2000 HIV ヒト機能ゲノミクス パートナーシップ プログラム (2000HIV)

研究集団 発見コホート（n=1200）と確認コホート（n=800）からなる合計 2000 人の HIV 患者のコホートが構築されます。 研究者は、2 年間の組み入れと 2 年間のフォローアップ期間を推定し、長期非進行者 (~2-3%)、免疫学的非応答者 (~3%) などのいくつかの臨床表現型を含めるよう努めます。 ）、および急速な進行者（〜4〜5％）および男性とセックスする男性（MSM）、女性、およびサハラ以南のアフリカの被験者などの古典的なリスクグループの患者。 患者は次のオランダの HIV 治療センターから募集されます。

サンプルサイズの計算は、ゲノムとマイクロバイオームの相互作用におけるさまざまな形質の頻度が変動し、それらがサイトカイン産生に及ぼす影響のために提供できません。 この研究の探索的性質のため、サイズの計算は、分析される多型のタイプによって異なります。 植民地マイクロバイオームのさまざまな微生物クラスの頻度は、研究集団では不明であるため、検出力の計算を実行することは不可能です。

Human Functional Genomics Project の初期の研究では、250 ～ 500 人のマイクロバイオームの特徴が評価されています。 以前の HFGP 研究には、200 人の HIV 感染者 (すべて MSM) の均一なコホートが含まれていました。 現在の研究には、サハラ以南のアフリカに由来する、より極端な表現型を持つHIV感染患者、女性、および被験者も含まれます。 このため、調査員は、1200 人の被験者の発見コホートと 800 人の参加者の確認コホートで構成される 2000 人にテストされる個人の数を増やすことを決定しました。

研究訪問と手順 組み入れ時

1. 研究者は、ライフスタイル、健康状態、精神神経症状を含む臨床症状に関するアンケートを使用してメタデータを収集します。 関連データは、医療センターと HIV 監視財団の患者記録からも収集されます。

2. 共同病理学が評価されます：

   • 心血管リスク スコア (D:A:D リスク スコアおよび Framingham CVD スコア) が収集されるほか、ECG および内膜 - 中膜の厚さ (IMT) 測定値が収集されます。
   • 肝臓の超音波検査と FibroScan による非アルコール性脂肪肝疾患 (NAFLD) の評価。

3. 血液が採取されます (90 ml):

   • DNA は、遺伝的およびエピジェネティックな分析のために分離されます。
   • 免疫系の機能は、静脈血からの循環白血球を使用していくつかのレベルで分析されます。
   • 代謝とプロテオミクスが分析されます
   • 循環 DNA および RNA 中の HIV リザーバー、HIV 耐性、およびウイルス配列を特徴付けるウイルス学的分析。
4. マイクロバイオーム分析は、便と唾液のサンプルで実行されます。
5. 尿サンプルは、クレアチニン測定およびマイクロバイオームのために収集されます。

2年間のフォローアップ後

1. 研究者は、ライフスタイル、健康状態、精神神経症状を含む臨床症状に関するアンケートを使用してメタデータを収集します。 関連データは、医療センターと HIV 監視財団の患者記録からも収集されます。

2. 共同病理学が評価されます：

   • 心血管リスク スコア (D:A:D リスク スコアおよび Framingham CVD スコア) と ECG が収集されます。
   • 肝臓の超音波検査と FibroScan による非アルコール性脂肪肝疾患 (NAFLD) の評価。
3. 血液サンプル（10ml）は、バイオマーカーおよび感染/炎症パラメータ分析のために収集されます。

患者のインフォームド コンセント手順 患者は常に、担当医または専門の看護師から最初にアプローチされます。 彼らは情報を提供され、医師研究者が患者に連絡してもよいかどうか尋ねられます。 口頭で同意が得られた場合、研究者は 1 週間以内に患者に連絡を取り、研究への参加に関心があるかどうかを尋ねます。 医師兼研究者は、患者が持つ可能性のある質問に答え、最初の訪問を計画します。 インフォームドコンセント手順は、患者の最初の来院時に行われます。

患者登録手順 すべての患者データは、監査および編集証跡 (CASTOR EDC) を備えた安全なデータベースにコード化された形式でのみ記録されます。 インフォームド コンセントの手続き中に、患者には研究コードが与えられます。 識別可能な患者データと研究コードは、パスワードで保護されたキー ファイルに保存され、ローカルの研究チームのみがアクセスできます。 患者を特定するデータが地元の医療センターから出ることはありません。

