-hospedeiro: alvos virais na superfície celular e sinalização downstream, replicação e tradução do RNA genômico viral, produção e liberação de novas partículas virais . Finalmente, nossos principais objetivos são a definição de um painel de genes mais especificamente relacionado a formas graves de infecção e a caracterização de vias defeituosas envolvidas em formas pejorativas da doença SARS-COv2 para identificar possíveis alvos terapêuticos.