非結核性抗酸菌性肺疾患患者におけるゲノムワイド関連研究
2019年12月12日 更新者：Jae-Joon Yim、Seoul National University Hospital
ゲノムワイド関連研究を用いた非結核性抗酸菌性肺疾患患者の遺伝的感受性の解明
この研究の目的は、ゲノムワイド関連研究を使用して非結核性抗酸菌性肺疾患患者の遺伝的感受性を解明することでした。
調査の概要
状態
完了
条件
詳細な説明
非結核性マイコバクテリア (NTM) は、遍在する環境微生物です。
NTM 肺疾患は増加していますが、この疾患を持つ患者の遺伝的感受性は特定されていません。
NTM 肺疾患の遺伝的感受性を解明するために、研究者らは NTM 肺疾患患者と健康な対照者を含むゲノムワイド関連研究 (GWAS) を実施します (症例:対照 = 1:3)。
年齢と性別を一致させた対照グループは、韓国の健康双子研究から募集されます。
研究の種類
観察的
入学 (実際)
2808
連絡先と場所
このセクションには、調査を実施する担当者の連絡先の詳細と、この調査が実施されている場所に関する情報が記載されています。
研究場所
-
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Seoul、大韓民国、110-744
- Seoul National University Hospital
-
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参加基準
研究者は、適格基準と呼ばれる特定の説明に適合する人を探します。これらの基準のいくつかの例は、人の一般的な健康状態または以前の治療です。
適格基準
就学可能な年齢
18年～75年 (大人、高齢者)
健康ボランティアの受け入れ
はい
受講資格のある性別
全て
サンプリング方法
非確率サンプル
調査対象母集団
NTM 肺疾患を患い、健康管理されている患者
説明
包含基準:
- 症例：米国胸部学会が推奨する診断基準を満たすNTM肺疾患患者
- 対照: 韓国の健康双子研究に登録された健康な被験者
除外基準:
- ケース：なし
- 対照： 1) 咳、痰などの呼吸器症状のある被験者 2) 胸部 X 線検査で異常のある被験者
研究計画
このセクションでは、研究がどのように設計され、研究が何を測定しているかなど、研究計画の詳細を提供します。
研究はどのように設計されていますか？
デザインの詳細
コホートと介入
グループ/コホート |
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NTM肺疾患
アメリカ胸部学会のガイドラインを満たすNTM肺疾患患者
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健康管理
肺疾患のない、年齢と性別が一致した対照被験者
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この研究は何を測定していますか？
主要な結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
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対照と比較した NTM 肺疾患のリスクに関連する一塩基多型 (SNP) の発見
時間枠：ベースライン
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交絡因子を調整した後のロジスティック回帰を使用して、NTM 肺疾患に関連する SNP を特定する (GWAS 統計的有意性閾値、P < 5.00*E-08)
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ベースライン
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二次結果の測定
結果測定 |
メジャーの説明 |
時間枠 |
|---|---|---|
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対照と比較した、重篤な NTM 肺疾患のリスクに関連する SNP の発見
時間枠：ベースライン
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交絡因子を調整した後のロジスティック回帰を使用して、対照と比較して重篤な NTM 肺疾患に関連する SNP を特定する (GWAS 統計的有意性閾値、P < 5.00*E-08)
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ベースライン
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軽度の NTM 肺疾患と比較した重度の NTM 肺疾患のリスクに関連する SNP の発見
時間枠：ベースライン
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交絡因子を調整した後のロジスティック回帰を使用して、軽度の NTM 肺疾患と比較して重度の NTM 肺疾患に関連する SNP を特定する (GWAS 統計的有意性閾値、P < 5.00*E-08)
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ベースライン
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Mycobacterium avium complex 肺疾患と M. abscessus 肺疾患と対照のリスクに関連する SNP の発見
時間枠：ベースライン
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交絡因子を調整した後の多項ロジスティック回帰を使用して、Mycobacterium avium complex 肺疾患と M. abscessus 肺疾患と対照に関連する SNP を特定する (GWAS 統計的有意性閾値、P < 5.00*E-08)。
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ベースライン
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協力者と研究者
ここでは、この調査に関係する人々や組織を見つけることができます。
出版物と役立つリンク
研究に関する情報を入力する責任者は、自発的にこれらの出版物を提供します。これらは、研究に関連するあらゆるものに関するものである可能性があります。
一般刊行物
- Park YS, Lee CH, Lee SM, Yang SC, Yoo CG, Kim YW, Han SK, Shim YS, Yim JJ. Rapid increase of non-tuberculous mycobacterial lung diseases at a tertiary referral hospital in South Korea. Int J Tuberc Lung Dis. 2010 Aug;14(8):1069-71.
- Yim JJ, Kim HJ, Kwon OJ, Koh WJ. Association between microsatellite polymorphisms in intron II of the human Toll-like receptor 2 gene and nontuberculous mycobacterial lung disease in a Korean population. Hum Immunol. 2008 Sep;69(9):572-6. doi: 10.1016/j.humimm.2008.06.003. Epub 2008 Jul 3.
- Kim RD, Greenberg DE, Ehrmantraut ME, Guide SV, Ding L, Shea Y, Brown MR, Chernick M, Steagall WK, Glasgow CG, Lin J, Jolley C, Sorbara L, Raffeld M, Hill S, Avila N, Sachdev V, Barnhart LA, Anderson VL, Claypool R, Hilligoss DM, Garofalo M, Fitzgerald A, Anaya-O'Brien S, Darnell D, DeCastro R, Menning HM, Ricklefs SM, Porcella SF, Olivier KN, Moss J, Holland SM. Pulmonary nontuberculous mycobacterial disease: prospective study of a distinct preexisting syndrome. Am J Respir Crit Care Med. 2008 Nov 15;178(10):1066-74. doi: 10.1164/rccm.200805-686OC. Epub 2008 Aug 14.