CASTOR のアンケートと eCRF では、調査員はできるだけ多くのデータ チェックを入力します。

生体材料 すべての生体材料 (血液、便、尿、唾液) は、ナイメーヘンにある Radboudumc の実験的内科の研究室に運ばれ、そこで処理されます。 ここでは、すべての生体材料もまとめて保管されます。 すべての資料は、患者の研究コードの下でのみ処理および保管されます。

モニタリング モニタリングは、オランダ大学医療センター連盟の最新のガイドラインに従って、独立したモニターによって実施されます。 開始と終了の訪問は、Radboudumc のすべてのセンターとの本会議形式で計画されます。 センターごとに1回の追加訪問があります。 これらの訪問中に、参加者全体の小さなサブセットで、インフォームドコンセント、包含および除外基準、およびソースデータの検証がチェックされます。

患者登録のためのデータ収集

インクルージョン訪問中に電子患者ファイルまたは HIV モニタリング財団から収集されたベースライン データ:

病歴：

1. 収録日
2. 長さと重さ
3. 前回の既知の血圧 (および測定日)
4. セロコンバージョン日（わかっている場合）
5. 最初のHIV陽性検査日
6. 開始日

7. HIV感染リスク行動：

   • MSM
   • 異性愛者
   • 薬物使用の注射
   • 汚染された血液製剤
   • 知らない
8. 最初の CD4 カウント
9. CD4 天底
10. CD4/CD8 比率 pre-cART
11. CDC 基準に準拠したスタートカートの HIV スタジアム
12. プリカート HIV RNA ゼニス

13. cART開始前の日和見条件

    • なし
    • マウンテンバイク
    • 真菌感染症
    • 寄生虫感染、
    • 細菌感染症

14. cART開始前の悪性腫瘍

    • なし
    • はいの場合、種類、時期、治療法を明記してください

15. 長期治療を必要とする、cART開始前のその他の既知の医学的問題

    • なし
    • はいの場合、種類、時期、治療法を明記してください

16. 応答カート:

    • cART 開始からウイルス負荷までの期間 < 500 (月)

    • ウイルス負荷:

      • 24 週間後に検出されない: はい/いいえ
      • 残留ウイルス血症の数/頻度 (シグナルが 50 コピー未満の陽性検査): 昨年および過去 5 年間
      • バイラル ブリップの数 (50 ～ 200): 昨年および過去 5 年間
      • ウイルス血症の数: 200-1000: 昨年および過去 5 年間
      • 失敗した cART の数 (>1000): 昨年および過去 5 年間
      • 抵抗性関連変異は、cART前および失敗に続く
      • CD4再構成
      • cART開始後、CD4/CD8比率と正規化>1 はい/いいえ
17. アイリス はい/いいえ

18. cART 開始後の日和見条件 (既知の場合)

    • なし
    • マウンテンバイク
    • 真菌感染症
    • 寄生虫感染、
    • 細菌感染症

19. cART開始後の悪性腫瘍（既知の場合）

    • なし
    • はいの場合、種類、時期、治療法を明記してください

20. cART開始後の血管疾患：

    • なし
    • 脳卒中/TIA
    • 狭心症
    • 心筋梗塞
    • 断続的な跛行
    • 静脈血栓塞栓症
    • 他の …

21. ように

    • なし
    • HAV: はい/いいえ、はいの場合: 治療と頻度

    • HBV:

      • 感染: 活動性感染 (PCR+) または非活動性感染

      • 予防接種: いいえ/はい

        • 抗HBs> 100で1回
        • 2回のワクチン接種につながる
    • 抗HBs> 100

    • 抗HBs<100

      • 感染なし
    • HCV: はい/いいえ、はいの場合: 治療とその頻度
    • 根拠: はい/いいえ: はいの場合: 治療とその頻度
    • クラミジア/Go: はい/ いいえ: はいの場合: 治療とその頻度
    • HPV

22. cART開始前または開始後のCOVID-19感染:

    • COVID-19 検査は実施されましたか、また実施された場合は検査の種類 (PCR または抗原検査)、検査日、および COVID-19 の臨床検査の結果 (陽性または陰性)
    • COVID-19 血清検査結果
    • COVID-19 関連の入院を登録する
    • COVID-19 ワクチン接種: 種類と日付

    • COVID-19 ワクチン接種の副作用:

      • 軽度：全身倦怠感、疲労感、筋肉痛、注射部位の痛み、震え、頭痛。
      • 中程度: 軽度の症状から拡張 (自己) 投薬/鎮痛が必要です。
      • 重度：摂氏38.5度以上の発熱および/または1日以上の寝たきり

