Исследование точной медицины
23 марта 2024 г. обновлено: Cesar Rodriguez Valdes, Icahn School of Medicine at Mount Sinai
Персонализированная и прецизионная медицинская платформа по секвенированию рака при множественной миеломе
Это будет двухлетнее исследование для оценки и улучшения секвенирования рака применительно к характеристике молекулярного состава опухоли и выявлению новых терапевтических средств (n = 100).
Участники, которым будет проведена биопсия опухоли для лечения множественной миеломы (ММ), самостоятельно обратятся в исследование или будут направлены своим лечащим врачом.
Сначала участники встретятся с врачом для проверки согласия на исследование и предоставления медицинской информации, информации о лекарствах и семейного анамнеза.
После информированного согласия будут получены образцы биообразцов периферической крови, мазков из щеки и образцы опухолей из костного мозга (аспират и биопсия), периферической крови или любой массы/жидкости, содержащей опухолевые клетки (в результате процедур, указанных в рамках стандартной онкологической помощи). ) для секвенирования рака (CS) (секвенирование всего экзома зародышевой линии и опухолевых геномов, секвенирование РНК транскриптома опухоли, отдельных клеток и анализ CyTOF).
Данные CS будут интерпретироваться посредством идентификации соматических вариаций, сетевого моделирования и профилирования транскриптома рака, чтобы облегчить сопоставление уровней активности генов с сетями и для идентификации генов, активированных или дисрегулируемых в раковых клетках.
Секвенирование и анализ будут проводиться в Центре геномики Медицинской школы Икан на горе Синай.
В тех случаях, когда возможности внутреннего секвенирования не позволяют проводить определенные типы анализа, обезличенные образцы или данные могут быть отправлены третьим лицам для дополнительного анализа.
В исследовании будет использоваться GenPath, подразделение BioReference® Health, LLC для этого проекта, которое является лабораторией, сертифицированной CLIA.
Все генетические тесты будут проводиться в лаборатории, сертифицированной CLIA, и все тесты будут одобрены FDA или Нью-Йорком.
Тест на секвенирование РНК получит одобрение Департамента здравоохранения штата Нью-Йорк (Центр Уодсворта) до того, как результаты будут предоставлены врачам и пациентам.
Образцы будут деидентифицированы и обработаны Центром мониторинга иммунитета человека Mount Sinai (HIMC) перед отправкой во внешнюю лабораторию, сертифицированную CLIA, для секвенирования и анализа.
Интерпретацию будет выполнять многопрофильная команда, в которую входят специалисты по геномике, патологи и врачи, знакомые с конкретным видом рака, диагностированным у участника.
Как только результаты будут доступны, они будут переданы участнику и лечащему врачу во время последующего сеанса результатов, и все полученные результаты будут объяснены.
Настоящее исследование не предназначено для реализации полученных результатов, а только для того, чтобы сообщить о них.
Обзор исследования
Статус
Еще не набирают
Условия
Тип исследования
Наблюдательный
Регистрация (Оцененный)
100
Контакты и местонахождение
В этом разделе приведены контактные данные лиц, проводящих исследование, и информация о том, где проводится это исследование.
Контакты исследования
- Имя: Katherine Vandris
- Электронная почта: Katherine.Vandris@mssm.edu
Учебное резервное копирование контактов
- Имя: Cesar Rodriguez Valdes, MD, PhD
- Номер телефона: (212) 241-7873
- Электронная почта: Cesar.Rodriguez@mssm.edu
Места учебы
-
-
New York
-
New York, New York, Соединенные Штаты, 10029
- Mount Sinai Health System
-
Контакт:
- Katherine Vandris
- Электронная почта: Katherine.Vandris@mssm.edu
-
Контакт:
- Cesar Rodriguez Valdes, MD, PhD
- Электронная почта: Cesar.Rodriguez@mssm.edu
-
Главный следователь:
- Cesar Rodriguez Valdes
-
-
Критерии участия
Исследователи ищут людей, которые соответствуют определенному описанию, называемому критериям приемлемости. Некоторыми примерами этих критериев являются общее состояние здоровья человека или предшествующее лечение.
