Бесклеточная ДНК и ее целостность с использованием последовательностей ALU в качестве биомаркера для диагностики рака молочной железы

Рак молочной железы (РМЖ) является наиболее распространенным видом рака у женщин во всем мире и основной причиной смерти от рака среди женщин во всем мире. Маммография является стандартным методом раннего выявления РМЖ во многих странах, ежегодно регистрируется более 1,3 миллиона новых случаев. В то время как программы радиологического скрининга успешно применялись для выявления рака молочной железы на более ранних стадиях, для этой цели пока не выявлено ценных биомаркеров крови. Однако частота ложноположительных отзывов варьируется в зависимости от возраста, плотности груди и постменопаузальной гормональной терапии. У женщин с плотной грудью точность маммографии снижается. Циркулирующие сывороточные маркеры для мониторинга РМЖ разрабатывались в течение нескольких десятилетий. Обычные опухолевые маркеры, такие как раковый антиген 15-3 (СА15-3), карциноэмбриональный антиген (СЕА)) и количество циркулирующих опухолевых клеток (ЦОК), клинически доступны, однако их полезность в основном ограничена пациентами с запущенными и метастатическими до нашей эры (МБК). Следовательно, существует потребность в разработке новых биомаркеров, которые можно использовать в качестве ценных инструментов для выявления пациентов с высоким риском, для прогнозирования прогноза заболевания и, таким образом, для оказания влияния на лечение пациентов. Свободная от клеток ДНК (вкДНК) представляет собой короткие фрагменты нуклеиновых кислот, присутствующие в тираж. Многочисленные исследования также показали повышенный уровень ДНК cf при раке молочной железы. Были выбраны последовательности ALU (Arthrobacter luteus), поскольку они являются наиболее распространенными и активными повторяющимися элементами в геноме человека, обычно длиной 300 нуклеотидов, что составляет более 10% генома. Целостность ДНК рассчитывали как отношение (ALU247/ALU115). Поскольку сайты отжига ALU115 находятся в пределах сайтов отжига ALU247, отношение ALU247 к ALU115 называется целостностью ДНК. Он характеризует характер фрагментации циркулирующей внеклеточной ДНК. Целостность ДНК равна «1», если матричная ДНК не усечена, и «0», если ДНК полностью усечена до фрагментов размером менее 247 п.н. (пара оснований). Таким образом, была оценена его диагностическая и прогностическая потенциальная роль у пациентов с раком молочной железы.