Genetická regulace nedostatku surfaktantu
4. června 2021 aktualizováno: Washington University School of Medicine
Genetická regulace nedostatku surfaktantu u lidských novorozenců
Dědičné nedostatky v kterémkoli ze 3 genů (povrchově aktivní protein B, povrchově aktivní protein C a ATP-vazebný kazetový transportér A3) mohou způsobit neonatální syndrom respirační tísně narušením metabolismu plicního surfaktantu.
Výzkumníci použijí nejmodernější metody ke spojení specifických změn v genetickém kódu každého z těchto genů s narušením jednotlivých kroků v metabolismu plicního surfaktantu u lidských novorozenců.
Tyto studie povedou ke zlepšení diagnostických schopností a navrhnou nové strategie pro nápravu nedostatku surfaktantu u novorozenců.
Přehled studie
Detailní popis
Genetická regulace nedostatku plicního surfaktantu u novorozenců byla navržena studiemi pohlaví, genetických vazeb, rekurentních rodinných případů, cílené genové ablace u myších linií a rasových rozdílů v riziku syndromu neonatální respirační tísně.
Úspěšný fetálně-neonatální plicní přechod vyžaduje produkci plicního surfaktantu, fosfolipidového proteinového filmu, který vystýlá alveoly a udržuje alveolární průchodnost na konci výdechu.
Naším cílem je porozumět genetickým mechanismům, které narušují metabolismus plicních surfaktantů a způsobují neonatální syndrom respirační tísně.
Studie na lidských novorozencích prokázaly, že pro metabolismus povrchově aktivní látky jsou rozhodující 3 geny: povrchově aktivní protein B (SFTPB), povrchově aktivní protein C (SFTPC) a transportér kazety vázající ATP, ABCA3 (ABCA3).
Abychom porozuměli genetickým regulačním mechanismům, budeme zkoumat příspěvek variací v každém z těchto genů k riziku neonatálního syndromu respirační tísně testováním hypotézy, že genetické varianty v SFTPB, SFTPC a ABCA3 narušují metabolismus plicního surfaktantu.
Použití vysoce výkonného automatizovaného sekvenování na genotyp, vícerozměrné technologie identifikace proteinů k posouzení kvantitativních a kvalitativních rozdílů v expresi povrchově aktivních proteinů B a C, metabolické značení in vivo se stabilními izotopově značenými prekurzory k odhadu rychlosti metabolismu povrchově aktivních proteinů B a C a fosfolipidů a velikosti kohort které poskytují statistickou sílu (0,8), použijeme rasově specifickou, závažně stratifikovanou kontrolu případů (N=480) a srovnání případů (N=250), abychom pochopili geneticky regulované metabolické mechanismy, které způsobují nedostatek surfaktantu narušením exprese nebo změna zpracování povrchově aktivních proteinů B nebo C nebo narušení složení povrchově aktivních fosfolipidů u lidských novorozenců.
Lepší porozumění genetické regulaci nedostatku surfaktantu navrhne nové diagnostické strategie pro identifikaci a kategorizaci vysoce rizikových kojenců a terapeutické strategie, které se zaměřují na jednotlivé kroky v metabolismu plicního surfaktantu, aby se zlepšily výsledky kojenců se syndromem neonatální respirační tísně.
Typ studie
Pozorovací
Zápis (Aktuální)
525
Kontakty a umístění
Tato část poskytuje kontaktní údaje pro ty, kteří studii provádějí, a informace o tom, kde se tato studie provádí.
Studijní místa
-
-
Missouri
-
Saint Louis, Missouri, Spojené státy, 63110
- St. Louis Children's Hospital
-
-
Kritéria účasti
Výzkumníci hledají lidi, kteří odpovídají určitému popisu, kterému se říká kritéria způsobilosti. Některé příklady těchto kritérií jsou celkový zdravotní stav osoby nebo předchozí léčba.