Критерии приемлемости
Возраст, подходящий для обучения
- Взрослый
- Пожилой взрослый
Принимает здоровых добровольцев
Нет
Метод выборки
Невероятностная выборка
Исследуемая популяция
Это исследование открыто для заинтересованных пациентов с множественной миеломой (ММ) всех полов и рас, проживающих на горе Синай или за ее пределами, у которых будут взяты образцы опухолей (костного мозга или тканей) в рамках оценки возможности спасательной терапии.
Исследовательская группа примет участников с диагнозом ММ, которые обратились самостоятельно или были направлены своим лечащим врачом, которым будет проведена биопсия опухоли (костного мозга или ткани) с намерением получить спасительную системную терапию для их ММ.
Заинтересованные лица могут связаться с исследовательской группой и узнать больше об исследовании.
Потенциальные участники поговорят с одним из сотрудников исследования по телефону, получат дополнительную информацию об исследовании, пройдут предварительную проверку на соответствие требованиям и будут готовы к получению информированного согласия.
Описание
Критерии включения:
- На момент регистрации пациентам должно быть 18 лет.
- Участник должен иметь установленный диагноз рецидива множественной миеломы на основании критериев IMWG, быть готовым к участию и иметь возможность дать согласие.
- У участника должен быть лечащий врач, который согласен участвовать в исследовании.
- Участнику будет проведена биопсия костного мозга или биопсия опухоли в рамках стандартного лечения.
- Пациенты должны быть готовы участвовать в этом исследовании и иметь возможность подписать информированное согласие.
- Участники не участвуют ни в каких интервенционных клинических исследованиях с использованием системной терапии, направленной на контроль ММ.
Критерий исключения
- Известный диагноз AL-амилоидоза, макроглобулинемии Вальденстрема, POEMS или болезни Кастлемана.
- Диагноз рака, отличного от миеломы или рака кожи (плоскоклеточного или базальноклеточного), который продолжается или лечится в течение последних 2 лет.
- Образец опухоли неадекватен или недоступен для анализа (например, из-за недостаточного количества опухолевых клеток).
- Пациент не будет получать системную химиотерапию/иммунотерапию, направленную на ММ, в течение следующих 2 месяцев с момента проведения биопсии опухоли.
Учебный план
В этом разделе представлена подробная информация о плане исследования, в том числе о том, как планируется исследование и что оно измеряет.
Как устроено исследование?
Детали дизайна
Когорты и вмешательства
Группа / когорта |
|---|
|
Участники с множественной миеломой
Участники, которым предстоит пройти биопсию опухоли для лечения множественной миеломы (ММ)
|
Что измеряет исследование?
Первичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Общее количество соматических однонуклеотидных вариантов (SNV) на одного пациента
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество генетических изменений, обнаруженных в геноме посредством генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
Данный вариант может описывать изменение, которое является доброкачественным, патогенным или неизвестного значения.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Вторичные показатели результатов
Мера результата |
Мера Описание |
Временное ограничение |
|---|---|---|
|
Общее количество соматических инсерций (INS) на одного пациента
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Общее количество соматических инсерций (INS) на одного пациента.
Число случаев ошибочного добавления нуклеотидов в геном, определенное путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Общее количество соматических делеций (DEL) на одного пациента
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Число случаев, когда нуклеотиды были ошибочно исключены из генома, определяется путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Количество SNV на мегабазу генома ММ
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество генетических изменений, обнаруженных в опухолевых клетках ММ посредством секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Количество ИНС на мегабазу генома ММ
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество случаев, когда нуклеотиды были ошибочно добавлены в геном опухоли ММ, на длину ДНК, определенное путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Количество DEL на мегабазу генома ММ
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество случаев, когда нуклеотиды были ошибочно исключены из генома опухоли ММ, на длину ДНК, что определяется путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Количество мутаций на мегабазу среди подгрупп ММ
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество генетических изменений, обнаруживаемых у >1 % или <1 % населения, на длину ДНК, среди подгрупп множественной миеломы (ММ), определяемое путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Количество мутаций на мегабазу среди геномных регионов для всех ММ и мутационных подгрупп
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество генетических изменений, обнаруживаемых у >1 % или <1 % популяции, на длину ДНК, по генетическому участку (т. е. промотору, кодирующей области и терминирующей последовательности) для всех ММ и мутационных подгрупп, как определено генетически секвенирование и сравнение с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Выявлены генные мутации
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество и тип генетических изменений, обнаруживаемых у >1 % или <1 % идентифицированной популяции, что определяется путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Выявлены хромосомные аномалии
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
. Количество и типы выявленных хромосомных аномалий определяются путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Молекулярные сигнатуры идентифицированы
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество и тип наборов выявленных биомолекулярных особенностей, которые могут быть полезны для прогнозирования течения заболевания или реакции на терапевтическое вмешательство среди пациентов с ММ и другими видами рака, что определяется путем секвенирования, а также вариаций набора генов и целевого анализа лекарств.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Установлено Выявлены прогностические маркеры
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Выявлено количество и тип установленных прогностических маркеров.
