2000 HIV Human Functional Genomics Partnership Program (2000HIV)

Undersøgelsespopulation Der opbygges en kohorte med i alt 2000 HIV-patienter, bestående af en opdagelseskohorte (n=1200) og en konfirmationskohorte (n=800). Efterforskerne estimerer en 2-årig inklusion og 2-årig opfølgningsperiode og vil stræbe efter inklusion af adskillige kliniske fænotyper såsom langsigtede ikke-progressorer (~2-3%), immunologiske ikke-respondere (~3% ), og hurtige fremskridt (~4-5%) og klassiske risikogruppepatienter såsom mænd, der har sex med mænd (MSM), kvinder og forsøgspersoner fra Afrika syd for Sahara. Patienter vil blive rekrutteret fra følgende hollandske HIV-behandlingscentre: Radboudumc (Nijmegen), Erasmus MC (Rotterdam), OLVG (Amsterdam), Elisabeth Twee-Steden Ziekenhuis (Tilburg).

En prøvestørrelsesberegning kan ikke tilvejebringes på grund af de varierende frekvenser af de forskellige egenskaber i genom-mikrobiom-interaktion og deres effekt på cytokinproduktion. På grund af denne undersøgelses eksplorative karakter vil størrelsesberegningen være variabel afhængig af typen af ​​analyseret polymorfi. Frekvenserne af de forskellige mikroorganismeklasser i det koloniserende mikrobiom er ikke kendt i vores undersøgelsespopulation, og derfor er effektberegninger umulige at udføre.

Tidligere undersøgelser i Human Functional Genomics Project har vurderet mikrobiomegenskaber hos 250-500 individer. Et tidligere HFGP-studie omfattede en ensartet kohorte på 200 HIV-smittede individer (alle MSM). Nærværende undersøgelse vil også omfatte HIV-inficerede patienter med en mere ekstrem fænotype, kvinder og forsøgspersoner, der stammer fra Afrika syd for Sahara. På grund af dette besluttede efterforskerne at øge antallet af testede individer til 2000, bestående af en opdagelseskohorte på 1200 forsøgspersoner og en bekræftelseskohorte på 800 deltagere.

Studiebesøg og procedurer Ved inklusion

1. Efterforskerne vil indsamle metadata ved hjælp af spørgeskemaer om livsstil, helbred og kliniske symptomer, herunder neuropsykiatriske symptomer. Der vil også blive indsamlet relevante data fra patientjournalerne i lægehusene og HIV-monitoreringsfonden.

2. Co-patologi vil blive vurderet:

   • Kardiovaskulære risikoscore (D:A:D risikoscore og Framingham CVD-score) vil blive indsamlet samt EKG- og intima-medietykkelsesmålinger (IMT).
   • Ikke-alkoholisk fedtleversygdom (NAFLD) vurdering gennem leverultralyd og FibroScan.

3. Der vil blive udtaget blod (90 ml):

   • DNA vil blive isoleret til genetisk og epigenetisk analyse.
   • Immunsystemets funktion vil blive analyseret på flere niveauer ved hjælp af cirkulerende hvide blodlegemer fra venøst ​​blod.
   • Metabolisme og proteomik vil blive analyseret
   • Virologisk analyse, karakterisering af HIV-reservoiret, HIV-resistens og virale sekvenser i cirkulerende DNA og RNA.
4. Mikrobiomanalyse vil blive udført på afførings- og spytprøver.
5. Urinprøve vil blive indsamlet til kreatininmålinger og mikrobiom.

Efter 2 års opfølgning

1. Efterforskerne vil indsamle metadata ved hjælp af spørgeskemaer om livsstil, helbred og kliniske symptomer, herunder neuropsykiatriske symptomer. Der vil også blive indsamlet relevante data fra patientjournalerne i lægehusene og HIV-monitoreringsfonden.

2. Co-patologi vil blive vurderet:

   • Kardiovaskulær risikoscore (D:A:D risikoscore og Framingham CVD score) vil blive indsamlet samt EKG.
   • Ikke-alkoholisk fedtleversygdom (NAFLD) vurdering gennem leverultralyd og FibroScan.
3. Blodprøver (10 ml) vil blive indsamlet til biomarkør- og infektions-/inflammationsparameteranalyse.

Procedure for informeret samtykke til patienter Patienter vil altid først blive kontaktet af en behandlende læge eller specialiseret sygeplejerske. De vil blive forsynet med information og vil blive spurgt, om en læge-forsker må kontakte patienten. Hvis der er mundtligt samtykke til dette, kontakter forskeren patienten om en uge for at spørge, om de er interesserede i at deltage i undersøgelsen. lægen-forskeren vil besvare eventuelle spørgsmål, patienten måtte have, og planlægge det første besøg. Proceduren for informeret samtykke vil blive gennemført under patientens første besøg.

Patientregistreringsprocedurer Alle patientdata vil kun blive registreret i kodet form i en sikker database med revisions- og redigeringsspor (CASTOR EDC). Under proceduren med informeret samtykke får patienten en undersøgelseskode. De identificerende patientdata og undersøgelseskoden opbevares i en adgangskodebeskyttet nøglefil, som kun er tilgængelig for det lokale forskerhold. Ingen patientidentificerende data vil forlade det lokale lægecenter.

