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Identification et caractérisation de nouvelles variantes non codantes qui contribuent aux troubles génétiques

15 mai 2024 mis à jour par: Duke University

Identification et caractérisation de nouvelles variantes codantes, d'épissage et non codantes qui contribuent aux troubles génétiques

Le but de cette étude est d'identifier et de caractériser de nouvelles variantes non codantes et d'épissage qui peuvent contribuer à des troubles génétiques. Nous nous concentrerons particulièrement sur les patients atteints d'une maladie génétique diagnostiquée dont les résultats génétiques ne sont pas concluants.

Aperçu de l'étude

Description détaillée

Pour réaliser cette étude, nous utiliserons l'ADN et l'ARN du patient isolés à partir d'échantillons de sang. L'ADN sera séquencé (capture ciblée et/ou séquençage de l'ADN du génome entier (WGS)) pour identifier les variants mononucléotidiques non codants (SNV), les insertions/délétions plus petites (indels) ou les variants structurels plus grands (SV). L'ARN sera séquencé (ARN-seq) pour identifier les gènes qui sont exprimés de manière différentielle et/ou allèle-spécifique, ce qui peut indiquer une variante fonctionnelle non codante ou d'épissage. Nous testerons la fonction des variantes non codantes à l'aide d'essais de rapporteurs à haut débit et de méthodologies basées sur CRISPR.

Type d'étude

Observationnel

Inscription (Estimé)

200

Contacts et emplacements

Cette section fournit les coordonnées de ceux qui mènent l'étude et des informations sur le lieu où cette étude est menée.

Lieux d'étude

    • North Carolina
      • Durham, North Carolina, États-Unis, 27710
        • Duke University

Critères de participation

Les chercheurs recherchent des personnes qui correspondent à une certaine description, appelée critères d'éligibilité. Certains exemples de ces critères sont l'état de santé général d'une personne ou des traitements antérieurs.

Critère d'éligibilité

Âges éligibles pour étudier

  • Enfant
  • Adulte
  • Adulte plus âgé

Accepte les volontaires sains

Non

Méthode d'échantillonnage

Échantillon non probabiliste

Population étudiée

Patients avec une maladie génétique diagnostiquée et des résultats génétiques non concluants et les membres de leur famille non affectés

La description

Critère d'intégration:

Les sujets auront un ou plusieurs des éléments suivants :

  • Patients (probands) diagnostiqués avec une maladie génétique
  • Patients (probands) avec des résultats génétiques non concluants
  • Patients (probands) qui ont des variantes de codage et/ou d'épissage identiques, mais qui présentent des phénotypes très divers
  • Membres de la famille non affectés des proposants

Critères d'exclusion : Il n'y a pas de critères d'exclusion pour cette étude.

Plan d'étude

Cette section fournit des détails sur le plan d'étude, y compris la façon dont l'étude est conçue et ce que l'étude mesure.

Comment l'étude est-elle conçue ?

Détails de conception

Que mesure l'étude ?

Principaux critères de jugement

Mesure des résultats
Délai
Nombre de variantes manquantes codant pour les protéines pathogènes
Délai: 2 années
2 années

Collaborateurs et enquêteurs

C'est ici que vous trouverez les personnes et les organisations impliquées dans cette étude.

Parrainer

Les enquêteurs

  • Chercheur principal: Priya Kishnani, MD, Duke
  • Chercheur principal: Greg Crawford, PhD, Duke

Dates d'enregistrement des études

Ces dates suivent la progression des dossiers d'étude et des soumissions de résultats sommaires à ClinicalTrials.gov. Les dossiers d'étude et les résultats rapportés sont examinés par la Bibliothèque nationale de médecine (NLM) pour s'assurer qu'ils répondent à des normes de contrôle de qualité spécifiques avant d'être publiés sur le site Web public.

Dates principales de l'étude

Début de l'étude (Réel)

3 mars 2020

Achèvement primaire (Estimé)

1 avril 2025

Achèvement de l'étude (Estimé)

1 avril 2026

Dates d'inscription aux études

Première soumission

15 mai 2020

Première soumission répondant aux critères de contrôle qualité

19 mai 2020

Première publication (Réel)

22 mai 2020

Mises à jour des dossiers d'étude

Dernière mise à jour publiée (Réel)

16 mai 2024

Dernière mise à jour soumise répondant aux critères de contrôle qualité

15 mai 2024

Dernière vérification

1 janvier 2024

Plus d'information

Termes liés à cette étude

Plan pour les données individuelles des participants (IPD)

Prévoyez-vous de partager les données individuelles des participants (DPI) ?

OUI

Description du régime IPD

Les données seront soumises à dbGaP, les variantes occasionnelles à ClinVar, les données agrégées sur les phénotypes rares et les variantes à Geno2MP et à d'autres bases de données, les gènes candidats via une liste publique et liés à un nœud de MatchMaker Exchange (MyGene2).

Délai de partage IPD

Les données seront disponibles 7 à 12 mois après la génération des résultats et seront disponibles pour toujours.

Type d'informations de prise en charge du partage d'IPD

  • RSE

Informations sur les médicaments et les dispositifs, documents d'étude

Étudie un produit pharmaceutique réglementé par la FDA américaine

Non

Étudie un produit d'appareil réglementé par la FDA américaine

Non

Ces informations ont été extraites directement du site Web clinicaltrials.gov sans aucune modification. Si vous avez des demandes de modification, de suppression ou de mise à jour des détails de votre étude, veuillez contacter register@clinicaltrials.gov. Dès qu'un changement est mis en œuvre sur clinicaltrials.gov, il sera également mis à jour automatiquement sur notre site Web .

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