Оценка биологических характеристик, которые, как известно, полезны для прогнозирования течения заболевания или ответа на терапевтическое вмешательство среди пациентов с ММ и другими видами рака, что определяется путем секвенирования и сравнения с базами данных известных прогностических маркеров.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Соматические варианты, идентифицированные как мишени для препаратов, одобренных FDA (данные фармакогеномики вариантов)
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество и тип генетических изменений, обнаруженных в геноме, которые можно лечить с помощью одобренных FDA методов лечения, определяемых путем секвенирования и сравнения с базами данных известных мишеней и связанных с ними лекарств, одобренных FDA.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Обнаружены варианты ключевых драйверов, информируемых о сети
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество и тип мутаций, которые, как известно, приводят к трансформации, росту и распространению раковых клеток в организме, определяются путем генетического секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью, а также с базами данных известных мутаций, вызывающих рак.
Эти мутации будут разделены на следующие категории: те, которые являются известными мишенями для лекарств, одобренных FDA, те, которые могут быть мишенью для разрабатываемых лекарств, которые еще не одобрены FDA, и те, которые могут служить мишенями для новых методов лечения.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Выявлены вариации транскриптома
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество и тип вариаций транскриптома, идентифицированных с потенциалом для разработки новых терапевтических средств (белки, экспрессируемые на клеточной поверхности, которые, по-видимому, пригодны для разработки вакцин), как определено с помощью секвенирования, сетевого моделирования и профилирования ракового транскриптома.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Зародышевые мутации выявлены в генах предрасположенности к раку
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество и тип мутаций зародышевой линии, выявленных в генах предрасположенности к раку, определенные путем геномного секвенирования и сравнения с наиболее распространенной генетической последовательностью.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Доступны одобренные FDA препараты, которые блокируют ферменты, вырабатываемые указанными путями.
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Количество и тип доступных одобренных FDA препаратов, которые блокируют ферменты, вырабатываемые в этих путях, идентифицируются путем сравнения геномных и транскриптомных результатов с базами данных известных одобренных FDA лекарств и связанных с ними мишеней.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Лечение, рекомендованное вычислительным конвейером на основе клинических и генетических данных пациента.
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Список рекомендуемых методов лечения, определенный путем секвенирования, анализа микроокружения опухоли и компьютерного анализа.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Профиль секвенирования всего экзома зародышевой линии
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Результаты полноэкзомного секвенирования генома зародышевой линии.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Профиль секвенирования всего экзома генома опухоли
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Результаты полноэкзомного секвенирования опухолевого генома.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Профиль транскриптома опухоли
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Результаты секвенирования РНК транскриптома опухоли.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Профиль одноклеточного секвенирования
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Результаты анализа секвенирования отдельных клеток.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Цитометрический профиль
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Результаты цитометрического анализа по времени пролета (CyTOF).
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Связанные сигнальные пути
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Сигнальные пути, связанные с каждой генной мутацией, хромосомной аномалией и молекулярной сигнатурой, т.е. старением, дефектной репарацией ДНК и комплексом редактирования аполипопротеина B (APOBEC)/активационной дезаминазной активностью, идентифицированными в цели 1, как определено с помощью секвенирования и компьютерного анализа.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Идентифицированы ферменты, связанные с каждым сигнальным путем
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Ферменты, связанные с каждым сигнальным путем, идентифицированы с помощью секвенирования и компьютерного анализа.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
|
Улучшение рекомендаций по лечению рака на основе секвенирования с помощью машинного обучения
Временное ограничение: Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Использование вычислений искусственного интеллекта для реализации рекомендуемых методов лечения на основе секвенирования рака и повышения точности прогнозирования лечения, чтобы обеспечить лучшую интерпретацию данных секвенирования рака и способствовать разработке персонализированных и прецизионных методов лечения рака.
