Nem tuberkulózisos mikobakteriális tüdőbetegségben szenvedő betegek genomra kiterjedő asszociációs vizsgálata
2019. december 12. frissítette: Jae-Joon Yim, Seoul National University Hospital
A nem tuberkulózisos mikobakteriális tüdőbetegségben szenvedő betegek genetikai érzékenységének tisztázása genom-szerte társulási tanulmány segítségével
A tanulmány célja a nem tuberkulózisos mikobakteriális tüdőbetegségben szenvedő betegek genetikai érzékenységének tisztázása volt genomszintű asszociációs vizsgálat segítségével.
A tanulmány áttekintése
Állapot
Befejezve
Körülmények
Részletes leírás
A nem tuberkulózisos mikobaktériumok (NTM) mindenütt jelenlévő környezeti organizmusok.
Az NTM tüdőbetegség egyre növekszik, azonban a betegségben szenvedő betegek genetikai fogékonyságát nem azonosították.
Az NTM tüdőbetegség genetikai érzékenységének tisztázása érdekében a kutatók egy genom-szerte asszociációs vizsgálatot (GWAS) végeznek, amelyben NTM tüdőbetegségben szenvedő betegeket és egészséges kontrollokat (eset: kontroll = 1:3) vettek részt.
Az életkornak és nemnek megfelelő kontrollcsoportot a Korean Healthy Twin Study-ból választják ki.
Tanulmány típusa
Megfigyelő
Beiratkozás (Tényleges)
2808
Kapcsolatok és helyek
Ez a rész a vizsgálatot végzők elérhetőségeit, valamint a vizsgálat lefolytatásának helyére vonatkozó információkat tartalmazza.
Tanulmányi helyek
-
-
-
Seoul, Koreai Köztársaság, 110-744
- Seoul National University Hospital
-
-
Részvételi kritériumok
A kutatók olyan embereket keresnek, akik megfelelnek egy bizonyos leírásnak, az úgynevezett jogosultsági kritériumoknak. Néhány példa ezekre a kritériumokra a személy általános egészségi állapota vagy a korábbi kezelések.
Jogosultsági kritériumok
Tanulmányozható életkorok
18 év (Felnőtt, Idősebb felnőtt)
Egészséges önkénteseket fogad
Igen
Tanulmányozható nemek
Összes
Mintavételi módszer
Nem valószínűségi minta
Tanulmányi populáció
NTM tüdőbetegségben szenvedő betegek és egészséges kontroll
Leírás
Bevételi kritériumok:
- Eset: NTM tüdőbetegségben szenvedő betegek, akik megfelelnek az American Thoracic Society által javasolt diagnosztikai kritériumoknak
- Kontroll: Egészséges alanyok a Korean Healthy Twin Study-ba
Kizárási kritériumok:
- Eset: nincs
- Kontroll: 1) Olyan alanyok, akiknek légúti tünetei vannak, beleértve a köhögést és a köpetet. 2) Olyan alanyok, akiknél eltérések vannak a mellkas röntgenfelvételén
Tanulási terv
Ez a rész a vizsgálati terv részleteit tartalmazza, beleértve a vizsgálat megtervezését és a vizsgálat mérését.
Hogyan készül a tanulmány?
Tervezési részletek
Kohorszok és beavatkozások
Csoport / Kohorsz |
|---|
|
NTM tüdőbetegség
NTM tüdőbetegségben szenvedő betegek, akik megfelelnek az American Thoracic Society irányelveinek
|
|
Egészséges kontroll
Az életkorban, nemben egyező kontroll alanyok tüdőbetegség nélkül
|
Mit mér a tanulmány?
