Rilevazione di agenti patogeni in bambini con infezione da HIV con malattie febbrili non malariche mediante sequenziamento metagenomico (PHICAMS)

I test diagnostici rapidi (RDT) per la malaria hanno evidenziato la diminuzione della percentuale di malattie attribuibili alla malaria nelle aree endemiche. Sfortunatamente, una volta esclusa la malaria, ci sono pochi strumenti diagnostici accessibili per guidare la gestione di gravi malattie febbrili in contesti con poche risorse. Gli RDT per le infezioni tropicali non malariche attualmente si basano sul rilevamento di anticorpi dell'ospite contro un singolo agente infettivo, ma le loro sensibilità e specificità sono intrinsecamente limitate. Va notato che le cause di malattie febbrili non malariche (NMFI) nei bambini con infezione da HIV in Uganda rimangono scarse. C'è una guida minima su come gestire i bambini con infezione da HIV con NMFI. Pertanto, è importante caratterizzare meglio altre cause di febbre nei bambini africani per facilitare l'ottimizzazione degli algoritmi diagnostici e terapeutici.

Considerando queste limitazioni, vi è un urgente bisogno di approcci sensibili basati sul rilevamento di agenti patogeni come il sequenziamento metagenomico del fucile da caccia (sMGS). In definitiva, nel prossimo futuro, l'integrazione di approcci basati sull'intero genoma come le tecnologie di sequenziamento a lettura lunga per le febbri tropicali è urgentemente necessaria per migliorare la gestione delle infezioni gravi e curabili, specialmente tra i gruppi vulnerabili come i bambini e gli adolescenti con infezione da HIV che presentano NMFI.

Questo progetto mira a utilizzare sMGS per caratterizzare i patogeni microbici nei bambini e negli adolescenti ugandesi con infezione da HIV ammessi alla Baylor College of Medicine Children's Foundation - Uganda con NMFI e presentazioni cliniche associate o comorbidità.