Progrese onemocnění a léčbou indukované změny u glioblastomu

Cíle projektu:

Cílem této studie je systematicky analyzovat morfologické a molekulární změny spojené s progresí glioblastomu a rezistencí na terapii v odpovídajících pre- a postterapeutických vzorcích glioblastomu.

Budou se věnovat následujícím primárním cílům:

1. Morfologická charakterizace změn ve velké sérii odpovídajících tkání glioblastomu týkajících se i. Vaskularizace a faktory zprostředkované hypoxií ii. Nekróza nádoru a nekróza indukovaná chemoradiací iii. Zánětlivá odpověď iv. Celularita a proliferace nádoru v. Fenotyp nádorových buněk po léčbě, např. glio-mezenchymální přechod

2. Molekulární analýzy

   i. Bude provedena transkriptomie, metylace DNA a genomové profilování za účelem detekce změn v genové expresi, methylaci a aberací počtu kopií v postterapeutickém období ve srovnání s nádorovou tkání před terapií. ii. Bude analyzován vztah mezi transkriptomickým, DNA metylačním a genomickým profilem.

3. Průzkumná analýza souvislostí mezi morfologickými a molekulárními změnami ve screeningovém souboru 30 případů glioblastomu (s dostupnými čerstvými zmrazenými tkáněmi při první a druhé operaci) a následná validace relevantních nálezů ve větší kohortě glioblastomů (150 případů s odpovídajícím parafinem fixovaným formalínem). zapuštěné tkáně) vhodnými metodami včetně imunohistochemie, fluorescenční hybridizace in situ a sekvenování.
4. Zvláštní pozornost bude věnována genderově specifickým vzorcům změn souvisejících s léčbou a progrese nádoru.