Nasaal epitheliaal genetisch en eencellig RNA COVID-19-onderzoek (CIPOLLINI)

Grondgedachte:

De huidige wereldwijde verlammende pandemie met het nieuwe SARS-CoV2-virus toont de wanhopige en dringende behoefte aan een beter begrip van de biologische routes die worden geactiveerd door het virus dat de ziekte van Coronavirus 2019 (COVID-19) veroorzaakt bij geïnfecteerde patiënten. Een subgroep van COVID-19-patiënten ontwikkelt zeer ernstige ademhalingssymptomen die ziekenhuisopname vereisen met of zonder de noodzaak van mechanische beademing, terwijl anderen milde griepachtige symptomen ervaren. De biologische mechanismen die ten grondslag liggen aan dit opvallende verschil in klinische uitkomst en de gevolgen op lange termijn zijn onbekend, maar een genetische factor lijkt waarschijnlijk. SARS-CoV2 komt de cellen binnen via de ACE2-receptor en het activerende protease TMPRSS2, waarvan onlangs is aangetoond dat ze sterk verrijkt zijn met neusepitheel. De onderzoekers veronderstellen dat genetica en de respons van het neusepitheel op SARS-CoV2 cruciale bepalende factoren zijn voor de immuunrespons op virale infectie en de klinische uitkomst bij COVID-19-patiënten voorspellen.

Objectief:

Het belangrijkste doel is om te beoordelen of de genetische achtergrond en/of de genexpressie van het neusepitheel als reactie op SARS-CoV2 anders is bij patiënten met milde, ernstige of zeer ernstige ziekte. Het secundaire doel van deze studie is het onderzoeken van a) de rol van het ACE2-AngII-systeem tijdens SARS-CoV2 in relatie tot de uitkomst b) de langetermijngevolgen van milde, ernstige en zeer ernstige COVID-19-infectie c) de associatie tussen milde, ernstige en zeer ernstige COVID-19 met klinische en moleculaire markers van ziekteprogressie d) of het faeces microbioom, viroom of metabolomics profiel de klinische uitkomst bij COVID-19 patiënten voorspelt en e) om te onderzoeken of reeds bestaande antilichamen tegen andere coronavirussen een rol spelen bij de ontwikkeling van ernstige ziekten.

Studie ontwerp:

Prospectieve open-label klinische observationele studie. In deze studie zullen monsters worden verzameld van 150 COVI-19-patiënten (50 mild (groep 1), 50 ernstig (groep 2) en 50 zeer ernstig (groep 3)). Bloed, neusborstels en ontlasting worden voor alle groepen verzameld bij opname in het ziekenhuis en 3 maanden na herstel, en voor groep 2 en 3 op dag 3, op dag 14 en vóór detubatie. Studieonderwerpen worden achteraf aan de groepen toegewezen.

Studiepopulatie:

In totaal zullen 150 patiënten met de diagnose COVID-19 worden opgenomen. De onderzoekers mikken op 50 patiënten per groep, verdeeld over 3 groepen:

Groep 1 Patiënten met milde ziekte die positief testten op SARS-CoV2-infectie, maar slechts milde symptomen ervaren en geen ziekenhuisopname nodig hebben.

Groep 2 Patiënten met een ernstige ziekte opgenomen in het ziekenhuis, zonder dat opname op de intensive care nodig is.

Groep 3 Patiënten met een zeer ernstige ziekte die zijn opgenomen op de intensive care en mechanische beademing nodig hebben.

Belangrijkste onderzoeksparameters/eindpunten:

Het primaire eindpunt van deze studie is de identificatie van genen, routes en celpopulaties die verband houden met de klinische uitkomst en ziekteprogressie bij milde, ernstige en zeer ernstige COVID-19-patiënten.