Elsődleges eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
Az NTM tüdőbetegség kockázatával összefüggő egyetlen nukleotid polimorfizmusok (SNP-k) megtalálása a kontrollokhoz képest
Időkeret: Alapvonal
|
Az NTM tüdőbetegséggel kapcsolatos SNP-k azonosítása logisztikus regresszió segítségével a zavaró tényezők ellenőrzése után (GWAS statisztikai szignifikancia küszöb, P < 5,00*E-08)
|
Alapvonal
|
Másodlagos eredményintézkedések
Eredménymérő |
Intézkedés leírása |
Időkeret |
|---|---|---|
|
A súlyos NTM tüdőbetegség kockázatával kapcsolatos SNP-k megtalálása a kontrollokhoz képest
Időkeret: Alapvonal
|
Súlyos NTM tüdőbetegséggel kapcsolatos SNP-k azonosítása kontrollokkal összehasonlítva logisztikus regresszió segítségével a zavaró tényezők kontrollja után (GWAS statisztikai szignifikancia küszöb, P < 5,00*E-08)
|
Alapvonal
|
|
A súlyos NTM tüdőbetegség kockázatával kapcsolatos SNP-k megtalálása az enyhe NTM tüdőbetegséghez képest
Időkeret: Alapvonal
|
A súlyos NTM tüdőbetegséghez kapcsolódó SNP-k azonosítása enyhe NTM tüdőbetegséggel összehasonlítva logisztikus regresszió segítségével a zavaró tényezők ellenőrzése után (GWAS statisztikai szignifikancia küszöb, P < 5,00*E-08)
|
Alapvonal
|
|
A Mycobacterium avium komplex tüdőbetegség kockázatával kapcsolatos SNP-k feltárása a M. abscessus tüdőbetegség és a kontrollok között
Időkeret: Alapvonal
|
A Mycobacterium avium komplex tüdőbetegséggel kapcsolatos SNP-k azonosítása a M. abscessus tüdőbetegséggel szemben a kontrollokkal szemben multinomiális logisztikus regresszióval a zavaró tényezők ellenőrzése után (GWAS statisztikai szignifikancia küszöb, P < 5,00*E-08)
|
Alapvonal
|
Együttműködők és nyomozók
Itt találhatja meg a tanulmányban érintett személyeket és szervezeteket.
Szponzor
Publikációk és hasznos linkek
A vizsgálattal kapcsolatos információk beviteléért felelős személy önkéntesen bocsátja rendelkezésre ezeket a kiadványokat. Ezek bármiről szólhatnak, ami a tanulmányhoz kapcsolódik.
Általános kiadványok
- Park YS, Lee CH, Lee SM, Yang SC, Yoo CG, Kim YW, Han SK, Shim YS, Yim JJ. Rapid increase of non-tuberculous mycobacterial lung diseases at a tertiary referral hospital in South Korea. Int J Tuberc Lung Dis. 2010 Aug;14(8):1069-71.
- Yim JJ, Kim HJ, Kwon OJ, Koh WJ. Association between microsatellite polymorphisms in intron II of the human Toll-like receptor 2 gene and nontuberculous mycobacterial lung disease in a Korean population. Hum Immunol. 2008 Sep;69(9):572-6. doi: 10.1016/j.humimm.2008.06.003. Epub 2008 Jul 3.
- Kim RD, Greenberg DE, Ehrmantraut ME, Guide SV, Ding L, Shea Y, Brown MR, Chernick M, Steagall WK, Glasgow CG, Lin J, Jolley C, Sorbara L, Raffeld M, Hill S, Avila N, Sachdev V, Barnhart LA, Anderson VL, Claypool R, Hilligoss DM, Garofalo M, Fitzgerald A, Anaya-O'Brien S, Darnell D, DeCastro R, Menning HM, Ricklefs SM, Porcella SF, Olivier KN, Moss J, Holland SM. Pulmonary nontuberculous mycobacterial disease: prospective study of a distinct preexisting syndrome. Am J Respir Crit Care Med. 2008 Nov 15;178(10):1066-74. doi: 10.1164/rccm.200805-686OC. Epub 2008 Aug 14.
- Lee AR, Lee J, Choi SM, Seong MW, Kim SA, Kim M, Chae KO, Lee JS, Yim JJ. Phenotypic, immunologic, and clinical characteristics of patients with nontuberculous mycobacterial lung disease in Korea. BMC Infect Dis. 2013 Nov 25;13:558. doi: 10.1186/1471-2334-13-558.
- Kim J, Seong MW, Kim EC, Han SK, Yim JJ. Frequency and clinical implications of the isolation of rare nontuberculous mycobacteria. BMC Infect Dis. 2015 Jan 9;15:9. doi: 10.1186/s12879-014-0741-7.
- Kwak N, Lee CH, Lee HJ, Kang YA, Lee JH, Han SK, Yim JJ. Non-tuberculous mycobacterial lung disease: diagnosis based on computed tomography of the chest. Eur Radiol. 2016 Dec;26(12):4449-4456. doi: 10.1007/s00330-016-4286-6. Epub 2016 Mar 5.
- Hill AV. Evolution, revolution and heresy in the genetics of infectious disease susceptibility. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2012 Mar 19;367(1590):840-9. doi: 10.1098/rstb.2011.0275.
