Chemoterapie na methylačních vzorcích v tkáni nádoru prsu korelující s klinickou odezvou a výsledky

U pokročilého karcinomu prsu je často obtížné předpovědět, které pacientky budou příznivě reagovat na systémovou léčbu, aby bylo možné rozhodnout o délce léčby nebo možnostech léčby při minimalizaci expozice toxickým účinkům. Naším cílem je prozkoumat pomocí lokálně pokročilého a metastatického nádoru prsní tkáně a plazmy vzorce metylačního profilu před a po chemoterapii panelu biomarkerů nejčastěji exprimovaných u karcinomu prsu a korelovat je s odpovědí nádoru a výsledkem pacienta.

Naší hypotézou je, že změny metylačního vzoru DNA na počátku a v rané fázi systémové terapie mohou předpovídat odpověď nebo progresi onemocnění, stejně jako přežití. Z dlouhodobého hlediska by se to mohlo ukázat jako klinicky užitečné při omezení expozice neúčinným režimům a umožnění dřívější identifikace účinnější systémové terapie.

Základní biopsie tkáně nádoru prsu se odebírají na začátku a po cyklu 1 docetaxel/ketokonazol. Vzorky plazmy se odebírají na začátku, 24 hodin po cyklu 1 chemoterapie a 24 hodin před cyklem 2. Použije se 30 vzorků pacientů (60 biopsií jádra a 90 vzorků plazmy). Kvantitativní multiplexní methylačně specifická PCR bude použita pro analýzy několika tumor supresorových genů včetně APC1, Cyclin D2, RARB, RASSF1A, Twist, Hin1 a GSTP1. Z těchto dat identifikujeme předběžný genový panel spojený s rakovinou prsu, který po systémové terapii prochází nejvíce změnami v metylaci. Třicet vzorků zdravých tkání zalitých v parafínu ze vzorků z mastektomie a vzorků krve od nepostižených jedinců bude sloužit jako normální kontroly.

Tato předběžná studie může být použita ke stanovení klinické užitečnosti metylace DNA v tkáni a plazmě nádoru prsu jako prediktivní marker pro odpověď na chemoterapii a prognostický marker pro výsledek pacienta. Pokud je nalezen vztah, můžeme dále studovat, zda má změna metylačního vzorce klinickou užitečnost při ovlivnění terapeutického rozhodování, které lze dále rozšířit na adjuvantní nastavení.