Diversità microbica dell'effluente dello stoma dell'intestino tenue e delle feci del colon
10 febbraio 2019 aggiornato da: Xinhua Hospital, Shanghai Jiao Tong University School of Medicine
Diversità microbica intestinale dell'effluente dello stoma dell'intestino tenue e delle feci del colon di bambini con sindrome dell'intestino corto
Diversi studi hanno suggerito che la dysbacteriosis di solito si verificava in pazienti con insufficienza intestinale (IF).
Tuttavia, le differenze di diversità del microbiota negli effluenti dello stoma dell'intestino tenue e nelle feci del colon sono state raramente studiate.
Pertanto, questo studio ha lo scopo di indagare le composizioni del microbiota e le differenze di output dello stoma e del colon dell'intestino tenue nei pazienti pediatrici con IF.
Campioni fecali di pazienti con IF.
Ogni paziente ha ricevuto la chiusura della fistola nel nostro centro e sono stati raccolti campioni fecali sia dallo stoma dell'intestino tenue che dal colon.
Le composizioni microbiche fecali sono state determinate mediante sequenziamento ad alto rendimento.
Panoramica dello studio
Stato
Sconosciuto
Condizioni
Tipo di studio
Osservativo
Iscrizione (Anticipato)
60
Contatti e Sedi
Questa sezione fornisce i recapiti di coloro che conducono lo studio e informazioni su dove viene condotto lo studio.
Contatto studio
- Nome: Wei Cai, MD, PhD
- Email: caiw204@sjtu.edu.cn
Luoghi di studio
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Shanghai, Cina
- Reclutamento
- Shanghai Xinhua Hospital, affiliated to Shanghai Jiao Tong University, School of Medicine
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Contatto:
- Wei Cai, MD, PhD
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Criteri di partecipazione
I ricercatori cercano persone che corrispondano a una certa descrizione, chiamata criteri di ammissibilità. Alcuni esempi di questi criteri sono le condizioni generali di salute di una persona o trattamenti precedenti.
Criteri di ammissibilità
Età idonea allo studio
Da 1 mese a 3 anni (Bambino)
Accetta volontari sani
Sì
Sessi ammissibili allo studio
Tutto
Metodo di campionamento
Campione non probabilistico
Popolazione di studio
Pazienti ricoverati
Descrizione
Criterio di inclusione:
- Pazienti con insufficienza intestinale. I pazienti hanno mostrato una buona tolleranza alla somministrazione di nutrizione parenterale ed enterale. La percentuale di nutrizione enterale è superiore all'80%.
Produzione di feci mantenuta a meno di 50 ml/kg/giorno. Non si sono verificate complicazioni per almeno 1 settimana.
Criteri di esclusione:
- I pazienti dipendono principalmente dalla nutrizione parenterale. Sintomi come febbre, distensione addominale e diarrea. Complicazioni come malattia epatica associata alla nutrizione parenterale, polmonite e infezione correlata al catetere.
Piano di studio
Questa sezione fornisce i dettagli del piano di studio, compreso il modo in cui lo studio è progettato e ciò che lo studio sta misurando.
Come è strutturato lo studio?
Dettagli di progettazione
Coorti e interventi
Gruppo / Coorte |
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Uscita stomia intestinale
Nessun intervento.
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Facce del colon
Nessun intervento.
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Controllo sano
Nessun intervento.
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Cosa sta misurando lo studio?
Misure di risultato primarie
Misura del risultato |
Misura Descrizione |
Lasso di tempo |
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Diversità e composizione del microbiota chiarite dal sequenziamento dell'rRNA 16s
Lasso di tempo: 1) Raccolta dei campioni: un giorno prima della dimissione dei pazienti dall'ospedale; 2)Estrazione del DNA: entro una settimana dal prelievo dei campioni; 3) Sequenziamento e analisi dei dati: entro un mese dall'estrazione del DNA
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Verrà estratto il DNA del microbiota intestinale.
Quindi gli ampliconi di DNA purificati vengono raggruppati in equimolare e sequenziati all'estremità accoppiata (2 × 250) su una piattaforma Illumina MiSeq.