- Sung J, Cho SI, Lee K, Ha M, Choi EY, Choi JS, Kim H, Kim J, Hong KS, Kim Y, Yoo KY, Park C, Song YM. Healthy Twin: a twin-family study of Korea--protocols and current status. Twin Res Hum Genet. 2006 Dec;9(6):844-8. doi: 10.1375/183242706779462822.
- Li Y, Willer CJ, Ding J, Scheet P, Abecasis GR. MaCH: using sequence and genotype data to estimate haplotypes and unobserved genotypes. Genet Epidemiol. 2010 Dec;34(8):816-34. doi: 10.1002/gepi.20533.
- Howie BN, Donnelly P, Marchini J. A flexible and accurate genotype imputation method for the next generation of genome-wide association studies. PLoS Genet. 2009 Jun;5(6):e1000529. doi: 10.1371/journal.pgen.1000529. Epub 2009 Jun 19.
- 1000 Genomes Project Consortium; Abecasis GR, Altshuler D, Auton A, Brooks LD, Durbin RM, Gibbs RA, Hurles ME, McVean GA. A map of human genome variation from population-scale sequencing. Nature. 2010 Oct 28;467(7319):1061-73. doi: 10.1038/nature09534. Erratum In: Nature. 2011 May 26;473(7348):544. Xue, Yali [added]; Cartwright, Reed A [added]; Altshuler, David L [corrected to Altshuler, David]; Kebbel, Andrew [corrected to Keebler, Jonathan]; Koko-Gonzales, Paula [corrected to Kokko-Gonzales, Paula]; Nickerson, Debbie A [corrected to Nickerson, Debo.
- Ritchie MD, Hahn LW, Roodi N, Bailey LR, Dupont WD, Parl FF, Moore JH. Multifactor-dimensionality reduction reveals high-order interactions among estrogen-metabolism genes in sporadic breast cancer. Am J Hum Genet. 2001 Jul;69(1):138-47. doi: 10.1086/321276. Epub 2001 Jun 11.
Tanulmányi rekorddátumok
Ezek a dátumok nyomon követik a ClinicalTrials.gov webhelyre benyújtott vizsgálati rekordok és összefoglaló eredmények benyújtásának folyamatát. A vizsgálati feljegyzéseket és a jelentett eredményeket a Nemzeti Orvostudományi Könyvtár (NLM) felülvizsgálja, hogy megbizonyosodjon arról, hogy megfelelnek-e az adott minőség-ellenőrzési szabványoknak, mielőtt közzéteszik őket a nyilvános weboldalon.
Tanulmány főbb dátumok
Tanulmány kezdete (Tényleges)
2016. július 11.
Elsődleges befejezés (Tényleges)
2017. november 20.
A tanulmány befejezése (Tényleges)
2019. október 3.
Tanulmányi regisztráció dátumai
Először benyújtva
2016. július 3.
Először nyújtották be, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2016. július 11.
Első közzététel (Becslés)
2016. július 14.
Tanulmányi rekordok frissítései
Utolsó frissítés közzétéve (Tényleges)
2019. december 13.
Az utolsó frissítés elküldve, amely megfelel a minőségbiztosítási kritériumoknak
2019. december 12.
Utolsó ellenőrzés
2019. december 1.
Több információ
A tanulmányhoz kapcsolódó kifejezések
További vonatkozó MeSH feltételek
Egyéb vizsgálati azonosító számok
- H-1605-111-763
Terv az egyéni résztvevői adatokhoz (IPD)
Tervezi megosztani az egyéni résztvevői adatokat (IPD)?
NEM
Ezt az információt közvetlenül a clinicaltrials.gov webhelyről szereztük be, változtatás nélkül. Ha bármilyen kérése van vizsgálati adatainak módosítására, eltávolítására vagy frissítésére, kérjük, írjon a következő címre: register@clinicaltrials.gov. Amint a változás bevezetésre kerül a clinicaltrials.gov oldalon, ez a webhelyünkön is automatikusan frissül. .
Klinikai vizsgálatok a Mycobacterium fertőzések, nem tuberkulózis
-
Rabin Medical CenterToborzásCentral-line Associated Blood Stream Infections (CLABSI)Izrael
-
Bactiguard ABKarolinska University HospitalBefejezveSebészet | Central Line Associated Blood Stream Infections (CLABSI)Svédország
-
Emory UniversityBefejezveCentral Line Associated Bloodstream Infections (CLABSI) | Csontvelő átültetésEgyesült Államok