Kritéria způsobilosti
Věk způsobilý ke studiu
1 den až 6 měsíců (Dítě)
Přijímá zdravé dobrovolníky
Ne
Pohlaví způsobilá ke studiu
Všechno
Metoda odběru vzorků
Vzorek nepravděpodobnosti
Studijní populace
Studovaná populace zahrnuje kojence s neonatálním syndromem dechové tísně a bez něj (N=513) a kojence s různou závažností syndromu neonatální dechové tísně (N=12).
Popis
Kritéria pro zařazení:
- Novorozenci se syndromem respirační tísně, kteří vyžadují mechanickou ventilaci pomocí endotracheální kanyly nebo tracheostomie v prvních 6 měsících života
Kritéria vyloučení:
- Kojenci s podmínkami, které mohou způsobit bezprostřední smrt
Studijní plán
Tato část poskytuje podrobnosti o studijním plánu, včetně toho, jak je studie navržena a co studie měří.
Jak je studie koncipována?
Detaily designu
- Observační modely: Case-Control
- Časové perspektivy: Budoucí
Kohorty a intervence
Skupina / kohorta |
Intervence / Léčba |
|---|---|
|
Genetická asociace
Kojenci s neonatálním syndromem dechové tísně a bez něj podstupují sekvenování genů surfaktantu, aby se identifikovaly genomové varianty spojené s neonatálním syndromem dechové tísně
|
|
|
Živina
Novorozencům se syndromem respirační tísně podáváme stabilní izotopicky značené živiny (prekurzory povrchově aktivních fosfolipidů nebo proteinů), abychom umožnili srovnání obratu povrchově aktivních fosfolipidů a proteinů na základě hmotnostní spektrometrie.
|
Kojencům s novorozeneckým syndromem dechové tísně podáváme stabilní izotopicky značené prekurzory surfaktantu fosfolipidů ([1-13C1]acetát) a surfaktantu protein-B ([5,5,5-2H3] leucin).
Pomocí hmotnostní spektrometrie měříme inkorporaci stabilních izotopicky značených prekurzorů v tracheálních aspirátech a porovnáváme obrat surfaktantu fosfolipidu a surfaktantu protein-B.
Ostatní jména:
|
Co je měření studie?
Primární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Asociace specifických variant nebo interakcí mezi variantami v SFTPB, SFTPC a ABCA3 se syndromem neonatální respirační tísně
Časové okno: 1 týden
|
Statistická asociace zvýšeného rizika novorozenecké respirační tísně u donošených nebo předčasně narozených dětí se specifickými genomickými variantami v SFTPB, SFTPC a ABCA3
|
1 týden
|
Sekundární výstupní opatření
Měření výsledku |
Popis opatření |
Časové okno |
|---|---|---|
|
Asociace specifických variant nebo interakcí mezi variantami v SFTPB, SFTPC a ABCA3 s frakční rychlostí syntézy a/nebo frakční katabolickou rychlostí povrchově aktivních fosfolipidů, povrchově aktivního proteinu-B a povrchově aktivního proteinu-C
Časové okno: 1 týden
|
Statistická asociace kvantitativních metabolických charakteristik povrchově aktivních fosfolipidů se specifickými genomovými variantami v SFTPB, SFTPC a ABCA3
|
1 týden
|
Spolupracovníci a vyšetřovatelé
Zde najdete lidi a organizace zapojené do této studie.
Spolupracovníci
Vyšetřovatelé
- Vrchní vyšetřovatel: F. S. Cole, M.D., Washington University School of Medicine
Publikace a užitečné odkazy
Osoba odpovědná za zadávání informací o studiu tyto publikace poskytuje dobrovolně. Mohou se týkat čehokoli, co souvisí se studiem.
Obecné publikace
- Tomazela DM, Patterson BW, Hanson E, Spence KL, Kanion TB, Salinger DH, Vicini P, Barret H, Heins HB, Cole FS, Hamvas A, MacCoss MJ. Measurement of human surfactant protein-B turnover in vivo from tracheal aspirates using targeted proteomics. Anal Chem. 2010 Mar 15;82(6):2561-7. doi: 10.1021/ac1001433.
