Biomarkery ostrej, ciężkiej choroby u dzieci (BASIC)

Jest to prospektywne badanie kohortowe obejmujące gromadzenie danych klinicznych i próbek biologicznych. Na pacjentach nie będą wykonywane żadne interwencje.

Pobieranie próbek Próbki krwi i moczu zostaną pobrane w dwóch punktach czasowych. Jeśli to możliwe, zostaną również pobrane wymazy z kału i gardła.

Punkt czasowy 1: Podczas stabilizacji przez zespół CATS (pierwszy kontakt z zespołem intensywnej terapii) Zespół CATS pobierze próbki podczas rutynowego pobierania próbek, uszeregowanych pod względem ważności w następującej kolejności: DNA (2 ml); RNA (2 ml); serum (2 ml); Osocze (2 ml) i Mocz (10 ml).

Punkt czasowy 2: W ciągu 24-48 godzin od przyjęcia na OIOM Zespół badawczy uczestniczącego OIOM-u pobierze próbki podczas rutynowego pobierania próbek, uszeregowanych pod względem ważności w następującej kolejności: DNA (2 ml); RNA (2 ml); serum (2 ml); Osocze (2 ml) i Mocz (10 ml). Ponadto na OIOM-ie zostaną pobrane próbki kału i wymazu z gardła.

U niemowląt o masie ciała poniżej 10 kg ograniczymy całkowitą objętość krwi pobieranej w każdym punkcie czasowym do 0,8 ml/kg masy ciała, zgodnie z wytycznymi MCRN dotyczącymi badań klinicznych z dnia 25 lipca 2008 r.

Ponadto próbki kału będą pobierane przy przyjęciu na OIOM (doba 1) oraz 24-48 godzin po przyjęciu na OIOM. Jeśli kał nie jest dostępny, zostanie pobrany wymaz z odbytu do analizy mikrobiologicznej. SCFA zostaną zmierzone na pierwszej dostępnej próbce kału.

Transport, przetwarzanie i przechowywanie próbek Próbki będą transportowane przez zespół CATS do przyjmujących OIOM w chłodniach (4°C). Przetwarzanie i przechowywanie próbek będzie odbywać się w szpitalu, w którym pacjent jest przyjmowany. Przetwarzanie będzie obejmować anonimizację próbki poprzez wygenerowanie niepowtarzalnego numeru badania, który będzie później używany we wszystkich odniesieniach do próbek.

Gromadzenie danych klinicznych Opracowany zostanie znormalizowany formularz opisu przypadku i podręcznik zbierania danych z definicjami i zasadami. Dane będą zbierane przez pracowników naukowych w każdej jednostce. Dane kliniczne obejmą kluczowe etapy ścieżki pacjenta – skierowanie na intensywną terapię i transport, przebieg i wynik na OIOM-ie. Przeprowadzimy szczegółowe fenotypowanie kliniczne pacjenta, w tym powód skierowania/przyjęcia na OIOM (infekcja, uraz, neurologiczne, sercowe, oddechowe i inne), ciężkość choroby (wynik PIM-2), ciężkość niewydolności narządowej (PELOD) i wynik przy wypisie z OIOM-u (zgon, ciężki kalectwo). Uznając, że krótkoterminowy wynik przy wypisie z OIOM może nie być najbardziej znaczącym wynikiem dla rodziców/opiekunów lub nie zapewniać dokładnego obrazu długoterminowego wyniku u dzieci, poprosimy również rodziców/opiekunów o zgodę na kontakt 1 rok po OIOM wstęp do wypełnienia krótkich kwestionariuszy oceniających stan funkcjonalny i jakość życia dziecka. Kwestionariusze będą podawane przez telefon, e-mail lub środki internetowe, w zależności od preferencji rodziców.

Tam, gdzie to możliwe, aby uniknąć powielania wysiłków, dane kliniczne z odzyskiwania CATS i przyjęcia na OIOM będą pozyskiwane drogą elektroniczną z krajowego audytu klinicznego pediatrycznej intensywnej terapii (PICANet, University of Leeds i Leicester). Łączenie danych zostanie przeprowadzone przy użyciu numeru wyszukiwania CATS na koniec okresu badania. Gromadzenie tych danych odbywać się będzie według standardowej procedury – wszelkie przekazywanie danych (wnioski o przekazanie danych i zwrot pełnego zbioru) będzie realizowane w sposób bezpieczny (z pełnym szyfrowaniem).

Analiza danych Na początku każdy rodzaj informacji, tj. genetyczna, transkryptomiczna, proteomiczna, epigenetyczna, kliniczna, będzie analizowany oddzielnie, aby na pierwszym etapie zidentyfikować powiązania i korelacje. Zróżnicowane wzorce zachowań i asocjacji zostaną uzyskane za pomocą różnych analiz statystycznych i bioinformatycznych, zarówno jednowymiarowych, jak i wielowymiarowych, jak opisano powyżej. Na drugim etapie informacje zostaną połączone z różnych typów danych w modele predykcyjne. Zastosowane zostanie podejście oparte na biologii systemowej, w ramach którego zostaną zbudowane sieci współregulowanych modułów genetycznych, transkryptomicznych, proteomicznych i epigenetycznych zarówno w kohortach przypadków, jak iw kohortach kontrolnych. Połączenia sieciowe, które będą różne w różnych przypadkach i kontrolach, zostaną zidentyfikowane jako „predyktory” wyniku.

