- ICH GCP
- Registr klinických studií v USA
- Klinická studie NCT05085158
Detekce patogenu u dětí infikovaných HIV s nonmalarickým horečnatým onemocněním pomocí metagenomického sekvenování (PHICAMS)
Detekce patogenu u dětí a dospívajících infikovaných HIV s nonmalarickým horečnatým onemocněním pomocí metagenomického přístupu sekvenování nové generace v Ugandě
Přehled studie
Postavení
Podmínky
Detailní popis
Rychlé diagnostické testy (RDT) na malárii poukázaly na klesající podíl onemocnění způsobených malárií v endemických oblastech. Bohužel, jakmile je malárie vyloučena, existuje jen málo dostupných diagnostických nástrojů, které by vedly k léčbě závažných horečnatých onemocnění v prostředí s nízkými zdroji. RDT pro nemalarické tropické infekce v současné době spoléhají na detekci protilátek hostitele proti jedinému infekčnímu agens, ale jejich citlivost a specifita jsou ze své podstaty omezené. Je třeba poznamenat, že příčiny nemalárních horečnatých onemocnění (NMFI) u dětí infikovaných HIV v Ugandě zůstávají vzácné. Existuje minimální návod, jak zvládat HIV infikované děti s NMFI. Je tedy důležité, aby byly lépe charakterizovány další příčiny horečky u afrických dětí, aby se usnadnila optimalizace diagnostických a terapeutických algoritmů.
Vzhledem k těmto omezením existuje naléhavá potřeba citlivých přístupů založených na detekci patogenů, jako je metagenomické sekvenování pomocí brokovnice (sMGS). Nakonec je v blízké budoucnosti naléhavě zapotřebí integrace přístupů založených na celém genomu, jako jsou technologie sekvenování s dlouhým čtením do tropických horeček, aby se zlepšilo zvládání těžkých a léčitelných infekcí, zejména u zranitelných skupin, jako jsou děti a mladiství infikovaní HIV. NMFIs.
Tento projekt si klade za cíl využít sMGS k charakterizaci mikrobiálních patogenů u HIV infikovaných ugandských dětí a dospívajících přijatých do Baylor College of Medicine Children's Foundation - Uganda s NMFI a souvisejícími klinickými projevy nebo komorbiditami.
Typ studie
Zápis (Odhadovaný)
Kontakty a umístění
Studijní místa
-
-
-
Mulago, Uganda, 256
- Baylor College of Medicine Children's Foundation-Uganda
-
-
Kritéria účasti
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
Přijímá zdravé dobrovolníky
Metoda odběru vzorků
Studijní populace
Popis
Kritéria pro zařazení:
Populace studie bude zahrnovat celkem 200 (100, kterým je méně než 5 let, a 100, kteří jsou ve věku 6 až 14 let, včetně stejného počtu žen a mužů, účastníků studie) HIV infikovaných ugandských dětí a dospívajících přijatých s nemalorickým horečnatým onemocněním (NMFIs) do Baylor College of Medicine Children's Foundation - Uganda.
Kritéria vyloučení:
Kriticky nemocní pacienti nebudou přijímáni.
Studijní plán
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Kohorta
- Časové perspektivy: Průřezový
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
|---|
|
Skupina 1
HIV-infikované děti s nonmalarickým horečnatým onemocněním (NMFI) mladší než 5 let
|
|
Skupina 2
HIV infikované děti a mladiství s nonmalarickým horečnatým onemocněním (NMFI), ale mladší 15 let
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Prevalence mikrobiálních patogenů u NMFIs HIV infikovaných dětí a dospívajících
Časové okno: 36 měsíců
|
Mikrobiální patogeny v NMFI HIV infikovaných dětí a dospívajících v Ugandě
|
36 měsíců
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Převládající komorbidity u NMFIs HIV infikovaných dětí a dospívajících
Časové okno: 36 měsíců
|
Komorbidity u NMFI HIV infikovaných dětí a dospívajících v Ugandě
|
36 měsíců
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Sponzor
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: Gerald Mboowa, PhD, Infectious Diseases Institute, Makerere University
Publikace a užitečné odkazy
Obecné publikace
- Pokharel S, White LJ, Aguas R, Celhay O, Pelle KG, Dittrich S. Algorithm in the Diagnosis of Febrile Illness Using Pathogen-specific Rapid Diagnostic Tests. Clin Infect Dis. 2020 May 23;70(11):2262-2269. doi: 10.1093/cid/ciz665.