I spørgeskemaerne og eCRF'erne i CASTOR vil efterforskerne indtaste så mange datatjek som muligt

Biomaterialer Alt biomateriale (blod, afføring, urin, spyt) vil blive transporteret til og behandlet i laboratoriet for eksperimentel intern medicin i Radboudumc i Nijmegen. Her vil alt biomaterialet også blive opbevaret samlet. Alt materiale vil kun blive håndteret og opbevaret under patientens undersøgelseskode.

Overvågning Overvågning vil blive udført af en uafhængig monitor i henhold til de seneste retningslinjer fra den hollandske sammenslutning af universitetsmedicinske centre. Der vil blive planlagt et igangsættelses- og afslutningsbesøg i plenum med alle centrene i Radboudumc. Der vil være et ekstra besøg pr. center. Under disse besøg vil informerede samtykker blive kontrolleret, såvel som inklusions- og eksklusionskriterier og kildedataverifikation i en lille undergruppe af det samlede antal deltagere.

Dataindsamling til patientregister

Basisdata indsamlet fra elektroniske patientfiler eller HIV Monitoring Foundation under inklusionsbesøg:

Medicinsk historie:

1. Optagelsesdato
2. Længde og vægt
3. Sidst kendte blodtryk (og dato målt)
4. Serokonverteringsdato (hvis kendt)
5. Dato første HIV-positive test
6. Dato start cART

7. Risikoadfærd for HIV-transmission:

   • MSM
   • Heteroseksuel
   • Injicerende stofbrug
   • Forurenede blodprodukter
   • Ukendt
8. Første CD4 optælling
9. CD4 nadir
10. CD4/CD8 forhold pre-cART
11. HIV-stadion ved start cART i henhold til CDC-kriterier
12. Pre-cART HIV RNA i top

13. Opportunistiske forhold før start cART

    • Ingen
    • MTB
    • Svampeinfektioner
    • parasitære infektioner,
    • Bakterielle infektioner

14. Maligniteter før start cART

    • Ingen
    • Hvis ja, angiv hvilken slags, hvornår og behandling

15. Andre kendte medicinske problemer før start af cART, som kræver langvarig behandling

    • Ingen
    • Hvis ja, angiv hvilken slags, hvornår og behandling

16. Svar cART:

    • Periode mellem start cART og viral load < 500 (måneder)

    • Viral belastning:

      • Ikke påviselig efter 24 uger: ja/nej
      • Antal/hyppighed af resterende viræmi (positiv test med signal <50 kopier): sidste år og sidste 5 år
      • Antal virale blips (50-200): sidste år og sidste 5 år
      • Antal viræmier: 200-1000: sidste år og sidste 5 år
      • Antal mislykkede cART (>1000): sidste år og sidste 5 år
      • Resistensassocierede mutationer før cART og efterfølgende svigt
      • CD4 rekonstitution
      • CD4/CD8-forhold og normalisering >1 ja/nej efter cART-initiering
17. IRIS, ja/nej

18. Opportunistiske forhold efter start cART (hvis kendt)

    • Ingen
    • MTB
    • Svampeinfektioner
    • parasitære infektioner,
    • Bakterielle infektioner

19. Maligniteter efter start af cART (hvis kendt)

    • Ingen
    • Hvis ja, angiv hvilken slags, hvornår og behandling

20. Karsygdomme efter start af cART:

    • Ingen
    • Slagtilfælde/ TIA
    • Hjertekrampe
    • Myokardieinfarkt
    • Claudicatio afbryder
    • Venøs trombo-emboli
    • Andet …

21. Ligesom

    • Ingen
    • HAV: ja/nej, hvis ja: behandling og hvor ofte

    • HBV:

      • Inficeret: aktiv infektion (PCR+) eller ikke-aktiv infektion

      • Vaccination: Nej/Ja

        • Én gang med anti-HB'er > 100
        • To gange vaccination fører til
    • anti-HB'er > 100

    • anti-HB'er < 100

      • Ingen infektion
    • HCV: ja/nej, hvis ja: behandling og hvor ofte
    • Lues: ja/nej: hvis ja: behandling og hvor ofte
    • Klamydia/Go: ja/nej: hvis ja: behandling og hvor ofte
    • HPV

22. COVID-19-infektion før eller efter start af cART:

    • Blev der udført en COVID-19-test og i så fald type test, hvis kendt (PCR- eller antigentest), dato for test og resultat af laboratorietest for COVID-19 (positiv eller negativ)
    • Resultater af COVID-19-serologi
    • Registrer COVID-19-relaterede hospitalsindlæggelser
    • COVID-19-vaccination: type og dato(er)

    • Bivirkninger af COVID-19-vaccination:

      • Mild: generel utilpashed, træthed, muskelsmerter, smerter på injektionsstedet, kuldegysninger, hovedpine.
      • Moderat: milde symptomer i den grad (selv)medicinering/smertelindring er påkrævet.
      • Alvorlig: feber >38,5 grader Celsius og/eller en eller flere dage sengeliggende