- Lee AR, Lee J, Choi SM, Seong MW, Kim SA, Kim M, Chae KO, Lee JS, Yim JJ. Phenotypic, immunologic, and clinical characteristics of patients with nontuberculous mycobacterial lung disease in Korea. BMC Infect Dis. 2013 Nov 25;13:558. doi: 10.1186/1471-2334-13-558.
- Kim J, Seong MW, Kim EC, Han SK, Yim JJ. Frequency and clinical implications of the isolation of rare nontuberculous mycobacteria. BMC Infect Dis. 2015 Jan 9;15:9. doi: 10.1186/s12879-014-0741-7.
- Kwak N, Lee CH, Lee HJ, Kang YA, Lee JH, Han SK, Yim JJ. Non-tuberculous mycobacterial lung disease: diagnosis based on computed tomography of the chest. Eur Radiol. 2016 Dec;26(12):4449-4456. doi: 10.1007/s00330-016-4286-6. Epub 2016 Mar 5.
- Hill AV. Evolution, revolution and heresy in the genetics of infectious disease susceptibility. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2012 Mar 19;367(1590):840-9. doi: 10.1098/rstb.2011.0275.
- Sung J, Cho SI, Lee K, Ha M, Choi EY, Choi JS, Kim H, Kim J, Hong KS, Kim Y, Yoo KY, Park C, Song YM. Healthy Twin: a twin-family study of Korea--protocols and current status. Twin Res Hum Genet. 2006 Dec;9(6):844-8. doi: 10.1375/183242706779462822.
- Li Y, Willer CJ, Ding J, Scheet P, Abecasis GR. MaCH: using sequence and genotype data to estimate haplotypes and unobserved genotypes. Genet Epidemiol. 2010 Dec;34(8):816-34. doi: 10.1002/gepi.20533.
- Howie BN, Donnelly P, Marchini J. A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies. PLoS Genet. 2009 Jun;5(6):e1000529. doi: 10.1371/journal.pgen.1000529. Epub 2009 Jun 19.
- 1000 Genomes Project Consortium; Abecasis GR, Altshuler D, Auton A, Brooks LD, Durbin RM, Gibbs RA, Hurles ME, McVean GA. A map of human genome variation from population-scale sequencing. Nature. 2010 Oct 28;467(7319):1061-73. doi: 10.1038/nature09534. Erratum In: Nature. 2011 May 26;473(7348):544. Xue, Yali [added]; Cartwright, Reed A [added]; Altshuler, David L [corrected to Altshuler, David]; Kebbel, Andrew [corrected to Keebler, Jonathan]; Koko-Gonzales, Paula [corrected to Kokko-Gonzales, Paula]; Nickerson, Debbie A [corrected to Nickerson, Debo.
- Ritchie MD, Hahn LW, Roodi N, Bailey LR, Dupont WD, Parl FF, Moore JH. Multifactor-dimensionality reduction reveals high-order interactions among estrogen-metabolism genes in sporadic breast cancer. Am J Hum Genet. 2001 Jul;69(1):138-47. doi: 10.1086/321276. Epub 2001 Jun 11.
研究記録日
これらの日付は、ClinicalTrials.gov への研究記録と要約結果の提出の進捗状況を追跡します。研究記録と報告された結果は、国立医学図書館 (NLM) によって審査され、公開 Web サイトに掲載される前に、特定の品質管理基準を満たしていることが確認されます。
主要日程の研究
研究開始 (実際)
2016年7月11日
一次修了 (実際)
2017年11月20日
研究の完了 (実際)
2019年10月3日
試験登録日
最初に提出
2016年7月3日
QC基準を満たした最初の提出物
2016年7月11日
最初の投稿 (見積もり)
2016年7月14日
学習記録の更新
投稿された最後の更新 (実際)
2019年12月13日
QC基準を満たした最後の更新が送信されました
2019年12月12日
最終確認日
2019年12月1日
詳しくは
本研究に関する用語
追加の関連 MeSH 用語
その他の研究ID番号
- H-1605-111-763
個々の参加者データ (IPD) の計画
個々の参加者データ (IPD) を共有する予定はありますか?
いいえ
この情報は、Web サイト clinicaltrials.gov から変更なしで直接取得したものです。研究の詳細を変更、削除、または更新するリクエストがある場合は、register@clinicaltrials.gov。 までご連絡ください。 clinicaltrials.gov に変更が加えられるとすぐに、ウェブサイトでも自動的に更新されます。
抗酸菌感染症、非結核の臨床試験
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Mayo Clinic完了Mycobacterium Avium Intracellulare Complex (MAC)アメリカ
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Amgen完了HIV感染症 | Mycobacterium Avium-Intracellulare 感染症アメリカ
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Pfizer完了HIV感染症 | Mycobacterium Avium-Intracellulare 感染症アメリカ
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National Institute of Allergy and Infectious Diseases...完了
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The University of Texas Health Science Center at...Pfizer完了
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The University of Texas Health Science Center at...Pfizer; Abbott完了
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National Institute of Allergy and Infectious Diseases...完了HIV感染症 | Mycobacterium Avium-intracellulare 感染症アメリカ
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National Institute of Allergy and Infectious Diseases...Abbott完了HIV感染症 | Mycobacterium Avium-intracellulare 感染症アメリカ
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