2000 HIV Human Functional Genomics Partnership Program (2000HIV)

Vizsgálati populáció Összesen 2000 HIV-betegből álló kohorsz kerül felépítésre, amely egy felfedezési kohorszból (n=1200) és egy megerősítő kohorszból (n=800) áll. A kutatók 2 éves bevonási és 2 éves követési időszakot becsülnek, és több klinikai fenotípus bevonására fognak törekedni, mint például a hosszú távú nem-progresszorok (~2-3%), immunológiailag nem reagálók (~3%). ), valamint a gyors progressziójú (~4-5%) és a klasszikus kockázati csoportba tartozó betegek, például férfiakkal szexelnek (MSM), nők és szubszaharai Afrikából származó alanyok. A betegeket a következő holland HIV-kezelési központokból veszik fel: Radboudumc (Nijmegen), Erasmus MC (Rotterdam), OLVG (Amszterdam), Elisabeth Twee-Steden Ziekenhuis (Tilburg).

A genom-mikrobióm kölcsönhatásban a különböző tulajdonságok változó gyakorisága és a citokintermelésre gyakorolt ​​hatása miatt mintanagyság-számítás nem végezhető. A tanulmány feltáró jellege miatt a méretszámítás az elemzett polimorfizmus típusától függően változó lesz. A kolonizáló mikrobiomban a különböző mikroorganizmus-osztályok gyakorisága nem ismert a mi vizsgálati populációnkban, ezért teljesítményszámítások nem végezhetők.

A Human Functional Genomics Project korábbi tanulmányai 250-500 egyén mikrobióma jellemzőit értékelték. Egy korábbi HFGP-vizsgálat 200 HIV-fertőzött egyénből álló egységes csoportot foglalt magában (mind MSM). A jelen tanulmányban extrémebb fenotípusú HIV-fertőzött betegek, nők és a Szaharától délre fekvő Afrikából származó alanyok is részt vesznek. Emiatt a vizsgálók úgy döntöttek, hogy 2000-re növelik a tesztelt egyének számát, amely egy 1200 alanyból álló felfedezési kohorszból és egy 800 résztvevőből álló megerősítő csoportból áll.

Tanulmányutak és eljárások Befogadáskor

1. A kutatók kérdőívek segítségével gyűjtenek metaadatokat az életmódról, az egészségről és a klinikai tünetekről, beleértve a neuropszichiátriai tüneteket is. A vonatkozó adatokat az egészségügyi központok és a HIV Monitoring Alapítvány betegnyilvántartásaiból is gyűjtik.

2. A társpatológiát értékelik:

   • A kardiovaszkuláris kockázati pontszámokat (D:A:D kockázati pontszám és Framingham CVD pontszám), valamint EKG és intima-media vastagság (IMT) méréseket gyűjtenek.
   • Az alkoholmentes zsírmájbetegség (NAFLD) felmérése máj ultrahanggal és FibroScan-nel.

3. Vérvétel történik (90 ml):

   • A DNS-t izolálják genetikai és epigenetikai elemzés céljából.
   • Az immunrendszer működését több szinten elemzik a vénás vérből keringő fehérvérsejtek segítségével.
   • Az anyagcserét és a proteomikát elemzik
   • Virológiai analízis, a HIV-rezervoár, a HIV-rezisztencia és a vírusszekvenciák jellemzése a keringő DNS-ben és RNS-ben.
4. A széklet- és nyálmintákon mikrobiomelemzést végeznek.
5. A kreatininszint és a mikrobiom meghatározásához vizeletmintát veszünk.

2 év utánkövetés után

1. A kutatók kérdőívek segítségével gyűjtenek metaadatokat az életmódról, az egészségről és a klinikai tünetekről, beleértve a neuropszichiátriai tüneteket is. A vonatkozó adatokat az egészségügyi központok és a HIV Monitoring Alapítvány betegnyilvántartásaiból is gyűjtik.

2. A társpatológiát értékelik:

   • A kardiovaszkuláris kockázati pontszámokat (D:A:D kockázati pontszám és a Framingham CVD pontszám), valamint az EKG-t gyűjtik.
   • Az alkoholmentes zsírmájbetegség (NAFLD) felmérése máj ultrahanggal és FibroScan-nel.
3. Vérmintákat (10 ml) veszünk a biomarker és a fertőzés/gyulladás paramétereinek elemzéséhez.

