揭示微生物对肠纤维化的影响
揭示微生物对肠纤维化的影响：克罗恩病相关并发症发病机制和治疗的新见解
克罗恩病（CD）属于炎症性肠病类别，是一种可能影响胃肠道任何部位的慢性炎症性疾病。 其特点是肠粘膜的透壁炎症和压倒性的免疫反应，从而导致严重的临床症状。 超过 50% 的 CD 患者因纤维狭窄而出现穿透性或狭窄性疾病，大多数情况下需要手术干预，因为尚未发现有效的治疗方法。 在狭窄性CD的组织学特征中，粘膜肌层和固有肌层增厚是主要标志，这主要是由于多种机制导致间充质细胞过度增殖和粘膜下层富含胶原蛋白的细胞外基质积累增加所致，包括 i) 现有局部成纤维细胞的增殖，以及 ii) 上皮-间质转化和 iii) 内皮-间质转化的诱导。 即使这些粘膜功能的改变主要是由 CD 相关慢性炎症期间发生的持续组织损伤引起的，但最近的报告表明 CD 相关纤维化可能是由炎症无关的触发因素驱动的，例如微生物群失调。
揭示 CD 纤维化的这一方面可能会导致创新治疗策略的开发，最终阻止肠道增厚。
研究概览
详细说明
这是一项横断面观察性研究，涉及在胃肠病中心胃肠病学和消化内窥镜科接受手术的克罗恩病 (CD) (n=15) 患者和非肠道疾病 (IBD) (n=5) 患者。 IRCCS Ospedale San Raffaele）根据护理标准。
标本将在手术过程中收集，不会给患者带来其他风险，因为我们将仅使用病理学家分析后留下的材料。
CD 衍生的手术标本将被处理以获得细胞悬浮液，该细胞悬浮液将被冷冻并储存以供后续细胞分选。 对于非 IBD 组织处理，每个手术标本将被切成两块。 其中一个将被处理以获得要储存的细胞悬浮液，而剩余的组织将被处理以分离固有层成纤维细胞和内皮细胞，以及生成上皮类器官。
Ospedale San Raffaele（OSR - Operative Unit (UO)1 (UO1)）是这项研究的发起人。 参与这项研究的另一个中心是米兰大学（UO2），该中心负责开发用于体外实验的 3D 微流体装置。 患者将仅入组 UO1。
研究类型
注册 (估计的)
联系人和位置
学习联系方式
- 姓名：Federica Ungaro
- 电话号码：0226437864
- 邮箱：ungaro-federica@hsr.it
学习地点
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Milan、意大利
- IRCCS Ospedale San Raffaele
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参与标准
资格标准
适合学习的年龄
- 成人
- 年长者
接受健康志愿者
取样方法
研究人群
20名接受手术的患者：
- 15 名 CD 患者（5 名患者/阶段：B1（炎症性更强，非结构性）、B2（结构性、非穿透性）和 B3（结构性和穿透性）。
患者分层是基于之前根据 TC、RMI 或生态学护理标准进行的分类。 因此，在手术前就知道患者的分类。
- 5 名没有 IBD 相关疾病的患者（例如 憩室炎）
描述
纳入标准：
- ≥18 岁且<70 岁的成年患者
- 所有患者均签署知情同意书
- 鉴于这是一项观察性研究，孕妇和哺乳期患者也可以包括在内
此外，对于 CD 患者：
- 不同阶段的分类：（B1（炎症性更强，非结构化），B2（结构化，非穿透性）和B3（结构化和穿透性）。 患者分层是基于之前根据 TC、RMI 或生态学护理标准进行的分类。
此外，对于非 IBD 患者：
- 接受非 IBD 疾病手术的受试者（例如 憩室炎）按照护理标准
排除标准：
对于 CD 患者：
- 先前未分类为 B1、B2、B3 的 CD 科目
- 患者 <18 岁或 > 70 岁
- 未签署知情同意书的患者
对于非 IBD 患者：
- 患者 <18 岁或 > 70 岁
- 未签署知情同意书的患者
学习计划
研究是如何设计的？
设计细节
队列和干预
团体/队列 |
干预/治疗 |
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克罗恩病 (CD)
15 名 CD 患者（5 名患者/阶段：B1（炎症性更强，非结构性）、B2（结构性、非穿透性）和 B3（结构性和穿透性）。 患者分层是基于之前根据 TC、RMI 或生态学护理标准进行的分类。 因此，在手术前就知道患者的分类。 |
CD 患者和没有 IBD 相关疾病的患者的标本（例如
憩室炎）将在手术期间收集，不会对患者造成其他风险，因为我们将仅使用病理学家分析后留下的材料
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非肠道疾病患者 (no-IBD)
5 名无 IBD 相关疾病的患者（例如
憩室炎）
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CD 患者和没有 IBD 相关疾病的患者的标本（例如
憩室炎）将在手术期间收集，不会对患者造成其他风险，因为我们将仅使用病理学家分析后留下的材料
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研究衡量的是什么？
主要结果指标
结果测量 |
措施说明 |
大体时间 |
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对 CD 和非 IBD 细胞进行流式细胞术、RNAseq、宏转录组学、转录组学和脂质组学
大体时间：1-36个月
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评估细菌因素如何影响不同宿主细胞区室在促纤维化途径和基因激活方面的转录组状态。
细胞将接受 FACS 检测 CD31、EpCam 和 CD90 标记物，分别分离内皮细胞、上皮细胞和成纤维细胞，它们是纤维化过程中众所周知的细胞参与者。
单细胞群将进行文库制备，并通过 ribo-minus RNAseq 以 30M 读取深度进行分析。
将进行用于分析微生物组成的宏转录组学，以及用于确定差异基因表达 (DGE) 和基因集富集分析 (GSEA) 的转录组学。
将使用 Kraken2 计算短杆菌科、柄杆菌科和鞘氨醇单胞菌科衍生因子的相对丰度，以确定 CD 衍生的成纤维细胞、内皮细胞和上皮类器官中的哪些细胞亚型含有纤维化特异性微生物组成。
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1-36个月
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合作者和调查者
研究记录日期
研究主要日期
学习开始 (估计的)
初级完成 (估计的)
研究完成 (估计的)
研究注册日期
首次提交
首先提交符合 QC 标准的
首次发布 (估计的)
研究记录更新
最后更新发布 (估计的)
上次提交的符合 QC 标准的更新
最后验证
更多信息
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