- Ramesh A, Nakielny S, Hsu J, Kyohere M, Byaruhanga O, de Bourcy C, Egger R, Dimitrov B, Juan YF, Sheu J, Wang J, Kalantar K, Langelier C, Ruel T, Mpimbaza A, Wilson MR, Rosenthal PJ, DeRisi JL. Metagenomic next-generation sequencing of samples from pediatric febrile illness in Tororo, Uganda. PLoS One. 2019 Jun 20;14(6):e0218318. doi: 10.1371/journal.pone.0218318. eCollection 2019.
- Maze MJ, Bassat Q, Feasey NA, Mandomando I, Musicha P, Crump JA. The epidemiology of febrile illness in sub-Saharan Africa: implications for diagnosis and management. Clin Microbiol Infect. 2018 Aug;24(8):808-814. doi: 10.1016/j.cmi.2018.02.011. Epub 2018 Feb 15.
- Decuypere S, Maltha J, Deborggraeve S, Rattray NJ, Issa G, Berenger K, Lompo P, Tahita MC, Ruspasinghe T, McConville M, Goodacre R, Tinto H, Jacobs J, Carapetis JR. Towards Improving Point-of-Care Diagnosis of Non-malaria Febrile Illness: A Metabolomics Approach. PLoS Negl Trop Dis. 2016 Mar 4;10(3):e0004480. doi: 10.1371/journal.pntd.0004480. eCollection 2016 Mar.
- Pondei, Kemebradikumo, Onyaye E. Kunle-Olowu, and Oliemen Peterside.
- https://www.unaids.org/en/resources/presscentre/featurestories/2019/december/uganda-treating-hiv-positive-children-speed-and-skill
- Miller S, Naccache SN, Samayoa E, Messacar K, Arevalo S, Federman S, Stryke D, Pham E, Fung B, Bolosky WJ, Ingebrigtsen D, Lorizio W, Paff SM, Leake JA, Pesano R, DeBiasi R, Dominguez S, Chiu CY. Laboratory validation of a clinical metagenomic sequencing assay for pathogen detection in cerebrospinal fluid. Genome Res. 2019 May;29(5):831-842. doi: 10.1101/gr.238170.118. Epub 2019 Apr 16.
- Schlaberg R, Chiu CY, Miller S, Procop GW, Weinstock G; Professional Practice Committee and Committee on Laboratory Practices of the American Society for Microbiology; Microbiology Resource Committee of the College of American Pathologists. Validation of Metagenomic Next-Generation Sequencing Tests for Universal Pathogen Detection. Arch Pathol Lab Med. 2017 Jun;141(6):776-786. doi: 10.5858/arpa.2016-0539-RA. Epub 2017 Feb 7.
- Moreira-Silva SF, Zandonade E, Frauches DO, Machado EA, Lopes LI, Duque LL, Querido PP, Miranda AE. Comorbidities in children and adolescents with AIDS acquired by HIV vertical transmission in Vitoria, Brazil. PLoS One. 2013 Dec 4;8(12):e82027. doi: 10.1371/journal.pone.0082027. eCollection 2013.
- Gu W, Miller S, Chiu CY. Clinical Metagenomic Next-Generation Sequencing for Pathogen Detection. Annu Rev Pathol. 2019 Jan 24;14:319-338. doi: 10.1146/annurev-pathmechdis-012418-012751. Epub 2018 Oct 24.