A beteg beleegyezésének eljárása A betegeket először mindig a kezelőorvos vagy szakápoló keresi fel. Tájékoztatást kapnak, és megkérdezik, hogy orvos-kutató kapcsolatba léphet-e a beteggel. Ha ehhez szóbeli beleegyezés van, a kutató egy héten belül felveszi a kapcsolatot a pácienssel, hogy érdeklődjön a vizsgálatban való részvétel iránt. az orvos-kutató válaszol a páciens minden kérdésére, és megtervezi az első látogatást. A tájékoztatáson alapuló beleegyezési eljárást a beteg első látogatása során hajtják végre.

Betegnyilvántartási eljárások Minden betegadat csak kódolt formában kerül rögzítésre egy biztonságos adatbázisban, audit és szerkesztési nyomvonallal (CASTOR EDC). A tájékoztatáson alapuló beleegyezési eljárás során a páciens vizsgálati kódot kap. Az azonosító betegadatokat és a vizsgálati kódot egy jelszóval védett kulcsfájlban tárolják, amelyhez csak a helyi kutatócsoport férhet hozzá. A helyi egészségügyi központból semmilyen betegazonosító adat nem kerül ki.

A CASTOR-ban található kérdőívekben és eCRF-ekben a vizsgálók a lehető legtöbb adatellenőrzést megadják.

Bioanyagok Az összes bioanyagot (vér, széklet, vizelet, nyál) a nijmegeni Radboudumc Kísérleti Belgyógyászati ​​Laboratóriumába szállítják és ott dolgozzák fel. Itt az összes bioanyagot közösen tárolják. Minden anyagot csak a páciens vizsgálati kódja szerint kezelünk és tárolunk.

Monitoring A monitorozást független monitor végzi a Holland Egyetemi Orvosi Központok Szövetségének legújabb irányelvei szerint. A bevezető és záró látogatást plenáris formában tervezik meg az összes radboudumci központtal. Központonként egy plusz látogatás lesz. E látogatások során a résztvevők egy kis részében ellenőrzik a tájékozott hozzájárulásokat, valamint a felvételi és kizárási kritériumokat, valamint a forrásadatok ellenőrzését.

Adatgyűjtés a betegnyilvántartáshoz

Az elektronikus beteg aktákból vagy a HIV Monitoring Alapítványtól gyűjtött alapadatok a befogadási látogatás során:

Kórtörténet:

1. A felvétel dátuma
2. Hosszúság és súly
3. Utolsó ismert vérnyomás (és a mérés dátuma)
4. Szerokonverzió dátuma (ha ismert)
5. Az első HIV-pozitív teszt dátuma
6. Kezdés dátuma CART

7. HIV-fertőzés kockázati magatartása:

   • MSM
   • Heteroszexuális
   • Injekciós kábítószer-használat
   • Szennyezett vérkészítmények
   • Ismeretlen
8. Első CD4 szám
9. CD4 mélypont
10. CD4/CD8 arány pre-cART
11. HIV-stadion a CART indulásakor a CDC kritériumai szerint
12. Pre-cART HIV RNS zenit

13. Opportunista feltételek a CART elindítása előtt

    • Egyik sem
    • MTB
    • Gombás fertőzések
    • Parazita fertőzések,
    • Bakteriális fertőzések

14. Rosszindulatú daganatok a CART elindítása előtt

    • Egyik sem
    • Ha igen, adja meg, hogy milyen fajtát, mikor és kezelést

15. Egyéb ismert egészségügyi problémák a CART megkezdése előtt, amelyek hosszú távú kezelést igényelnek

    • Egyik sem
    • Ha igen, adja meg, hogy milyen fajtát, mikor és kezelést

16. Válasz CART:

    • A CART indítása és a vírusterhelés közötti időszak < 500 (hónap)

    • Vírusterhelések:

      • 24 hét után nem észlelhető: igen/nem
      • A reziduális virémia száma/gyakorisága (pozitív teszt <50 kópiával): tavaly és elmúlt 5 év
      • Vírusfertőzések száma (50-200): tavaly és az elmúlt 5 évben
      • Virémia száma: 200-1000: tavaly és az elmúlt 5 évben
      • Sikertelen CART-ok száma (>1000): tavaly és az elmúlt 5 évben
      • Rezisztenciával kapcsolatos mutációk a CART előtt és azt követően
      • CD4 feloldása
      • CD4/CD8 arány és normalizálás >1 igen/nem a CART beindítása után
17. IRIS, igen/nem

18. Opportunista feltételek a CART elindítása után (ha ismert)

    • Egyik sem
    • MTB
    • Gombás fertőzések
    • Parazita fertőzések,
    • Bakteriális fertőzések

19. Rosszindulatú daganatok a CART elindítása után (ha ismert)

    • Egyik sem
    • Ha igen, adja meg, hogy milyen fajtát, mikor és kezelést

20. Érrendszeri betegségek a CART indítása után:

    • Egyik sem
    • Stroke/ TIA
    • Angina pectoris
    • Miokardiális infarktus
    • Claudicatio intermittens
    • Vénás thromboembolia
    • Egyéb …

21. Mint

    • Egyik sem
    • HAV: igen/nem, ha igen: kezelés és milyen gyakran

    • HBV:

      • Fertőzött: aktív fertőzés (PCR+) vagy nem aktív fertőzés

      • Védőoltás: nem/igen

        • Egyszer anti-HBs > 100
        • Kétszeri oltás, amihez vezet
    • anti-HBs> 100

    • anti-HBs < 100

      • Nincs fertőzés
    • HCV: igen/nem, ha igen: kezelés és milyen gyakran
    • Lues: igen/nem: ha igen: kezelés és milyen gyakran
    • Chlamydia/Go: igen/nem: ha igen: kezelés és milyen gyakran
    • HPV

22. COVID-19 fertőzés a CART elindítása előtt vagy után:

    • Csináltak-e COVID-19 tesztet, és ha igen, akkor a teszt típusa, ha ismert (PCR vagy antigén teszt), a vizsgálat dátuma és a COVID-19 laboratóriumi vizsgálat eredménye (pozitív vagy negatív)
    • COVID-19 szerológiai eredmények
    • Regisztráljon COVID-19-hez kapcsolódó kórházi felvételeket
    • COVID-19 oltás: típus és dátum(ok)

    • A COVID-19 oltás mellékhatásai:

      • Enyhe: általános rossz közérzet, fáradtság, izomfájdalom, fájdalom az injekció beadásának helyén, hidegrázás, fejfájás.
      • Közepes: enyhe tünetek, egészen (ön)gyógyszerezés/fájdalomcsillapítás szükséges.
      • Súlyos: 38,5 Celsius-fok feletti láz és/vagy egy vagy több napos ágyhoz kötöttség

23. CART rendszerek

    • A váltás okai
24. Felírt egyidejű gyógyszeres kezelés
25. Teljes aktuális gyógyszerlista

Fizikális vizsgálat

• A Kaposi-szarkóma jelei
• Lymphadenopathia
• A gyógyszerszint meghatározásához: mikor volt az utolsó HIV-gyógyszer szedésének dátuma és időpontja?
• Egyéb rendellenességek: …

Kardiovaszkuláris kockázati profil:

• D:A:D (R) és Framingham góljai
• EKG

Laboratóriumi eredmények a felvétel időpontjához legközelebb eső időpontban (standard ellátás legalább évente egyszer a holland irányelvek szerint):

• Teljes vérkép
• Májenzimek (ALAT, AF, bilirubin)
• Kreatinin
• HIV-RNS
• CD4 és CD8 számok
• Szőlőcukor
• Lipid profil
• TPHA/VDRL

• HCV szerológia (minden veszélyeztetett számára, például MSM és iv. droghasználók)

  • Ha pozitív, HCV PCR
• HPV diagnosztika nőknél (PAP, PCR)
• Vizeletdiagnosztika (ha elérhető): α1-mikroglobulin, fehérje, albumin, foszfát, kreatinin

