Kemoterapi på metyleringsmönster i brösttumörvävnad som korrelerar med klinisk respons och resultat

Vid avancerad bröstcancer är det ofta svårt att förutsäga vilka patienter som kommer att reagera positivt på systemisk terapi för att besluta om behandlingslängd eller alternativ samtidigt som exponeringen för toxiska effekter minimeras. Vårt mål är att undersöka med hjälp av lokalt avancerad och metastaserad bröstcancertumörvävnad och plasma, metyleringsprofilmönstren före och efter kemoterapi av en panel av biomarkörer som oftast uttrycks i bröstcancer och korrelera dem med tumörsvar och patientresultat.

Vår hypotes är att förändringar i DNA-metyleringsmönster vid baslinjen och tidigt in i en systemisk behandlingskur kan förutsäga sjukdomssvar eller progression såväl som överlevnad. På lång sikt kan detta visa sig vara kliniskt användbart för att begränsa exponeringen för ineffektiva regimer och möjliggöra tidigare identifiering av mer effektiv systemisk terapi.

Kärnbiopsier av brösttumörvävnad tas vid baslinjen och efter cykel 1 av docetaxel/ketokonazol. Plasmaprover tas vid baslinjen, 24 timmar efter cykel 1 kemoterapi och 24 timmar före cykel 2. Trettio patienters prover (60 kärnbiopsier och 90 plasmaprover) kommer att användas. Kvantitativ multiplex metyleringsspecifik PCR kommer att användas för analyser av flera tumörsuppressorgener inklusive APC1, Cyclin D2, RARB, RASSF1A, Twist, Hin1 och GSTP1. Från dessa data kommer vi att identifiera en preliminär genpanel associerad med bröstcancer som genomgår de flesta förändringarna i metylering efter systemisk terapi. Trettio paraffininbäddade friska vävnadsprover från mastektomiprover och blodprover från opåverkade individer kommer att fungera som normala kontroller.

Denna preliminära studie kan användas för att fastställa den kliniska nyttan av DNA-metylering i brösttumörvävnad och plasma som en prediktiv markör för svar på kemoterapi och en prognostisk markör för patientresultat. Om ett samband hittas kan vi sedan ytterligare studera om förändringen i metyleringsmönster har klinisk användbarhet för att påverka terapeutiskt beslutsfattande som kan utökas ytterligare till adjuvansmiljön.