- Naccache SN, Federman S, Veeraraghavan N, Zaharia M, Lee D, Samayoa E, Bouquet J, Greninger AL, Luk KC, Enge B, Wadford DA, Messenger SL, Genrich GL, Pellegrino K, Grard G, Leroy E, Schneider BS, Fair JN, Martinez MA, Isa P, Crump JA, DeRisi JL, Sittler T, Hackett J Jr, Miller S, Chiu CY. A cloud-compatible bioinformatics pipeline for ultrarapid pathogen identification from next-generation sequencing of clinical samples. Genome Res. 2014 Jul;24(7):1180-92. doi: 10.1101/gr.171934.113. Epub 2014 Jun 4.
- Kalantar KL, Carvalho T, de Bourcy CFA, Dimitrov B, Dingle G, Egger R, Han J, Holmes OB, Juan YF, King R, Kislyuk A, Lin MF, Mariano M, Morse T, Reynoso LV, Cruz DR, Sheu J, Tang J, Wang J, Zhang MA, Zhong E, Ahyong V, Lay S, Chea S, Bohl JA, Manning JE, Tato CM, DeRisi JL. IDseq-An open source cloud-based pipeline and analysis service for metagenomic pathogen detection and monitoring. Gigascience. 2020 Oct 15;9(10):giaa111. doi: 10.1093/gigascience/giaa111.
- Gyarmati P, Kjellander C, Aust C, Song Y, Ohrmalm L, Giske CG. Metagenomic analysis of bloodstream infections in patients with acute leukemia and therapy-induced neutropenia. Sci Rep. 2016 Mar 21;6:23532. doi: 10.1038/srep23532.
- Kwak J, Park J. What we can see from very small size sample of metagenomic sequences. BMC Bioinformatics. 2018 Nov 3;19(1):399. doi: 10.1186/s12859-018-2431-8.
Termíny studijních záznamů
Hlavní termíny studia
Začátek studia (Aktuální)
Primární dokončení (Odhadovaný)
Dokončení studie (Odhadovaný)
Termíny zápisu do studia
První předloženo
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
První zveřejněno (Aktuální)
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
Naposledy ověřeno
Více informací
Termíny související s touto studií
Další relevantní podmínky MeSH
- RNA virové infekce
- Virová onemocnění
- Infekce
- Infekce přenášené krví
- Přenosné nemoci
- Pohlavně přenosné choroby, virové
- Pohlavně přenosné nemoci
- Lentivirové infekce
- Retroviridae infekce
- Syndromy imunologické nedostatečnosti
- Onemocnění imunitního systému
- Rány a zranění
- Změny tělesné teploty
- Poruchy tepelného stresu
- Urogenitální onemocnění
- Onemocnění genitálií
- HIV infekce
- Hypertermie
- Horečka
Další identifikační čísla studie
- EDCTP - TMA2020CDF-3159
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Popis plánu IPD
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na HIV infekce
-
Jianfeng XieNáborCLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionČína
-
Assiut UniversityZatím nenabírámeCLABSI - Central Line Associated Bloodstream Infection | Periferně zavedený centrální katétr | Pupeční žilní katétr
-
Helsinki University Central HospitalUniversity of Turku; Oulu University Hospital; Kuopio University Hospital; Tampere... a další spolupracovníciNáborHysterektomie | Antibiotika | Infection Post Op | ProfylaktickýFinsko
-
Fundacion Clinic per a la Recerca BiomédicaDokončenoProtheses infectionŠpanělsko
-
Duke UniversityDokončenoCentral Line-associated Bloodstream Infection (CLABSI)Spojené státy
-
Catholic University of the Sacred HeartDokončenoCentral Line-associated Bloodstream Infection (CLABSI)
-
Sinocelltech Ltd.NáborHPV Infection Vaccine Safety SCT1000Čína
-
University of MalayaTeleflexDokončenoCLABSI - Central Line Associated Bloodstream InfectionMalajsie
-
Burdenko Neurosurgery InstituteDokončenoHyperglykémie | Kraniotomie | Infection Post OpItálie, Ruská Federace
-
Princess Maxima Center for Pediatric OncologyUMC Utrecht; Dutch Cancer SocietyNáborCentral Line-associated Bloodstream Infection (CLABSI)Holandsko