Investigação sobre os microrganismos em mulheres grávidas

Anteriormente, métodos dependentes de cultura eram usados ​​para detectar infecções bacterianas ou fúngicas, mas a sensibilidade era baixa, pois nem todas as espécies cresciam bem em cultura. Recentemente, métodos moleculares baseados na amplificação por PCR do gene 16S ribossomal RNA (rRNA) bacteriano ou do espaçador interno transcrito (ITS) fúngico seguido de sequenciamento capilar têm sido usados ​​para identificar bactérias e fungos. No entanto, a resolução desse método baseado em sequenciamento capilar (<100 leituras de sequenciamento/amostra) é muito baixa para capturar a maior coleção de microorganismos em uma amostra. Microrganismos menos abundantes, mas possivelmente patogênicos, associados ao comprimento cervical curto permanecem indetectáveis. Para preencher a lacuna atual neste campo, propomos um levantamento mais abrangente das comunidades microbianas no colo do útero de mulheres grávidas por amplificação por PCR da região 16S rRNA, ITS ou outras regiões genômicas com potencial de classificação taxonômica. Isso será seguido pelo sequenciamento de próxima geração (> 40.000 leituras de sequenciamento/amostra), que comprovadamente captura a maioria dos microorganismos em uma amostra.