23. カート体制

    • 切り替えの理由
24. 処方された併用薬
25. 完全な現在の投薬リスト

身体検査

• カポジ肉腫の徴候
• リンパ節腫脹
• 投薬レベルの決定: HIV 投薬が最後に行われたのはいつですか?
• その他の異常: …

心血管リスクプロファイル:

• D:A:D (R) と Framingham スコア
• 心電図

組み入れ日に最も近い日付の検査結果 (オランダのガイドラインに従って、少なくとも年に 1 回の標準治療):

• 完全な血球数
• 肝酵素（ALAT、AF、ビリルビン）
• クレアチニン
• HIV-RNA
• CD4 および CD8 カウント
• グルコース
• 脂質プロファイル
• TPHA/VDRL

• HCV 血清学 (MSM や i.v. 薬物使用者)

  • 陽性の場合、HCV PCR
• 女性の HPV 診断 (PAP、PCR)
• 尿検査（利用可能な場合）：α1-ミクログロブリン、タンパク質、アルブミン、リン酸塩、クレアチニン

2年間のフォローアップ訪問中に電子患者ファイルまたはHIVモニタリング財団から収集されたベースラインデータ:

過去 2 年間の病歴:

1. 2年間のフォローアップ訪問日
2. 重さ
3. 前回の既知の血圧 (および測定日)

4. 過去 2 年間の応答カート

   • 残存ウイルス血症の数: 過去 2 年間
   • バイラル ブリップの数 (20-200): 過去 2 年間
   • ウイルス血症の数 (200-1000): 過去 2 年間
   • 失敗した cART の数 (>1000): 過去 2 年間
   • CD4 カウント
   • CD4/CD8 比率 (既知の場合)

5. 日和見状態が 2 年間続く

   • なし
   • マウンテンバイク
   • 真菌感染症
   • 寄生虫感染、
   • 細菌感染症

6. 過去2年間の悪性腫瘍

   • なし
   • はいの場合、種類、時期、治療法を明記してください

7. 過去 2 年間の心血管疾患の徴候/症状:

   • なし
   • 脳卒中/TIA
   • 狭心症
   • 心筋梗塞
   • 断続的な跛行
   • 静脈血栓塞栓症
   • 他の …

8. 過去 2 年間の新しい SOA

   • HAV: はい/いいえ、はいの場合: 治療と頻度

   • HBV:

     • 感染: 活動性感染 (PCR+)、非活動性感染、

     • 予防接種: いいえ/はい

       • 抗HBs> 100で1回
       • 2回のワクチン接種につながる
   • 抗HBs> 100

   • 抗HBs<100

     • 感染なし
   • HCV: はい/いいえ、はいの場合: 治療とその頻度
   • 根拠: はい/いいえ: はいの場合: 治療とその頻度
   • クラミジア/Go: はい/ いいえ: はいの場合: 治療とその頻度

9. cART開始前または開始後のCOVID-19感染:

   • COVID-19 検査は実施されましたか、また実施された場合は検査の種類 (PCR または抗原検査)、検査日、および COVID-19 の臨床検査の結果 (陽性または陰性)
   • COVID-19 血清検査結果
   • COVID-19 関連の入院を登録する
   • COVID-19 ワクチン接種: 種類と日付

   • COVID-19 ワクチン接種の副作用:

     • 軽度：全身倦怠感、疲労感、筋肉痛、注射部位の痛み、震え、頭痛。
     • 中程度: 軽度の症状から拡張 (自己) 投薬/鎮痛が必要です。
     • 重度：摂氏38.5度以上の発熱および/または1日以上の寝たきり

10. 過去 2 年間の cART 体制

    • 「Stichting HIV Monitoring」から入手できる切り替えの理由
11. 処方された併用薬
12. 完全な現在の投薬リスト

身体検査

• カポジ肉腫の徴候
• リンパ節腫脹
• 投薬レベルの決定: HIV 投薬が最後に行われたのはいつですか?
• その他の異常: …

心血管リスクプロファイル:

• D:A:D (R) と Framingham スコア
• 心電図

フォローアップ訪問日に最も近い日付の検査結果:

• 完全な血球数
• 肝酵素（ALAT、AF、ビリルビン）
• クレアチニン
• HIV-RNA
• CD4 および CD8 カウント
• グルコース
• 脂質プロファイル
• TPHA/VDRL

• HCV血清学

  o 陽性の場合、HCV PCR

• 女性の HPV 診断 (PAP、PCR)
• 尿診断