Nenän epiteelin geneettinen ja yksisoluinen RNA COVID-19 -tutkimus (CIPOLLINI)

Perustelut:

Tällä hetkellä meneillään oleva uuden SARS-CoV2-viruksen aiheuttama maailmanlaajuisesti lamauttava pandemia osoittaa epätoivoisen ja kiireellisen tarpeen ymmärtää paremmin koronavirustautia 2019 (COVID-19) aiheuttavan viruksen aktivoimia biologisia reittejä tartunnan saaneilla potilailla. Osalle COVID-19-potilaista kehittyy erittäin vaikeita hengitystieoireita, jotka vaativat sairaalahoitoa joko koneellisella ventilaatiolla tai ilman sitä, kun taas toisilla on lieviä flunssan kaltaisia ​​oireita. Tämän silmiinpistävän eron kliinisissä tuloksissa ja pitkän aikavälin seurauksissa taustalla olevia biologisia mekanismeja ei tunneta, mutta geneettinen tekijä vaikuttaa todennäköiseltä. SARS-CoV2 pääsee soluihin ACE2-reseptorin ja aktivoivan proteaasin TMPRSS2 kautta, joiden on viime aikoina osoitettu olevan voimakkaasti rikastunut nenän epiteelissä. Tutkijat olettavat, että genetiikka ja nenän epiteelin vaste SARS-CoV2:lle ovat kriittisiä tekijöitä immuunivasteessa virusinfektiolle, ja he ennustavat kliinistä lopputulosta COVID-19-potilailla.

Tavoite:

Päätavoitteena on arvioida, onko geneettinen tausta ja/tai nenän epiteelin geenin ilmentyminen vasteena SARS-CoV2:lle erilainen potilailla, joilla on lievä, vaikea tai erittäin vaikea sairaus. Tämän tutkimuksen toissijaisena tavoitteena on tutkia a) ACE2-AngII-järjestelmän roolia SARS-CoV2:n aikana suhteessa lopputulokseen b) lievän, vakavan ja erittäin vaikean COVID-19-infektion pitkän aikavälin seurauksia c) yhteyttä lievän, vaikean ja erittäin vaikean COVID-19:n välillä, jossa on kliiniset ja molekyyliset taudin etenemisen merkkiaineet d) ennustaako ulosteen mikrobiomi, viromi tai metabolomiikkaprofiili kliinisen lopputuloksen COVID-19-potilailla ja e) tutkia, onko olemassa olevia vasta-aineita muita koronaviruksia vastaan vaikuttaa vakavaan sairauden kehittymiseen.

Opintojen suunnittelu:

Prospektiivinen avoin kliininen havainnointitutkimus. Tässä tutkimuksessa otetaan näytteitä 150 COVI-19-potilaalta (50 lievä (ryhmä 1), 50 vakava (ryhmä 2) ja 50 erittäin vakava (ryhmä 3)). Kaikilta ryhmiltä kerätään verta, nenäharjat ja uloste sairaalaan tullessa ja 3 kuukautta toipumisen jälkeen sekä ryhmiltä 2 ja 3 päivänä 3, päivänä 14 ja ennen detubaatiota. Oppiaineet jaetaan ryhmille takautuvasti.

Tutkimuspopulaatio:

Mukana on yhteensä 150 potilasta, joilla on diagnosoitu COVID-19. Tutkijoiden tavoitteena on 50 potilasta ryhmää kohden, jaettuna kolmeen ryhmään:

Ryhmä 1 Potilaat, joilla on lievä sairaus ja joiden SARS-CoV2-infektiotesti oli positiivinen, mutta joilla on vain lieviä oireita eivätkä he tarvitse sairaalahoitoa.

Ryhmä 2 Vakavaa sairautta sairastavat potilaat sairaalaan ilman tarvetta päästä tehohoitoon.

Ryhmä 3 Tehohoitoon otetut potilaat, joilla on erittäin vaikea sairaus ja jotka tarvitsevat koneellista ventilaatiota.

Tärkeimmät tutkimuksen parametrit/päätepisteet:

Tämän tutkimuksen ensisijainen päätepiste on sellaisten geenien, polkujen ja solupopulaatioiden tunnistaminen, jotka liittyvät kliiniseen lopputulokseen ja taudin etenemiseen lievillä, vakavilla ja erittäin vaikeilla COVID-19-potilailla.