2000 HIV Human Functional Genomics Partnership Programme (2000HIV)

Studijní populace Bude vytvořena kohorta s celkovým počtem 2 000 pacientů s HIV, která se bude skládat z objevné kohorty (n=1200) a potvrzovací kohorty (n=800). Vyšetřovatelé odhadují 2leté období zahrnutí a 2leté období sledování a budou usilovat o zahrnutí několika klinických fenotypů, jako jsou dlouhodobí pacienti bez progrese (~2-3%), imunologické non-responders (~3% ) a rychle progresivní (~ 4-5 %) a pacienti z klasické rizikové skupiny, jako jsou muži, kteří mají sex s muži (MSM), ženy a subjekty ze subsaharské Afriky. Pacienti se budou rekrutovat z následujících nizozemských center pro léčbu HIV: Radboudumc (Nijmegen), Erasmus MC (Rotterdam), OLVG (Amsterdam), Elisabeth Twee-Steden Ziekenhuis (Tilburg).

Výpočet velikosti vzorku nelze poskytnout kvůli proměnným frekvencím různých znaků v interakci genom-mikrobiom a jejich vlivu na produkci cytokinů. Vzhledem k explorativní povaze této studie bude výpočet velikosti variabilní v závislosti na typu analyzovaného polymorfismu. Frekvence různých tříd mikroorganismů v kolonizujícím mikrobiomu nejsou v naší studované populaci známy, a proto nelze provést výpočty výkonu.

Dřívější studie v rámci Human Functional Genomics Project posuzovaly mikrobiální vlastnosti u 250–500 jedinců. Dřívější studie HFGP zahrnovala jednotnou kohortu 200 jedinců infikovaných HIV (všichni MSM). Tato studie bude zahrnovat také pacienty infikované HIV s extrémnějším fenotypem, ženy a subjekty pocházející ze subsaharské Afriky. Z tohoto důvodu se vyšetřovatelé rozhodli zvýšit počet testovaných jedinců na 2000, sestávající z objevné kohorty 1200 subjektů a potvrzovací kohorty 800 účastníků.

Studijní návštěvy a postupy Při začleňování

1. Vyšetřovatelé budou shromažďovat metadata pomocí dotazníků o životním stylu, zdraví a klinických příznacích, včetně neuropsychiatrických příznaků. Relevantní údaje budou také shromažďovány ze záznamů pacientů v lékařských centrech a HIV Monitoring Foundation.

2. Kopatologie bude posuzována:

   • Budou se shromažďovat skóre kardiovaskulárního rizika (skóre rizika D:A:D a skóre Framinghamského CVD), stejně jako měření EKG a tloušťky intimy média (IMT).
   • Hodnocení nealkoholického ztučnění jater (NAFLD) pomocí ultrazvuku jater a FibroScan.

3. Bude odebrána krev (90 ml):

   • DNA bude izolována pro genetickou a epigenetickou analýzu.
   • Funkce imunitního systému bude analyzována na několika úrovních pomocí cirkulujících bílých krvinek z žilní krve.
   • Bude analyzován metabolismus a proteomika
   • Virologická analýza, charakterizující HIV rezervoár, HIV rezistenci a virové sekvence v cirkulující DNA a RNA.
4. Analýza mikrobiomu bude provedena na vzorcích stolice a slin.
5. Vzorek moči bude odebrán pro měření kreatininu a mikrobiom.

Po 2 letech sledování

1. Vyšetřovatelé budou shromažďovat metadata pomocí dotazníků o životním stylu, zdraví a klinických příznacích, včetně neuropsychiatrických příznaků. Relevantní údaje budou také shromažďovány ze záznamů pacientů v lékařských centrech a HIV Monitoring Foundation.

2. Kopatologie bude posuzována:

   • Budou se shromažďovat skóre kardiovaskulárního rizika (skóre rizika D:A:D a skóre Framinghamského CVD) a také EKG.
   • Hodnocení nealkoholického ztučnění jater (NAFLD) pomocí ultrazvuku jater a FibroScan.
3. Vzorky krve (10 ml) budou odebrány pro analýzu biomarkerů a parametrů infekce/zánětu.

Postup informovaného souhlasu pacienta Pacienty vždy nejprve osloví ošetřující lékař nebo specializovaná sestra. Budou jim poskytnuty informace a budou dotázáni, zda lékař-výzkumník může pacienta kontaktovat. Pokud k tomu existuje ústní souhlas, výzkumník kontaktuje pacienta do jednoho týdne, aby se zeptal, zda má zájem o účast ve studii. lékař-výzkumný pracovník odpoví na případné dotazy pacienta a naplánuje první návštěvu. Postup informovaného souhlasu bude proveden během první návštěvy pacienta.

Postupy v registru pacientů Všechna data pacientů budou zaznamenána pouze v zakódované podobě v zabezpečené databázi s auditním a editačním záznamem (CASTOR EDC). Během postupu informovaného souhlasu je pacientovi přidělen kód studie. Identifikační data pacienta a kód studie jsou uloženy v souboru klíčů chráněném heslem, ke kterému má přístup pouze místní výzkumný tým. Žádné údaje identifikující pacienta neopustí místní lékařské středisko.

