Investigación sobre los microorganismos en mujeres embarazadas

Anteriormente, se usaban métodos dependientes del cultivo para detectar infecciones bacterianas o fúngicas, pero la sensibilidad era baja, ya que no todas las especies crecían bien en cultivo. Recientemente, se han utilizado métodos moleculares basados ​​en la amplificación por PCR del gen bacteriano 16S ribosomal RNA (rRNA) o el espaciador transcrito interno fúngico (ITS) seguido de secuenciación capilar para identificar bacterias y hongos. Sin embargo, la resolución de dicho método basado en la secuenciación capilar (<100 lecturas de secuenciación/muestra) es demasiado baja para capturar la mayor colección de microorganismos en una muestra. Los microorganismos menos abundantes pero posiblemente patógenos asociados con una longitud cervical corta siguen siendo indetectables. Para abordar la brecha actual en este campo, proponemos realizar un estudio más completo de las comunidades microbianas en el cuello uterino de las mujeres embarazadas mediante la amplificación por PCR de la región 16S rRNA, ITS u otras regiones genómicas con potencial de clasificación taxonómica. A esto le seguirá la secuenciación de última generación (>40 000 lecturas de secuenciación/muestra), que ha demostrado capturar la mayoría de los microorganismos en una muestra.