Detecção de patógenos em crianças infectadas pelo HIV com doenças febris não relacionadas à malária usando sequenciamento metagenômico (PHICAMS)

Os testes de diagnóstico rápido (RDTs) para a malária destacaram a proporção decrescente de doenças atribuíveis à malária em áreas endêmicas. Infelizmente, uma vez excluída a malária, existem poucas ferramentas de diagnóstico acessíveis para orientar o manejo de doenças febris graves em locais com poucos recursos. RDTs para infecções tropicais não maláricas atualmente dependem da detecção de anticorpos do hospedeiro contra um único agente infeccioso, mas suas sensibilidades e especificidades são inerentemente limitadas. Deve-se notar que as causas de doenças febris não relacionadas à malária (NMFIs) em crianças infectadas pelo HIV em Uganda permanecem escassas. Há orientação mínima sobre como lidar com crianças infectadas pelo HIV com NMFIs. Assim, é importante que outras causas de febre em crianças africanas sejam melhor caracterizadas para facilitar a otimização dos algoritmos diagnósticos e terapêuticos.

Considerando essas limitações, há uma necessidade premente de abordagens baseadas na detecção de patógenos sensíveis, como o sequenciamento metagenômico shotgun (sMGS). Em última análise, em um futuro próximo, a integração de abordagens baseadas em todo o genoma, como tecnologias de sequenciamento de leitura longa para febres tropicais, é urgentemente necessária para melhorar o gerenciamento de infecções graves e tratáveis, especialmente entre os grupos vulneráveis, como crianças e adolescentes infectados pelo HIV que apresentam com NMFIs.

Este projeto visa utilizar sMGS para caracterizar patógenos microbianos em crianças e adolescentes ugandenses infectados pelo HIV internados na Baylor College of Medicine Children's Foundation - Uganda com NMFIs e apresentações clínicas ou comorbidades associadas.