- ICH GCP
- US-Register für klinische Studien
- Klinische Studie NCT05085158
Pathogen-Nachweis bei HIV-infizierten Kindern mit Nicht-Malaria-Fiebererkrankungen unter Verwendung von metagenomischer Sequenzierung (PHICAMS)
Pathogen-Nachweis bei HIV-infizierten Kindern und Jugendlichen mit nicht-malariabedingten Fiebererkrankungen unter Verwendung eines metagenomischen Next-Generation-Sequencing-Ansatzes in Uganda
Studienübersicht
Status
Bedingungen
Detaillierte Beschreibung
Schnelldiagnostische Tests (RDTs) für Malaria haben den abnehmenden Anteil von Malaria-bedingten Krankheiten in endemischen Gebieten hervorgehoben. Sobald Malaria ausgeschlossen ist, gibt es leider nur wenige zugängliche diagnostische Instrumente, um die Behandlung schwerer fieberhafter Erkrankungen in Umgebungen mit geringen Ressourcen zu steuern. RDTs für Tropeninfektionen ohne Malaria beruhen derzeit auf dem Nachweis von Wirtsantikörpern gegen einen einzigen Infektionserreger, ihre Sensitivitäten und Spezifitäten sind jedoch von Natur aus begrenzt. Es sollte beachtet werden, dass die Ursachen für fieberhafte Nicht-Malaria-Erkrankungen (NMFIs) bei HIV-infizierten Kindern in Uganda nach wie vor rar sind. Es gibt nur wenige Anleitungen zum Umgang mit HIV-infizierten Kindern mit NMFIs. Daher ist es wichtig, dass andere Ursachen für Fieber bei afrikanischen Kindern besser charakterisiert werden, um die Optimierung diagnostischer und therapeutischer Algorithmen zu erleichtern.
In Anbetracht dieser Einschränkungen besteht ein dringender Bedarf an sensitiven Ansätzen zum Nachweis von Krankheitserregern wie der Shotgun-Metagenomik-Sequenzierung (sMGS). Letztendlich ist in naher Zukunft die Integration von auf dem gesamten Genom basierenden Ansätzen wie Long-Read-Sequenzierungstechnologien für Tropenfieber dringend erforderlich, um das Management schwerer und behandelbarer Infektionen zu verbessern, insbesondere bei gefährdeten Gruppen wie HIV-infizierten Kindern und Jugendlichen NMFIs.
Dieses Projekt zielt darauf ab, sMGS zu nutzen, um mikrobielle Krankheitserreger bei HIV-infizierten ugandischen Kindern und Jugendlichen zu charakterisieren, die an der Baylor College of Medicine Children's Foundation - Uganda mit NMFIs und damit verbundenen klinischen Präsentationen oder Komorbiditäten aufgenommen wurden.
Studientyp
Einschreibung (Geschätzt)
Kontakte und Standorte
Studienorte
-
-
-
Mulago, Uganda, 256
- Baylor College of Medicine Children's Foundation-Uganda
-
-
Teilnahmekriterien
Zulassungskriterien
Studienberechtigtes Alter
Akzeptiert gesunde Freiwillige
Probenahmeverfahren
Studienpopulation
Beschreibung
Einschlusskriterien:
Die Studienpopulation wird insgesamt 200 (100 im Alter von <5 Jahren und 100 im Alter von 6 bis 14 Jahren, einschließlich einer gleichen Anzahl weiblicher und männlicher Studienteilnehmer) HIV-infizierte ugandische Kinder und Jugendliche umfassen, die mit fieberhaften Erkrankungen ohne Malaria aufgenommen werden (NMFIs) an die Kinderstiftung des Baylor College of Medicine – Uganda.
Ausschlusskriterien:
Schwerkranke Patienten werden nicht rekrutiert.
Studienplan
Wie ist die Studie aufgebaut?
Designdetails
- Beobachtungsmodelle: Kohorte
- Zeitperspektiven: Querschnitt
Kohorten und Interventionen
Gruppe / Kohorte |
|---|
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Gruppe 1
HIV-infizierte Kinder mit fieberhaften Erkrankungen ohne Malaria (NMFIs) unter 5 Jahren
|
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Gruppe 2
HIV-infizierte Kinder und Jugendliche mit fieberhaften Erkrankungen ohne Malaria (NMFIs), die jünger als 15 Jahre sind
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Was misst die Studie?
Primäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Prävalenz von mikrobiellen Krankheitserregern bei NMFIs HIV-infizierten Kindern und Jugendlichen
Zeitfenster: 36 Monate
|
Mikrobielle Krankheitserreger bei NMFIs HIV-infizierter Kinder und Jugendlicher in Uganda
|
36 Monate
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Sekundäre Ergebnismessungen
Ergebnis Maßnahme |
Maßnahmenbeschreibung |
Zeitfenster |
|---|---|---|
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Prävalente Komorbiditäten bei NMFIs HIV-infizierten Kindern und Jugendlichen
Zeitfenster: 36 Monate
|
Komorbiditäten bei NMFIs HIV-infizierten Kindern und Jugendlichen in Uganda
|
36 Monate
|
Mitarbeiter und Ermittler
Sponsor
Ermittler
- Hauptermittler: Gerald Mboowa, PhD, Infectious Diseases Institute, Makerere University
Publikationen und hilfreiche Links
Allgemeine Veröffentlichungen
- Pokharel S, White LJ, Aguas R, Celhay O, Pelle KG, Dittrich S. Algorithm in the Diagnosis of Febrile Illness Using Pathogen-specific Rapid Diagnostic Tests. Clin Infect Dis. 2020 May 23;70(11):2262-2269. doi: 10.1093/cid/ciz665.
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- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
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- Naccache SN, Federman S, Veeraraghavan N, Zaharia M, Lee D, Samayoa E, Bouquet J, Greninger AL, Luk KC, Enge B, Wadford DA, Messenger SL, Genrich GL, Pellegrino K, Grard G, Leroy E, Schneider BS, Fair JN, Martinez MA, Isa P, Crump JA, DeRisi JL, Sittler T, Hackett J Jr, Miller S, Chiu CY. A cloud-compatible bioinformatics pipeline for ultrarapid pathogen identification from next-generation sequencing of clinical samples. Genome Res. 2014 Jul;24(7):1180-92. doi: 10.1101/gr.171934.113. Epub 2014 Jun 4.
- Kalantar KL, Carvalho T, de Bourcy CFA, Dimitrov B, Dingle G, Egger R, Han J, Holmes OB, Juan YF, King R, Kislyuk A, Lin MF, Mariano M, Morse T, Reynoso LV, Cruz DR, Sheu J, Tang J, Wang J, Zhang MA, Zhong E, Ahyong V, Lay S, Chea S, Bohl JA, Manning JE, Tato CM, DeRisi JL. IDseq-An open source cloud-based pipeline and analysis service for metagenomic pathogen detection and monitoring. Gigascience. 2020 Oct 15;9(10):giaa111. doi: 10.1093/gigascience/giaa111.
- Gyarmati P, Kjellander C, Aust C, Song Y, Ohrmalm L, Giske CG. Metagenomic analysis of bloodstream infections in patients with acute leukemia and therapy-induced neutropenia. Sci Rep. 2016 Mar 21;6:23532. doi: 10.1038/srep23532.
- Kwak J, Park J. What we can see from very small size sample of metagenomic sequences. BMC Bioinformatics. 2018 Nov 3;19(1):399. doi: 10.1186/s12859-018-2431-8.
Studienaufzeichnungsdaten
Haupttermine studieren
Studienbeginn (Tatsächlich)
Primärer Abschluss (Geschätzt)
Studienabschluss (Geschätzt)
Studienanmeldedaten
Zuerst eingereicht
Zuerst eingereicht, das die QC-Kriterien erfüllt hat
Zuerst gepostet (Tatsächlich)
Studienaufzeichnungsaktualisierungen
Letztes Update gepostet (Tatsächlich)
Letztes eingereichtes Update, das die QC-Kriterien erfüllt
Zuletzt verifiziert
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Schlüsselwörter
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- EDCTP - TMA2020CDF-3159
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Beschreibung des IPD-Plans
Arzneimittel- und Geräteinformationen, Studienunterlagen
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Arzneimittelprodukt
Studiert ein von der US-amerikanischen FDA reguliertes Geräteprodukt
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