Улучшение будет измеряться путем отслеживания точности машинного обучения и оценки полученных данных с помощью статистического анализа.
|
Окончание обучения через 30 месяцев.
|
Соавторы и исследователи
Здесь вы найдете людей и организации, участвующие в этом исследовании.
Соавторы
Следователи
- Главный следователь: Cesar Rodriguez Valdes, MD, PhD, Icahn School of Medicine at Mount Sinai
Даты записи исследования
Эти даты отслеживают ход отправки отчетов об исследованиях и сводных результатов на сайт ClinicalTrials.gov. Записи исследований и сообщаемые результаты проверяются Национальной медицинской библиотекой (NLM), чтобы убедиться, что они соответствуют определенным стандартам контроля качества, прежде чем публиковать их на общедоступном веб-сайте.
Изучение основных дат
Начало исследования (Оцененный)
1 июня 2024 г.
Первичное завершение (Оцененный)
1 июня 2026 г.
Завершение исследования (Оцененный)
1 июня 2026 г.
Даты регистрации исследования
Первый отправленный
23 марта 2024 г.
Впервые представлено, что соответствует критериям контроля качества
23 марта 2024 г.
Первый опубликованный (Действительный)
29 марта 2024 г.
Обновления учебных записей
Последнее опубликованное обновление (Действительный)
29 марта 2024 г.
Последнее отправленное обновление, отвечающее критериям контроля качества
23 марта 2024 г.
Последняя проверка
1 марта 2024 г.
Дополнительная информация
Термины, связанные с этим исследованием
Дополнительные соответствующие термины MeSH
- Сердечно-сосудистые заболевания
- Сосудистые заболевания
- Заболевания иммунной системы
- Новообразования по гистологическому типу
- Новообразования
- Лимфопролиферативные заболевания
- Иммунопролиферативные заболевания
- Гематологические заболевания
- Геморрагические расстройства
- Нарушения гемостаза
- Парапротеинемии
- Нарушения белков крови
- Множественная миелома
- Новообразования, Плазматические клетки
Другие идентификационные номера исследования
- STUDY-23-00503
- GCO 19-0175 (Другой номер гранта/финансирования: Icahn School of Medicine at Mount Sinai)
- 5R01CA244899 (Грант/контракт NIH США)
Планирование данных отдельных участников (IPD)
Планируете делиться данными об отдельных участниках (IPD)?
ДА
Описание плана IPD
Данные отдельных участников, лежащие в основе результатов, представленных в этой статье, после деидентификации (текст, таблицы, рисунки и приложения).
Сроки обмена IPD
Начинается через 9 месяцев и заканчивается через 36 месяцев после публикации статьи.
Критерии совместного доступа к IPD
Исследователи, которые предоставляют методологически обоснованное предложение.
Для достижения целей в одобренном предложении.
Предложения могут быть поданы в течение 36 месяцев после публикации статьи.
Через 36 месяцев данные будут доступны в хранилище данных университета, но без поддержки исследователей, кроме депонированных метаданных.
Информацию о подаче предложений и доступе к данным можно найти по адресу (ссылка будет определена позднее).
Совместное использование IPD Поддерживающий тип информации
- САП
Информация о лекарствах и устройствах, исследовательские документы
Изучает лекарственный продукт, регулируемый FDA США.
Нет
Изучает продукт устройства, регулируемый Управлением по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов США.
Нет
Эта информация была получена непосредственно с веб-сайта clinicaltrials.gov без каких-либо изменений. Если у вас есть запросы на изменение, удаление или обновление сведений об исследовании, обращайтесь по адресу register@clinicaltrials.gov. Как только изменение будет реализовано на clinicaltrials.gov, оно будет автоматически обновлено и на нашем веб-сайте. .