23. cART-regimer

    • Årsager til at skifte
24. Ordineret samtidig medicin
25. Fuld aktuel medicinliste

Fysisk undersøgelse

• Tegn på Kaposi-sarkom
• Lymfadenopati
• Til bestemmelse af medicinniveauer: hvornår var sidste dato og tidspunkt for hiv-medicinen blev taget?
• Andre abnormiteter: …

Kardiovaskulær risikoprofil:

• D:A:D (R) og Framingham scorer
• EKG

Laboratorieresultater af datoen tættest på inklusionsdatoen (standardbehandling mindst en gang om året i henhold til hollandske retningslinjer):

• Fuld blodtal
• Leverenzymer (ALAT, AF, bilirubin)
• Kreatinin
• HIV-RNA
• CD4 og CD8 tæller
• Glukose
• Lipid profil
• TPHA/VDRL

• HCV-serologi (for alle i risikogruppen, såsom MSM og i.v. stofbrugere)

  • Hvis positiv, HCV PCR
• HPV-diagnostik hos kvinder (PAP, PCR)
• Urindiagnostik (hvis tilgængelig): α1-mikroglobulin, protein, albumin, fosfat, kreatinin

Basisdata indsamlet fra elektroniske patientfiler eller HIV Monitoring Foundation under 2-års opfølgningsbesøg:

Sygehistorie sidste 2 år:

1. Dato for 2 års opfølgningsbesøg
2. Vægt
3. Sidst kendte blodtryk (og dato målt)

4. Respons cART sidste 2 år

   • Antal resterende viræmi: sidste 2 år
   • Antal virale blips (20-200): sidste 2 år
   • Antal viræmier (200-1000): sidste 2 år
   • Antal fejlbehæftede cART (>1000): sidste 2 år
   • CD4 antal
   • CD4/CD8-forhold (hvis kendt)

5. Opportunistiske forhold varer 2 år

   • Ingen
   • MTB
   • Svampeinfektioner
   • parasitære infektioner,
   • Bakterielle infektioner

6. Maligniteter i de sidste 2 år

   • Ingen
   • Hvis ja, angiv hvilken slags, hvornår og behandling

7. Tegn/symptomer på hjerte-kar-sygdomme inden for de sidste 2 år:

   • Ingen
   • Slagtilfælde/ TIA
   • Hjertekrampe
   • Myokardieinfarkt
   • Claudicatio afbryder
   • Venøs trombo-emboli
   • Andet …

8. Nye SOA'er inden for de sidste 2 år

   • HAV: ja/nej, hvis ja: behandling og hvor ofte

   • HBV:

     • Inficeret: aktiv infektion (PCR+), ikke-aktiv infektion,

     • Vaccination: Nej/Ja

       • Én gang med anti-HB'er > 100
       • To gange vaccination fører til
   • anti-HB'er > 100

   • anti-HB'er < 100

     • Ingen infektion
   • HCV: ja/nej, hvis ja: behandling og hvor ofte
   • Lues: ja/nej: hvis ja: behandling og hvor ofte
   • Klamydia/Go: ja/nej: hvis ja: behandling og hvor ofte

9. COVID-19-infektion før eller efter start af cART:

   • Blev der udført en COVID-19-test og i så fald type test, hvis kendt (PCR- eller antigentest), dato for test og resultat af laboratorietest for COVID-19 (positiv eller negativ)
   • Resultater af COVID-19-serologi
   • Registrer COVID-19-relaterede hospitalsindlæggelser
   • COVID-19-vaccination: type og dato(er)

   • Bivirkninger af COVID-19-vaccination:

     • Mild: generel utilpashed, træthed, muskelsmerter, smerter på injektionsstedet, kuldegysninger, hovedpine.
     • Moderat: milde symptomer i den grad (selv)medicinering/smertelindring er påkrævet.
     • Alvorlig: feber >38,5 grader Celsius og/eller en eller flere dage sengeliggende

10. cART-regimer i de sidste 2 år

    • Årsager til at skifte er tilgængelige fra 'Stichting HIV Monitoring'
11. Ordineret samtidig medicin
12. Fuld aktuel medicinliste

Fysisk undersøgelse

• Tegn på Kaposi-sarkom
• Lymfadenopati
• Til bestemmelse af medicinniveauer: hvornår var sidste dato og tidspunkt for hiv-medicinen blev taget?
• Andre abnormiteter: …

Kardiovaskulær risikoprofil:

• D:A:D (R) og Framingham scorer
• EKG

Laboratorieresultater af dato tættest på opfølgningsbesøgsdato:

• Fuld blodtal
• Leverenzymer (ALAT, AF, bilirubin)
• Kreatinin
• HIV-RNA
• CD4 og CD8 tæller
• Glukose
• Lipid profil
• TPHA/VDRL

• HCV-serologi

  o Hvis positiv, HCV PCR

• HPV-diagnostik hos kvinder (PAP, PCR)
• Urindiagnostik