Undersøgelse af, hvordan barndomssvulster og medfødt sygdom udvikler sig

Kræft og nogle medfødte anomalier er forårsaget af ændringer (mutationer) i den genetiske kode (DNA) af celler. Brugen af ​​Next Generation Sequencing (NGS) har gjort det muligt at studere de genetiske ændringer, der understøtter disse sygdomme, genom bred og ved baseparopløsning.

Et nøglespørgsmål om den molekylære patogenese af en række børnetumorer og medfødte anomalier, der forbliver ubesvaret, er rækkefølgen, hvori de forskellige mutationer opstår. For at definere den rækkefølge, som mutationer opstår i, bliver efterforskerne nødt til at rekonstruere livshistorien for individuelle tumorer/anomalier. Dette kan opnås ved at adskille hovedklonen ('forfædres' celle) fra subkloner eller ved at studere flere områder fra den samme læsion. Selvom denne tilgang tillader timing af mutationer til en vis grad, er denne tilgang i barndomstumorer og medfødte læsioner fundamentalt begrænset af manglende evne til at definere embryonale mutationer. Grundlaget for begrænsningen er, at de pågældende læsioner konventionelt sammenlignes med patientens kimlinje (den genetiske information, de har fra fødslen). I en sådan sammenligning vil embryonale mutationer blive fejlklassificeret som enten kimlinje eller somatiske (erhvervet).

For at overvinde denne begrænsning ville man være nødt til at sammenligne læsionen med forældrenes kimlinie.

Derfor foreslår denne undersøgelse her at udføre den første NGS-undersøgelse af børnetumorer og medfødte anomalier med fokus på at definere den embryonale patogenese. Et unikt træk ved denne undersøgelse vil være, at læsioner vil blive sammenlignet med forældrenes kimlinje for at definere embryonale mutationer. Et fokus for analysen vil være at definere den rækkefølge, hvori mutationer opstår.