Do dotazníků a eCRF v CASTOR zadají vyšetřovatelé co nejvíce kontrol dat

Biomateriály Veškerý biomateriál (krev, stolice, moč, sliny) bude transportován a zpracován v laboratoři experimentální interní medicíny Radboudumc v Nijmegenu. Zde bude také hromadně uložen veškerý biomateriál. Se všemi materiály bude manipulováno a budou uchovávány pouze pod studijním kódem pacienta.

Monitorování Monitorování bude prováděno nezávislým monitorem podle nejnovějších směrnic Nizozemské federace univerzitních lékařských center. Zahájení a závěrečná návštěva bude naplánována formou plenárního zasedání se všemi centry v Radboudumcu. V každém centru bude jedna návštěva navíc. Během těchto návštěv budou kontrolovány informované souhlasy, stejně jako kritéria pro zařazení a vyloučení a ověření zdrojových dat u malé podskupiny z celkového počtu účastníků.

Sběr dat pro registr pacientů

Základní údaje shromážděné z elektronických souborů pacientů nebo HIV Monitoring Foundation během inkluzní návštěvy:

Zdravotní historie:

1. Datum zařazení
2. Délka a hmotnost
3. Poslední známý krevní tlak (a datum měření)
4. Datum sérokonverze (pokud je známo)
5. Datum prvního HIV pozitivního testu
6. Datum zahájení cART

7. Riziko přenosu HIV:

   • MSM
   • Heterosexuální
   • Injekční užívání drog
   • Kontaminované krevní produkty
   • Neznámý
8. První počet CD4
9. CD4 nadir
10. Poměr CD4/CD8 před cART
11. HIV stadion na začátku cART podle kritérií CDC
12. Pre-cART HIV RNA zenit

13. Oportunní podmínky před spuštěním cART

    • Žádný
    • MTB
    • Plísňové infekce
    • Parazitární infekce,
    • Bakteriální infekce

14. Malignity před spuštěním cART

    • Žádný
    • Pokud ano, uveďte jaký druh, kdy a léčbu

15. Jiné známé zdravotní problémy před zahájením cART, které vyžadují dlouhodobou léčbu

    • Žádný
    • Pokud ano, uveďte jaký druh, kdy a léčbu

16. CART odpovědí:

    • Období mezi zahájením cART a virovou zátěží < 500 (měsíce)

    • Virové zátěže:

      • Nedetekovatelné po 24 týdnech: ano/ne
      • Počet/frekvence reziduální virémie (pozitivní test se signálem <50 kopií): minulý rok a posledních 5 let
      • Počet virových blipů (50-200): minulý rok a posledních 5 let
      • Počet viremií: 200-1000: minulý rok a posledních 5 let
      • Počet selhávajících cART (>1000): minulý rok a posledních 5 let
      • Mutace spojené s rezistencí před cART a po selhání
      • rekonstituce CD4
      • Poměr CD4/CD8 a normalizace >1 ano/ne po zahájení cART
17. IRIS, ano/ne

18. Oportunní podmínky po spuštění cART (pokud jsou známy)

    • Žádný
    • MTB
    • Plísňové infekce
    • Parazitární infekce,
    • Bakteriální infekce

19. Malignity po spuštění cART (pokud jsou známy)

    • Žádný
    • Pokud ano, uveďte jaký druh, kdy a léčbu

20. Cévní onemocnění po zahájení cART:

    • Žádný
    • Cévní mozková příhoda/ TIA
    • Angina pectoris
    • Infarkt myokardu
    • Claudicatio přerušované
    • Žilní tromboembolie
    • Jiný …

21. Tak, jako

    • Žádný
    • HAV: ano/ne, pokud ano: léčba a jak často

    • HBV:

      • Infikované: aktivní infekce (PCR+) nebo neaktivní infekce

      • Očkování: Ne/Ano

        • Jednou s anti-HBs> 100
        • Dvakrát očkování vedoucí k
    • anti-HBs> 100

    • anti-HBs < 100

      • Žádná infekce
    • HCV: ano/ne, pokud ano: léčba a jak často
    • Lues: ano/ ne: pokud ano: léčba a jak často
    • Chlamydie/Go: ano/ ne: pokud ano: léčba a jak často
    • HPV

22. Infekce COVID-19 před nebo po spuštění CART:

    • Byl proveden test na COVID-19 a pokud ano, typ testu, pokud je znám (PCR nebo antigenní test), datum testu a výsledek laboratorního testu na COVID-19 (pozitivní nebo negativní)
    • Výsledky sérologie COVID-19
    • Registrujte přijetí do nemocnice související s COVID-19
    • Očkování proti COVID-19: typ a datum(a)

    • Nežádoucí účinky očkování proti COVID-19:

      • Mírné: celková malátnost, únava, bolest svalů, bolest v místě vpichu, třesavka, bolest hlavy.
      • Střední: mírné symptomy v rozsahu vyžadují (samo)léčbu/úlevu od bolesti.
      • Závažné: horečka > 38,5 stupňů Celsia a/nebo jeden nebo více dní upoutání na lůžko

23. cART režimy

    • Důvody přepnutí
24. Předepsaná souběžná medikace
25. Kompletní aktuální seznam léků

Vyšetření

• Známky Kaposiho sarkomu
• Lymfadenopatie
• Pro stanovení hladiny léků: kdy byl naposledy použit lék proti HIV?
• Další abnormality:…

Kardiovaskulární rizikový profil:

• D:A:D (R) a Framingham skóruje
• EKG

Laboratorní výsledky k datu nejbližšímu datu zařazení (standardní péče alespoň jednou ročně podle holandských směrnic):

• Plný počet krvinek
• Jaterní enzymy (ALAT, AF, bilirubin)
• Kreatinin
• HIV-RNA
• Počty CD4 a CD8
• Glukóza
• Lipidový profil
• TPHA/VDRL

• sérologie HCV (pro všechny rizikové, jako je MSM a i.v. uživatelé drog)

  • Pokud je pozitivní, HCV PCR
• HPV diagnostika u žen (PAP, PCR)
• Diagnostika moči (pokud je k dispozici): α1-mikroglobulin, protein, albumin, fosfát, kreatinin

Základní údaje shromážděné z elektronických záznamů pacientů nebo HIV Monitoring Foundation během 2leté následné návštěvy:

Lékařská anamnéza za poslední 2 roky:

1. Datum 2leté následné návštěvy
2. Hmotnost
3. Poslední známý krevní tlak (a datum měření)

4. Odezva cART za poslední 2 roky

   • Počet reziduální virémie: poslední 2 roky
   • Počet virových blipů (20-200): poslední 2 roky
   • Počet viremií (200-1000): poslední 2 roky
   • Počet selhávajících cART (>1000): poslední 2 roky
   • počet CD4
   • Poměr CD4/CD8 (pokud je znám)

5. Oportunní podmínky trvají 2 roky

   • Žádný
   • MTB
   • Plísňové infekce
   • Parazitární infekce,
   • Bakteriální infekce

6. Malignity v posledních 2 letech

   • Žádný
   • Pokud ano, uveďte jaký druh, kdy a léčbu

7. Známky/symptomy kardiovaskulárních onemocnění v posledních 2 letech:

   • Žádný
   • Cévní mozková příhoda/ TIA
   • Angina pectoris
   • Infarkt myokardu
   • Claudicatio přerušované
   • Žilní tromboembolie
   • Jiný …

8. Nové SOA za poslední 2 roky

   • HAV: ano/ne, pokud ano: léčba a jak často

   • HBV:

     • Infikované: aktivní infekce (PCR+), neaktivní infekce,

     • Očkování: Ne/Ano

       • Jednou s anti-HBs> 100
       • Dvakrát očkování vedoucí k
   • anti-HBs> 100

   • anti-HBs < 100

     • Žádná infekce
   • HCV: ano/ne, pokud ano: léčba a jak často
   • Lues: ano/ ne: pokud ano: léčba a jak často
   • Chlamydie/Go: ano/ ne: pokud ano: léčba a jak často

9. Infekce COVID-19 před nebo po spuštění CART:

   • Byl proveden test na COVID-19 a pokud ano, typ testu, pokud je znám (PCR nebo antigenní test), datum testu a výsledek laboratorního testu na COVID-19 (pozitivní nebo negativní)
   • Výsledky sérologie COVID-19
   • Registrujte přijetí do nemocnice související s COVID-19
   • Očkování proti COVID-19: typ a datum(a)

   • Nežádoucí účinky očkování proti COVID-19:

     • Mírné: celková malátnost, únava, bolest svalů, bolest v místě vpichu, třesavka, bolest hlavy.
     • Střední: mírné symptomy v rozsahu vyžadují (samo)léčbu/úlevu od bolesti.
     • Závažné: horečka > 38,5 stupňů Celsia a/nebo jeden nebo více dní upoutání na lůžko

10. cART režimy za poslední 2 roky

    • Důvody pro přechod k dispozici od „Stichting HIV Monitoring“
11. Předepsaná souběžná medikace
12. Kompletní aktuální seznam léků

Vyšetření

• Známky Kaposiho sarkomu
• Lymfadenopatie
• Pro stanovení hladiny léků: kdy byl naposledy použit lék proti HIV?
• Další abnormality:…

Kardiovaskulární rizikový profil:

• D:A:D (R) a Framingham skóruje
• EKG

Laboratorní výsledky k datu nejbližšímu datu následné návštěvy:

• Plný počet krvinek
• Jaterní enzymy (ALAT, AF, bilirubin)
• Kreatinin
• HIV-RNA
• Počty CD4 a CD8
• Glukóza
• Lipidový profil
• TPHA/VDRL

• sérologie HCV

  o Pokud je pozitivní, HCV PCR

• HPV diagnostika u žen (PAP, PCR)
• Diagnostika moči