Indagare su come si sviluppano i tumori infantili e le malattie congenite

I tumori e alcune anomalie congenite sono causati da cambiamenti (mutazioni) nel codice genetico (DNA) delle cellule. L’uso del Next Generation Sequencing (NGS) ha consentito lo studio dei cambiamenti genetici che sono alla base di queste malattie, a livello dell’intero genoma e con risoluzione delle coppie di basi.

Una domanda chiave sulla patogenesi molecolare di una serie di tumori infantili e anomalie congenite che rimane senza risposta è l’ordine in cui si presentano le diverse mutazioni. Per definire l'ordine in cui si presentano le mutazioni, i ricercatori dovranno ricostruire la storia della vita dei singoli tumori/anomalie. Ciò può essere ottenuto separando il clone principale (cellula "ancestrale") dai sub-cloni o studiando più aree della stessa lesione. Sebbene questo approccio consenta in una certa misura la tempistica delle mutazioni, nei tumori infantili e nelle lesioni congenite questo approccio è fondamentalmente limitato dall'incapacità di definire le mutazioni embrionali. La base della limitazione è che le lesioni in questione vengono convenzionalmente paragonate alla linea germinale del paziente (le informazioni genetiche che possiede dalla nascita). In tale confronto le mutazioni embrionali verranno erroneamente classificate come germinali o somatiche (acquisite).

Per superare questa limitazione si dovrebbe confrontare la lesione con la linea germinale parentale.

Pertanto, questo studio si propone di eseguire il primo studio NGS sui tumori infantili e sulle anomalie congenite, concentrandosi sulla definizione della patogenesi embrionale. Una caratteristica unica di questo studio sarà che le lesioni verranno confrontate con la linea germinale parentale per definire le mutazioni embrionali. Uno dei focus dell'analisi sarà quello di definire l'ordine in cui si verificano le mutazioni.