2000 Programa de Asociación de Genómica Funcional Humana del VIH (2000HIV)

Población de estudio Se construirá una cohorte con un total de 2000 pacientes con VIH, compuesta por una cohorte de descubrimiento (n=1200) y una cohorte de confirmación (n=800). Los investigadores estiman una inclusión de 2 años y un período de seguimiento de 2 años y se esforzarán por incluir varios fenotipos clínicos, como no progresores a largo plazo (~2-3%), no respondedores inmunológicos (~3% ), y progresores rápidos (~4-5%) y pacientes del grupo de riesgo clásico, como hombres que tienen sexo con hombres (HSH), mujeres y sujetos del África subsahariana. Los pacientes serán reclutados de los siguientes centros holandeses de tratamiento del VIH: Radboudumc (Nijmegen), Erasmus MC (Rotterdam), OLVG (Amsterdam), Elisabeth Twee-Steden Ziekenhuis (Tilburg).

No se puede proporcionar un cálculo del tamaño de la muestra debido a las frecuencias variables de los diversos rasgos en la interacción genoma-microbioma y su efecto en la producción de citoquinas. Debido a la naturaleza exploratoria de este estudio, el cálculo del tamaño será variable dependiendo del tipo de polimorfismo analizado. Las frecuencias de las diversas clases de microorganismos en el microbioma colonizador no se conocen en nuestra población de estudio y, por lo tanto, es imposible realizar cálculos de potencia.

Estudios anteriores en el Proyecto de Genómica Funcional Humana han evaluado los rasgos del microbioma en 250-500 individuos. Un estudio anterior de HFGP incluyó una cohorte uniforme de 200 personas infectadas por el VIH (todos HSH). El presente estudio también incluirá pacientes infectados por el VIH con un fenotipo más extremo, mujeres y sujetos originarios del África subsahariana. Debido a esto, los investigadores decidieron aumentar la cantidad de personas evaluadas a 2000, lo que consta de una cohorte de descubrimiento de 1200 sujetos y una cohorte de confirmación de 800 participantes.

Visitas de estudio y procedimientos En la inclusión

1. Los investigadores recopilarán metadatos mediante cuestionarios sobre el estilo de vida, la salud y los síntomas clínicos, incluidos los síntomas neuropsiquiátricos. También se recopilarán datos relevantes de los registros de los pacientes en los centros médicos y la Fundación de Monitoreo del VIH.

2. Se valorará la copatología:

   • Se recopilarán puntuaciones de riesgo cardiovascular (puntuación de riesgo D:A:D y puntuación de CVD de Framingham), así como mediciones de ECG y grosor íntima-media (IMT).
   • Evaluación de la enfermedad del hígado graso no alcohólico (NAFLD) mediante ultrasonido hepático y FibroScan.

3. Se extraerá sangre (90 ml):

   • El ADN se aislará para el análisis genético y epigenético.
   • La función del sistema inmunitario se analizará en varios niveles utilizando glóbulos blancos circulantes de sangre venosa.
   • Se analizará el metabolismo y la proteómica.
   • Análisis virológico, caracterizando el reservorio del VIH, la resistencia del VIH y las secuencias virales en el ADN y el ARN circulantes.
4. El análisis del microbioma se realizará en muestras de heces y saliva.
5. Se recolectará una muestra de orina para mediciones de creatinina y microbioma.

Después de 2 años de seguimiento

1. Los investigadores recopilarán metadatos mediante cuestionarios sobre el estilo de vida, la salud y los síntomas clínicos, incluidos los síntomas neuropsiquiátricos. También se recopilarán datos relevantes de los registros de los pacientes en los centros médicos y la Fundación de Monitoreo del VIH.

2. Se valorará la copatología:

   • Se recopilarán puntuaciones de riesgo cardiovascular (puntuación de riesgo D:A:D y puntuación de CVD de Framingham), así como un ECG.
   • Evaluación de la enfermedad del hígado graso no alcohólico (NAFLD) mediante ultrasonido hepático y FibroScan.
3. Se recolectarán muestras de sangre (10 ml) para biomarcadores y análisis de parámetros de infección/inflamación.

Procedimiento de consentimiento informado del paciente Los pacientes siempre serán abordados en primer lugar por un médico tratante o enfermera especializada. Se les proporcionará información y se les preguntará si un médico-investigador puede contactar con el paciente. Si existe consentimiento oral para ello, el investigador se pone en contacto con el paciente en una semana para preguntarle si está interesado en participar en el estudio. el médico-investigador resolverá las dudas que pueda tener el paciente y planificará la primera visita. El procedimiento de consentimiento informado se realizará durante la primera visita del paciente.

Procedimientos de registro de pacientes Todos los datos de los pacientes se registrarán únicamente de forma codificada en una base de datos segura con seguimiento de auditoría y edición (CASTOR EDC). Durante el procedimiento de consentimiento informado, el paciente recibe un código de estudio. Los datos de identificación del paciente y el código del estudio se guardan en un archivo clave protegido con contraseña, al que solo puede acceder el equipo de investigación local. Ningún dato de identificación del paciente saldrá del centro médico local.