Do wizualizacji tych złożonych sieci zostanie wykorzystane modelowanie graficzne. Konieczna będzie dogłębna analiza statystyczna w celu zidentyfikowania najbardziej wpływowych połączeń, które po usunięciu miałyby największy wpływ na topologię sieci. Modele zostaną udoskonalone, ponownie ocenione, zweryfikowane i powielone w różnych kohortach chorobowych, aż do uzyskania najlepszej możliwej klasyfikacji z próbki. Specjalistyczna wiedza grupy matematycznej i statystycznej zapewni możliwość połączenia wielu warstw informacji biologicznych, od DNA po fenotyp, w ramach podejścia opartego na biologii systemów sieciowych.

Wielkość próby Nie są możliwe żadne formalne obliczenia wielkości próby, ale będziemy rekrutować minimalną liczbę pacjentów w każdej grupie zainteresowania. Naszym celem jest rekrutacja odpowiedniej liczby pacjentów z różnymi przyczynami przyjęcia do badania na oddziałach intensywnej terapii (50-80 pacjentów na grupę zainteresowania).

Czas trwania badania Rekrutacja pacjentów będzie trwała 24 miesiące, z 6-miesięcznym wyprzedzeniem na szkolenie personelu i 6-miesięcznym okresem wstępnym na obserwację pacjentów i uzupełnienie baz danych.

Rekrutacja pacjentów Kwalifikujący się pacjenci będą rekrutowani do badania podczas transportu przez personel medyczny i pielęgniarski z zespołu transportowego intensywnej terapii CATS.

Procedura wyrażania zgody Po ustabilizowaniu się stanu dziecka, zazwyczaj w ciągu 24-48 godzin po przyjęciu na OIOM, będziemy zabiegać o pisemną świadomą zgodę rodziców/opiekunów. Proces wyrażania zgody będzie wspierany przez ulotki informacyjne dla pacjentów. Istnieje kilka precedensów dla tego podejścia w badaniach ratunkowych, w tym w intensywnej terapii pediatrycznej. Wsparcie dla odroczonej zgody w nagłych sytuacjach zagrażających życiu zapewnia również najnowsze rozporządzenie UE w sprawie badań klinicznych (2013).

Głównymi powodami poszukiwania odroczonej zgody w tym badaniu są:

1. Kliniczny: Doraźny transport dzieci na oddział intensywnej terapii to sytuacja nagląca, w której nie można opóźnić leczenia ratującego życie, a transport na OIOM musi zostać przeprowadzony szybko. Ponadto rodzice/opiekunowie mogą nie być obecni w czasie stabilizacji w celu omówienia zgody.
2. Praktyczne: Zabranie dodatkowego członka personelu do transportu wyłącznie w celu uzyskania zgody na badania nie jest możliwe ze względu na ograniczoną przestrzeń w karetce. Całodobowy charakter usługi CATS oraz fakt, że wiele transportów odbywa się jednocześnie, również sprawia, że ​​posiadanie dedykowanego personelu badawczego jest niepraktyczne.
3. Metodyczne: Trudności w uzyskaniu pełnej świadomej zgody mogą skutkować wprowadzeniem błędu selekcji. Ponadto, jeśli próbki do badań nie zostaną pobrane na wczesnym etapie choroby krytycznej, przed rozpoczęciem leczenia (takiego jak płyny lub leki inotropowe), uzyskanie solidnych biomarkerów choroby krytycznej może być błędne. Chociaż kwestie metodologiczne nie mogą stanowić argumentu przemawiającego za włączeniem danych, gdy osoby badane wyraźnie odmawiają zgody, stanowi to etycznie uzasadniony argument za włączeniem próbek lub danych zebranych przed wyrażeniem zgody, a tam, gdzie taka wyraźna odmowa zgody nie istnieje.
4. Etyka: Ze względu na trudności w uzyskaniu świadomej zgody w sytuacji nagłej, najbardziej chorzy pacjenci często poddawani są anegdotycznej praktyce lekarskiej. Odmawianie chorym dzieciom korzyści płynących z nowych badań i strategii terapeutycznych opartych na najbardziej solidnym naukowym zrozumieniu krytycznej choroby może być nieetyczne, co jest celem naszego badania.

Jeśli rodzice/opiekunowie nie chcą lub nie mogą wyrazić zgody lub personel nie jest w stanie nawiązać kontaktu z rodzicami/opiekunami, próbki zostaną wyrzucone i żadne dane kliniczne nie zostaną zebrane.