- Hamvas A, Heins HB, Guttentag SH, Wegner DJ, Trusgnich MA, Bennet KW, Yang P, Carlson CS, An P, Cole FS. Developmental and genetic regulation of human surfactant protein B in vivo. Neonatology. 2009;95(2):117-24. doi: 10.1159/000153095. Epub 2008 Sep 6.
- Hamvas A, Nogee LM, Wegner DJ, Depass K, Christodoulou J, Bennetts B, McQuade LR, Gray PH, Deterding RR, Carroll TR, Kammesheidt A, Kasch LM, Kulkarni S, Cole FS. Inherited surfactant deficiency caused by uniparental disomy of rare mutations in the surfactant protein-B and ATP binding cassette, subfamily a, member 3 genes. J Pediatr. 2009 Dec;155(6):854-859.e1. doi: 10.1016/j.jpeds.2009.06.006. Epub 2009 Aug 3.
- McBee AD, Wegner DJ, Carlson CS, Wambach JA, Yang P, Heins HB, Saugstad OD, Trusgnich MA, Watkins-Torry J, Nogee LM, Henderson H, Cole FS, Hamvas A. Recombination as a mechanism for sporadic mutation in the surfactant protein-C gene. Pediatr Pulmonol. 2008 May;43(5):443-50. doi: 10.1002/ppul.20782.
- Garmany TH, Wambach JA, Heins HB, Watkins-Torry JM, Wegner DJ, Bennet K, An P, Land G, Saugstad OD, Henderson H, Nogee LM, Cole FS, Hamvas A. Population and disease-based prevalence of the common mutations associated with surfactant deficiency. Pediatr Res. 2008 Jun;63(6):645-9. doi: 10.1203/PDR.0b013e31816fdbeb.
- Wambach JA, Yang P, Wegner DJ, An P, Hackett BP, Cole FS, Hamvas A. Surfactant protein-C promoter variants associated with neonatal respiratory distress syndrome reduce transcription. Pediatr Res. 2010 Sep;68(3):216-20. doi: 10.1203/PDR.0b013e3181eb5d68.
- Anadkat JS, Kuzniewicz MW, Chaudhari BP, Cole FS, Hamvas A. Increased risk for respiratory distress among white, male, late preterm and term infants. J Perinatol. 2012 Oct;32(10):780-5. doi: 10.1038/jp.2011.191. Epub 2012 Jan 5.
- Agrawal A, Hamvas A, Cole FS, Wambach JA, Wegner D, Coghill C, Harrison K, Nogee LM. An intronic ABCA3 mutation that is responsible for respiratory disease. Pediatr Res. 2012 Jun;71(6):633-7. doi: 10.1038/pr.2012.21. Epub 2012 Feb 15.
- Bereman MS, Tomazela DM, Heins HS, Simonato M, Cogo PE, Hamvas A, Patterson BW, Cole FS, MacCoss MJ. A method to determine the kinetics of multiple proteins in human infants with respiratory distress syndrome. Anal Bioanal Chem. 2012 Jun;403(8):2397-402. doi: 10.1007/s00216-012-5953-3. Epub 2012 Apr 14.
- Wambach JA, Wegner DJ, Depass K, Heins H, Druley TE, Mitra RD, An P, Zhang Q, Nogee LM, Cole FS, Hamvas A. Single ABCA3 mutations increase risk for neonatal respiratory distress syndrome. Pediatrics. 2012 Dec;130(6):e1575-82. doi: 10.1542/peds.2012-0918. Epub 2012 Nov 19.
- Wambach JA, Wegner DJ, Heins HB, Druley TE, Mitra RD, Hamvas A, Cole FS. Synonymous ABCA3 variants do not increase risk for neonatal respiratory distress syndrome. J Pediatr. 2014 Jun;164(6):1316-21.e3. doi: 10.1016/j.jpeds.2014.02.021. Epub 2014 Mar 20.