En los cuestionarios y eCRF en CASTOR, los investigadores ingresarán tantas verificaciones de datos como sea posible

Biomateriales Todos los biomateriales (sangre, heces, orina, saliva) serán transportados y procesados ​​en el laboratorio de Medicina Interna Experimental de Radboudumc en Nijmegen. Aquí, todo el biomaterial también se almacenará colectivamente. Todos los materiales serán manipulados y almacenados únicamente bajo el código de estudio del paciente.

Monitoreo El monitoreo será realizado por un monitor independiente de acuerdo con las últimas pautas de la Federación Holandesa de Centros Médicos Universitarios. Se programará una visita de iniciación y cierre en forma plenaria con todos los centros de Radboudumc. Habrá una visita extra por centro. Durante estas visitas se verificarán los consentimientos informados, así como los criterios de inclusión y exclusión y la verificación de la fuente de datos en un pequeño subconjunto del total de participantes.

Toma de datos para registro de pacientes

Datos de referencia recopilados de los archivos electrónicos de pacientes o de la HIV Monitoring Foundation durante la visita de inclusión:

Historial médico:

1. Fecha de inclusión
2. Longitud y peso
3. Última presión arterial conocida (y fecha de medición)
4. Fecha de seroconversión (si se conoce)
5. Fecha primera prueba VIH positiva
6. Fecha inicio CART

7. Comportamiento de riesgo de transmisión del VIH:

   • HSH
   • Heterosexual
   • Consumo de drogas inyectables
   • Productos sanguíneos contaminados
   • Desconocido
8. Primer conteo de CD4
9. Nadir de CD4
10. Proporción CD4/CD8 pre-cART
11. Estadio del VIH al inicio del cART según los criterios de los CDC
12. El cenit del ARN del VIH pre-cART

13. Condiciones oportunistas antes de iniciar cART

    • Ninguno
    • BTT
    • Infecciones fúngicas
    • infecciones parasitarias,
    • Infecciones bacterianas

14. Neoplasias malignas antes de iniciar cART

    • Ninguno
    • En caso afirmativo, especifique qué tipo, cuándo y tratamiento

15. Otros problemas médicos conocidos antes de comenzar cART, que requieren tratamiento a largo plazo

    • Ninguno
    • En caso afirmativo, especifique qué tipo, cuándo y tratamiento

16. Carro de respuesta:

    • Periodo entre inicio cART y carga viral < 500 (meses)

    • Cargas virales:

      • Indetectable a las 24 semanas: si/no
      • Número/frecuencia de viremia residual (prueba positiva con señal <50 copias): último año y últimos 5 años
      • Número de blips virales (50-200): último año y últimos 5 años
      • Número de viremia: 200-1000: último año y últimos 5 años
      • Número de cART fallidos (>1000): último año y últimos 5 años
      • Mutaciones asociadas a la resistencia pre-cART y después del fracaso
      • reconstitución de CD4
      • Cociente CD4/CD8 y normalización >1 sí/no tras inicio cART
17. IRIS, sí/no

18. Condiciones oportunistas después de iniciar cART (si se conocen)

    • Ninguno
    • BTT
    • Infecciones fúngicas
    • infecciones parasitarias,
    • Infecciones bacterianas

19. Neoplasias malignas después de iniciar cART (si se conocen)

    • Ninguno
    • En caso afirmativo, especifique qué tipo, cuándo y tratamiento

20. Enfermedades vasculares después de iniciar cART:

    • Ninguno
    • Accidente cerebrovascular/ AIT
    • Angina de pecho
    • Infarto de miocardio
    • Claudicatio intermitentes
    • Tromboembolismo venoso
    • Otro …

21. Así como

    • Ninguno
    • HAV: sí/no, en caso afirmativo: tratamiento y con qué frecuencia

    • VHB:

      • Infectados: infección activa (PCR+) o infección no activa

      • Vacunación: No/Sí

        • Una vez con anti-HBs > 100
        • Vacunación dos veces que conduce a
    • anti-HBs > 100

    • anti-HBs< 100

      • Sin infección
    • VHC: sí/no, en caso afirmativo: tratamiento y frecuencia
    • Lues: sí/no: en caso afirmativo: tratamiento y con qué frecuencia
    • Clamidia/Go: sí/no: en caso afirmativo: tratamiento y frecuencia
    • VPH

22. Infección por COVID-19 antes o después de iniciar cART:

    • ¿Se realizó una prueba de COVID-19 y, de ser así, el tipo de prueba si se conoce (PCR o prueba de antígeno), la fecha de la prueba y el resultado de la prueba de laboratorio para COVID-19 (positivo o negativo)?
    • Resultados serología COVID-19
    • Registrar ingresos hospitalarios relacionados con COVID-19
    • Vacunación COVID-19: tipo y fecha(s)

    • Efectos secundarios de la vacuna contra el COVID-19:

      • Leve: malestar general, fatiga, dolor muscular, dolor en el lugar de la inyección, escalofríos, dolor de cabeza.
      • Moderado: síntomas leves hasta el punto de que se requiere (auto)medicación/alivio del dolor.
      • Grave: fiebre >38,5 grados centígrados y/o uno o más días en cama

