Predisposición genética a formas graves de COVID-19 (infección por SARS-CoV2) (COVIDGEN)

El objetivo principal de esta parte del proyecto es identificar los factores genéticos de línea germinal que discriminan las formas benignas y graves de infección por SARS-CoV2 (CoVID-19) en el contexto de la epidemia actual de SARS-CoV2 (HCOVID-19). Los argumentos científicos del proyecto se describen en el ANEXO. Presumimos que las variantes patogénicas en genes que codifican factores cruciales involucrados en la interacción HOST PATHOGEN podrían explicar la susceptibilidad de algunos pacientes a la enfermedad grave, incluso en ausencia de comorbilidades. El desafío es identificar aquellos de los factores genéticos que pueden estar relacionados con la dificultad respiratoria y potencialmente con una mayor muerte. Basándonos en nuestra experiencia previa en sarcoidosis, una enfermedad multifactorial que predispone a infecciones oportunistas, nos centraremos particularmente en la regulación de la apoptosis y la autofagia, la respuesta inmune a la infección viral y la respuesta al estrés del retículo endoplásmico (ER STRESS) que está estrechamente relacionada con la apoptosis. Los defectos genéticos en dichas vías pueden disminuir la eliminación de partículas virales e inducen la invasión progresiva por parte del SARS-CoV2 y la destrucción del parénquima pulmonar. Nuestra estrategia será similar a la descrita en nuestros estudios previos sobre sarcoidosis, recientemente publicados. Combinaremos un análisis comparativo de genotipos por SECUENCIACIÓN DEL EXOMA COMPLETO (WES) de formas benignas y graves de infección por SARS-CoV2 a través de subgrupos clínicos definidos por los expertos en enfermedades infecciosas y un análisis bioinformático de las redes funcionales identificadas por el panel de genes que comparten variantes patogénicas. y discriminar las formas graves de las enfermedades. Los datos WES se analizarán cuidadosamente y se relacionarán con todo el proceso fisiológico intracelular y también con las vías funcionales involucradas en la interacción huésped-patógeno: objetivos virales en la superficie celular y señalización posterior, replicación y traducción del ARN genómico viral, producción y liberación de nuevas partículas virales. . Finalmente, nuestros objetivos principales son la definición de un panel de genes más específicamente relacionados con formas graves de infección y la caracterización de vías defectuosas involucradas en formas peyorativas de la enfermedad por SARS-COv2 para identificar posibles dianas terapéuticas.