- Wambach JA, Casey AM, Fishman MP, Wegner DJ, Wert SE, Cole FS, Hamvas A, Nogee LM. Genotype-phenotype correlations for infants and children with ABCA3 deficiency. Am J Respir Crit Care Med. 2014 Jun 15;189(12):1538-43. doi: 10.1164/rccm.201402-0342OC.
- Jackson T, Wegner DJ, White FV, Hamvas A, Cole FS, Wambach JA. Respiratory failure in a term infant with cis and trans mutations in ABCA3. J Perinatol. 2015 Mar;35(3):231-2. doi: 10.1038/jp.2014.236.
Termíny studijních záznamů
Tato data sledují průběh záznamů studie a předkládání souhrnných výsledků na ClinicalTrials.gov. Záznamy ze studií a hlášené výsledky jsou před zveřejněním na veřejné webové stránce přezkoumány Národní lékařskou knihovnou (NLM), aby se ujistily, že splňují specifické standardy kontroly kvality.
Hlavní termíny studia
Začátek studia
1. listopadu 2007
Primární dokončení (Aktuální)
1. března 2013
Dokončení studie (Aktuální)
1. března 2013
Termíny zápisu do studia
První předloženo
22. ledna 2009
První předloženo, které splnilo kritéria kontroly kvality
22. ledna 2009
První zveřejněno (Odhad)
23. ledna 2009
Aktualizace studijních záznamů
Poslední zveřejněná aktualizace (Aktuální)
7. června 2021
Odeslaná poslední aktualizace, která splnila kritéria kontroly kvality
4. června 2021
Naposledy ověřeno
1. června 2021
Více informací
Termíny související s touto studií
Klíčová slova
Další relevantní podmínky MeSH
Další identifikační čísla studie
- 07-0156
- R01HL082747 (Grant/smlouva NIH USA)
Plán pro data jednotlivých účastníků (IPD)
Plánujete sdílet data jednotlivých účastníků (IPD)?
Ne
Popis plánu IPD
Zadejte objevené genomické varianty do dbGaP
Informace o lécích a zařízeních, studijní dokumenty
Studuje lékový produkt regulovaný americkým FDA
Ano
Studuje produkt zařízení regulovaný americkým úřadem FDA
Ne
Tyto informace byly beze změn načteny přímo z webu clinicaltrials.gov. Máte-li jakékoli požadavky na změnu, odstranění nebo aktualizaci podrobností studie, kontaktujte prosím register@clinicaltrials.gov. Jakmile bude změna implementována na clinicaltrials.gov, bude automaticky aktualizována i na našem webu .
Klinické studie na Syndrom respirační tísně, novorozenec
-
University of GaziantepDokončenoCOVID-19-související akutní respirační distress syndrom (ARDS)Turecko (Türkiye)
-
Massachusetts General HospitalNational Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases (NIDDK)NáborPoruchy krmení a příjmu potravy | Funkční dyspepsie | Dyspepsie | Porucha vyhýbání se/omezujícímu příjmu potravy | Regulace chuti k jídlu | Kognitivně behaviorální terapie | Postprandiální distress syndrom | Behaviorální medicínaSpojené státy
Klinické studie na Živina
-
Biologica IncZatím nenabírámeMenopauzaSpojené státy
-
K-PAX Pharmaceuticals, Inc.VA Palo Alto Health Care SystemNeznámýNemoc války v ZálivuSpojené státy
-
Etlik Zubeyde Hanım Women's Health Care, Training...DokončenoVliv hladin antimulleriánského hormonu na index zánětu, fytochemický index a hustotu živin NRF (AMH)Syndrom polycystických vaječníků | Dietní návyk | AMH | Selhání vaječníkůKrocan
-
International Centre for Diarrhoeal Disease Research...University Ghent; United Nations World Food Programme (WFP); Action Contre la...Zatím nenabírámeStřední akutní podvýživaBangladéš
-
K-PAX Pharmaceuticals, Inc.NeznámýChronický únavový syndrom (CFS) | Myalgická encefalomyelitida (ME)Spojené státy
-
Columbia UniversityStaženoCrohnova nemocSpojené státy