23. regímenes cART

    • Razones para cambiar
24. Co-medicación prescrita
25. Lista completa de medicamentos actuales

Examen físico

• Signos del sarcoma de Kaposi
• linfadenopatía
• Para la determinación de los niveles de medicación: ¿cuándo fue la última fecha y hora en que se tomó la medicación para el VIH?
• Otras anomalías: …

Perfil de riesgo cardiovascular:

• Puntajes D:A:D (R) y Framingham
• electrocardiograma

Resultados de laboratorio de la fecha más cercana a la fecha de inclusión (atención estándar al menos una vez al año según las pautas holandesas):

• Cuenta llena de sangre
• Enzimas hepáticas (ALAT, AF, bilirrubina)
• Creatinina
• ARN-VIH
• Recuentos de CD4 y CD8
• Glucosa
• Perfil lipídico
• TPHA/VDRL

• Serología del VHC (para todos los que están en riesgo, como HSH e i.v. drogadictos)

  • Si es positivo, VHC PCR
• Diagnóstico de VPH en mujeres (PAP, PCR)
• Diagnóstico de orina (si está disponible): α1-microglobulina, proteína, albúmina, fosfato, creatinina

Datos de referencia recopilados de archivos electrónicos de pacientes o de la HIV Monitoring Foundation durante la visita de seguimiento de 2 años:

Antecedentes médicos últimos 2 años:

1. Fecha de la visita de seguimiento a los 2 años
2. Peso
3. Última presión arterial conocida (y fecha de medición)

4. Respuesta cART últimos 2 años

   • Número de viremia residual: últimos 2 años
   • Número de brotes virales (20-200): últimos 2 años
   • Número de viremia (200-1000): últimos 2 años
   • Número de cART fallidos (>1000): últimos 2 años
   • recuento de CD4
   • Proporción CD4/CD8 (si se conoce)

5. Condiciones oportunistas últimos 2 años

   • Ninguno
   • BTT
   • Infecciones fúngicas
   • infecciones parasitarias,
   • Infecciones bacterianas

6. Tumores en los últimos 2 años

   • Ninguno
   • En caso afirmativo, especifique qué tipo, cuándo y tratamiento

7. Signos/síntomas de enfermedades cardiovasculares en los últimos 2 años:

   • Ninguno
   • Accidente cerebrovascular/ AIT
   • Angina de pecho
   • Infarto de miocardio
   • Claudicatio intermitentes
   • Tromboembolismo venoso
   • Otro …

8. Nuevas SOA en los últimos 2 años

   • HAV: sí/no, en caso afirmativo: tratamiento y con qué frecuencia

   • VHB:

     • Infectados: infección activa (PCR+), infección no activa,

     • Vacunación: No/Sí

       • Una vez con anti-HBs > 100
       • Vacunación dos veces que conduce a
   • anti-HBs > 100

   • anti-HBs< 100

     • Sin infección
   • VHC: sí/no, en caso afirmativo: tratamiento y frecuencia
   • Lues: sí/no: en caso afirmativo: tratamiento y con qué frecuencia
   • Clamidia/Go: sí/no: en caso afirmativo: tratamiento y frecuencia

9. Infección por COVID-19 antes o después de iniciar cART:

   • ¿Se realizó una prueba de COVID-19 y, de ser así, el tipo de prueba si se conoce (PCR o prueba de antígeno), la fecha de la prueba y el resultado de la prueba de laboratorio para COVID-19 (positivo o negativo)?
   • Resultados serología COVID-19
   • Registrar ingresos hospitalarios relacionados con COVID-19
   • Vacunación COVID-19: tipo y fecha(s)

   • Efectos secundarios de la vacuna contra el COVID-19:

     • Leve: malestar general, fatiga, dolor muscular, dolor en el lugar de la inyección, escalofríos, dolor de cabeza.
     • Moderado: síntomas leves hasta el punto de que se requiere (auto)medicación/alivio del dolor.
     • Grave: fiebre >38,5 grados centígrados y/o uno o más días en cama

10. Regímenes cART en los últimos 2 años

    • Razones para cambiar disponibles en 'Stichting HIV Monitoring'
11. Co-medicación prescrita
12. Lista completa de medicamentos actuales

Examen físico

• Signos del sarcoma de Kaposi
• linfadenopatía
• Para la determinación de los niveles de medicación: ¿cuándo fue la última fecha y hora en que se tomó la medicación para el VIH?
• Otras anomalías: …

Perfil de riesgo cardiovascular:

• Puntajes D:A:D (R) y Framingham
• electrocardiograma

Resultados de laboratorio de la fecha más cercana a la fecha de la visita de seguimiento:

• Cuenta llena de sangre
• Enzimas hepáticas (ALAT, AF, bilirrubina)
• Creatinina
• ARN-VIH
• Recuentos de CD4 y CD8
• Glucosa
• Perfil lipídico
• TPHA/VDRL

• Serología VHC

  o Si es positivo, VHC PCR

• Diagnóstico de VPH en mujeres (PAP, PCR)
• Diagnóstico de orina