DNA libero cellulare e sua integrità utilizzando le sequenze ALU come biomarcatore per la diagnosi del cancro al seno

Il cancro al seno (BC) è il cancro più comune nelle donne in tutto il mondo ed è la principale causa di morte per cancro tra le donne a livello globale. La mammografia è il metodo standard per la diagnosi precoce di BC in molti paesi, con oltre 1,3 milioni di nuovi casi diagnosticati ogni anno. In Egitto, il cancro al seno è il tumore più comune nelle donne e rappresenta il 38,8% di tutti i tumori femminili. Mentre i programmi di screening radiologico sono stati applicati con successo per rilevare il cancro al seno nelle fasi precedenti, non sono stati ancora identificati preziosi biomarcatori del sangue a tale scopo. Tuttavia, i tassi di richiamo di falsi positivi variano in base all'età, alla densità del seno e alla terapia ormonale postmenopausale, tra l'altro. Per le donne con seni densi, l'accuratezza della mammografia è ridotta. I marker sierici circolanti per il monitoraggio della BC sono in fase di sviluppo da diversi decenni. I marcatori tumorali convenzionali, come l'antigene tumorale 15-3 (CA15-3), l'antigene carcinoembrionale (CEA) e la conta delle cellule tumorali circolanti (CTC), sono clinicamente disponibili, tuttavia la loro utilità è per lo più limitata ai pazienti con malattia avanzata e metastatica aC (MBC). Pertanto, è necessario sviluppare nuovi biomarcatori che possano essere utilizzati come strumenti preziosi per identificare i pazienti ad alto rischio, per prevedere la prognosi della malattia e quindi avere un impatto sulla gestione del paziente. Il DNA libero cellulare (cfDNA) è costituito da brevi frammenti di acidi nucleici presenti la circolazione. Diversi studi hanno anche indicato livelli elevati di cf DNA nel cancro al seno. Sono state scelte le sequenze ALU (Arthrobacter luteus), in quanto sono gli elementi ripetuti più abbondanti e attivi nel genoma umano, tipicamente 300 nucleotidi di lunghezza, che rappresentano oltre il 10% del genoma. L'integrità del DNA è stata calcolata come rapporto di (ALU247/ALU115). Poiché i siti di ricottura di ALU115 si trovano all'interno dei siti di ricottura di ALU247, il rapporto tra ALU247 e ALU115 è definito come integrità del DNA. Caratterizza il modello di frammentazione del DNA libero cellulare circolante. L'integrità del DNA è "1" se il DNA modello non è troncato e "0" se il DNA è completamente troncato in frammenti inferiori a 247 bp (coppia di basi). Pertanto è stato valutato per il suo potenziale ruolo diagnostico e prognostico nei pazienti con carcinoma mammario