Kemoterapia rintakasvainkudoksen metylaatiomallien suhteen korreloi kliinisen vasteen ja tulosten kanssa

Pitkälle edenneessä rintasyövässä on usein vaikea ennustaa, mitkä potilaat reagoivat myönteisesti systeemiseen hoitoon päättääkseen hoidon kestosta tai vaihtoehdoista samalla kun minimoidaan altistuminen toksisille vaikutuksille. Tavoitteenamme on tutkia paikallisesti edenneen ja metastaattisen rintasyövän kasvainkudoksen ja -plasman avulla rintasyövässä yleisimmin ilmentävien biomarkkereiden metylaatioprofiilimalleja ennen ja jälkeen kemoterapiaa ja korreloida niitä kasvainvasteen ja potilaan lopputulokseen.

Hypoteesimme on, että DNA-metylaatiokuvion muutokset lähtötilanteessa ja varhain systeemisen hoidon aikana voivat ennustaa sairauden vasteen tai etenemisen sekä eloonjäämisen. Pitkällä aikavälillä tämä voisi osoittautua kliinisesti hyödylliseksi tehottomille hoito-ohjelmille altistumisen rajoittamisessa ja tehokkaamman systeemisen hoidon aikaisemman tunnistamisen mahdollistamiseksi.

Rintakasvainkudoksen ydinbiopsiat otetaan alussa ja dosetakseli/ketokonatsolisyklin 1 jälkeen. Plasmanäytteet otetaan lähtötilanteessa, 24 tuntia syklin 1 kemoterapian jälkeen ja 24 tuntia ennen sykliä 2. Käytetään 30 potilaan näytettä (60 ydinbiopsiaa ja 90 plasmanäytettä). Kvantitatiivista multipleksimetylaatiospesifistä PCR:ää käytetään useiden kasvainsuppressorigeenien, mukaan lukien APC1, Cyclin D2, RARB, RASSF1A, Twist, Hin1 ja GSTP1, analyyseihin. Näistä tiedoista tunnistamme rintasyöpään liittyvän alustavan geenipaneelin, jonka metylaatiossa tapahtuu eniten muutoksia systeemisen hoidon jälkeen. Kolmekymmentä parafiiniin upotettua tervettä kudosnäytettä mastektomianäytteistä ja verinäytteitä terveiltä henkilöiltä, ​​joilla ei ole tautia, toimivat normaaleina kontrolleina.

Tätä alustavaa tutkimusta voidaan käyttää DNA-metylaation kliinisen hyödyn määrittämiseen rintakasvainkudoksessa ja plasmassa kemoterapiavasteen ennustavana markkerina ja potilaan lopputuloksen prognostisena markkerina. Jos suhde löydetään, voimme sitten tutkia edelleen, onko metylaatiomallin muutoksella kliinistä hyötyä terapeuttiseen päätöksentekoon, jota voidaan laajentaa edelleen adjuvanttiasetuksiin.