Az elektronikus betegállományokból vagy a HIV Monitoring Alapítványtól 2 éves követési látogatás során gyűjtött alapadatok:

Az elmúlt 2 év kórtörténete:

1. 2 éves ellenőrző látogatás időpontja
2. Súly
3. Utolsó ismert vérnyomás (és a mérés dátuma)

4. Válasz CART az elmúlt 2 évben

   • Maradék virémiák száma: elmúlt 2 év
   • Vírusfertőzések száma (20-200): az elmúlt 2 évben
   • Virémiák száma (200-1000): elmúlt 2 év
   • Sikertelen CART száma (>1000): az elmúlt 2 évben
   • CD4 szám
   • CD4/CD8 arány (ha ismert)

5. Az opportunista körülmények 2 évig tartanak

   • Egyik sem
   • MTB
   • Gombás fertőzések
   • Parazita fertőzések,
   • Bakteriális fertőzések

6. Rosszindulatú daganatok az elmúlt 2 évben

   • Egyik sem
   • Ha igen, adja meg, hogy milyen fajtát, mikor és kezelést

7. A szív- és érrendszeri betegségek jelei/tünetei az elmúlt 2 évben:

   • Egyik sem
   • Stroke/ TIA
   • Angina pectoris
   • Miokardiális infarktus
   • Claudicatio intermittens
   • Vénás thromboembolia
   • Egyéb …

8. Új SOA-k az elmúlt 2 évben

   • HAV: igen/nem, ha igen: kezelés és milyen gyakran

   • HBV:

     • Fertőzött: aktív fertőzés (PCR+), nem aktív fertőzés,

     • Védőoltás: nem/igen

       • Egyszer anti-HBs > 100
       • Kétszeri oltás, amihez vezet
   • anti-HBs> 100

   • anti-HBs < 100

     • Nincs fertőzés
   • HCV: igen/nem, ha igen: kezelés és milyen gyakran
   • Lues: igen/nem: ha igen: kezelés és milyen gyakran
   • Chlamydia/Go: igen/nem: ha igen: kezelés és milyen gyakran

9. COVID-19 fertőzés a CART elindítása előtt vagy után:

   • Csináltak-e COVID-19 tesztet, és ha igen, akkor a teszt típusa, ha ismert (PCR vagy antigén teszt), a vizsgálat dátuma és a COVID-19 laboratóriumi vizsgálat eredménye (pozitív vagy negatív)
   • COVID-19 szerológiai eredmények
   • Regisztráljon COVID-19-hez kapcsolódó kórházi felvételeket
   • COVID-19 oltás: típus és dátum(ok)

   • A COVID-19 oltás mellékhatásai:

     • Enyhe: általános rossz közérzet, fáradtság, izomfájdalom, fájdalom az injekció beadásának helyén, hidegrázás, fejfájás.
     • Közepes: enyhe tünetek, egészen (ön)gyógyszerezés/fájdalomcsillapítás szükséges.
     • Súlyos: 38,5 Celsius-fok feletti láz és/vagy egy vagy több napos ágyhoz kötöttség

10. CART rendszerek az elmúlt 2 évben

    • A „Stichting HIV Monitoring” szolgáltatásból való váltás okai
11. Felírt egyidejű gyógyszeres kezelés
12. Teljes aktuális gyógyszerlista

Fizikális vizsgálat

• A Kaposi-szarkóma jelei
• Lymphadenopathia
• A gyógyszerszint meghatározásához: mikor volt az utolsó HIV-gyógyszer szedésének dátuma és időpontja?
• Egyéb rendellenességek: …

Kardiovaszkuláris kockázati profil:

• D:A:D (R) és Framingham góljai
• EKG

A követési látogatás időpontjához legközelebb eső időpont laboratóriumi eredményei:

• Teljes vérkép
• Májenzimek (ALAT, AF, bilirubin)
• Kreatinin
• HIV-RNS
• CD4 és CD8 számok
• Szőlőcukor
• Lipid profil
• TPHA/VDRL

• HCV szerológia

  o Ha pozitív, HCV PCR

• HPV diagnosztika nőknél (PAP, PCR)
• Vizeletdiagnosztika