I file Raw Fastq verranno de-multiplexati, filtrati per la qualità utilizzando QIIME (versione 1.17).
Le unità tassonomiche operative (OTU) verranno successivamente raggruppate con un limite di somiglianza del 97% utilizzando UPARSE versione 7.1 (http://drive5.com/
uparse/) e le sequenze chimeriche saranno identificate e rimosse utilizzando UCHIME (http://drive5.com/index.htm).
L'affiliazione filogenetica di ciascuna sequenza del gene 16S rRNA viene analizzata mediante RDP Classifier (http://rdp.cme.msu.edu/)
contro l'rRNA silva (SSU117/119)16S.
L'indice di Sobs e l'indice di Chao saranno utilizzati per valutare la diversità del microbiota.
La composizione del microbiota sarà identificata su diversi livelli tra cui phylum, famiglia e genere.
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1) Raccolta dei campioni: un giorno prima della dimissione dei pazienti dall'ospedale; 2)Estrazione del DNA: entro una settimana dal prelievo dei campioni; 3) Sequenziamento e analisi dei dati: entro un mese dall'estrazione del DNA
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Collaboratori e investigatori
Qui è dove troverai le persone e le organizzazioni coinvolte in questo studio.
Pubblicazioni e link utili
La persona responsabile dell'inserimento delle informazioni sullo studio fornisce volontariamente queste pubblicazioni. Questi possono riguardare qualsiasi cosa relativa allo studio.
Pubblicazioni generali
- Arrieta MC, Stiemsma LT, Amenyogbe N, Brown EM, Finlay B. The intestinal microbiome in early life: health and disease. Front Immunol. 2014 Sep 5;5:427. doi: 10.3389/fimmu.2014.00427. eCollection 2014.
- Booijink CC, El-Aidy S, Rajilic-Stojanovic M, Heilig HG, Troost FJ, Smidt H, Kleerebezem M, De Vos WM, Zoetendal EG. High temporal and inter-individual variation detected in the human ileal microbiota. Environ Microbiol. 2010 Dec;12(12):3213-27. doi: 10.1111/j.1462-2920.2010.02294.x.
- Barrett E, Guinane CM, Ryan CA, Dempsey EM, Murphy BP, O'Toole PW, Fitzgerald GF, Cotter PD, Ross RP, Stanton C. Microbiota diversity and stability of the preterm neonatal ileum and colon of two infants. Microbiologyopen. 2013 Apr;2(2):215-25. doi: 10.1002/mbo3.64. Epub 2013 Jan 24.
- Huang Y, Guo F, Li Y, Wang J, Li J. Fecal microbiota signatures of adult patients with different types of short bowel syndrome. J Gastroenterol Hepatol. 2017 Dec;32(12):1949-1957. doi: 10.1111/jgh.13806.
Studiare le date dei record
Queste date tengono traccia dell'avanzamento della registrazione dello studio e dell'invio dei risultati di sintesi a ClinicalTrials.gov. I record degli studi e i risultati riportati vengono esaminati dalla National Library of Medicine (NLM) per assicurarsi che soddisfino specifici standard di controllo della qualità prima di essere pubblicati sul sito Web pubblico.
Studia le date principali
Inizio studio (Effettivo)
1 novembre 2016
Completamento primario (Anticipato)
15 dicembre 2019
Completamento dello studio (Anticipato)
1 giugno 2020
Date di iscrizione allo studio
Primo inviato
15 giugno 2018
Primo inviato che soddisfa i criteri di controllo qualità
5 luglio 2018
Primo Inserito (Effettivo)
18 luglio 2018
Aggiornamenti dei record di studio
Ultimo aggiornamento pubblicato (Effettivo)
15 febbraio 2019
Ultimo aggiornamento inviato che soddisfa i criteri QC
10 febbraio 2019
Ultimo verificato
1 novembre 2017
Maggiori informazioni
Termini relativi a questo studio
Parole chiave
Altri numeri di identificazione dello studio
- ShanghaiXinhua
Informazioni su farmaci e dispositivi, documenti di studio
Studia un prodotto farmaceutico regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
Studia un dispositivo regolamentato dalla FDA degli Stati Uniti
No
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