Testování stolice pomocí molekulárního testu k minimalizaci kontaktních opatření

Akutní infekční gastroenteritida může být způsobena viry, bakteriemi nebo parazity, což vede k průjmovému onemocnění, které může být doprovázeno horečkou, bolestmi břicha a/nebo křečemi, hematochezií, nevolností a zvracením. Gastrointestinální infekce se každý rok rozvine až u 12,5 % až 25 % populace, přičemž většina případů sama odezní a symptomy obvykle odezní do 14 dnů bez léčby. Zatímco naprostá většina z odhadovaných 4 milionů Kanaďanů, u kterých se rozvine gastroenteritida, má mírné a samoomezující onemocnění, přibližně 9 250 až 14 150 je každý rok hospitalizováno, přičemž 1,6 % až 2,2 % na tuto chorobu umírá.

U hospitalizovaných pacientů budou většině odebírány vzorky stolice a testovány pomocí standardních mikrobiologických metod, které zahrnují kultivaci na bakterie, amplifikaci nukleové kyseliny na viry a bakterie a mikroskopii nebo enzymatické imunoanalýzy na parazity. Počet patogenů, které lze identifikovat, je ve většině mikrobiologických laboratoří omezený a doba zpracování hlášení může trvat až 3 dny. Nedávno byly vyvinuty nové technologie amplifikace nukleových kyselin, které dokážou testovat více gastrointestinálních patogenů v jediném cyklu, který obvykle trvá méně než 1 den.

BioFire® FilmArray Gastrointestinal Panel (FGP) je test multiplexní polymerázové řetězové reakce, který dokáže současně testovat 22 různých virů, bakterií a parazitů s vynikající citlivostí a specifitou s dobou obratu 1 hodinu. Ve srovnání s konvenčními testovacími metodami stojí FGP o 40 % více, tedy asi 180 USD (CDN) za test. Navzdory detekci více patogenů v kratším časovém období nenalezl nedávný systematický přehled žádné důkazy, které by podporovaly pozitivní dopad buď na lepší výsledky pacientů, nebo na nákladovou efektivitu ve srovnání s konvenčním testováním. Vzhledem k tomu, že většina epizod gastrointestinálních onemocnění je mírná a sama odezní, nemusí být proveditelné navrhnout randomizovanou studii, která by prokázala klinickou účinnost testované léčby, protože většina z 22 patogenů detekovaných FGP nemá z antimikrobiální terapie prospěch. Místo toho měření jiných výsledků, jako je snížené využití nemocničních zdrojů, jako jsou dny izolace kontaktů, by mohlo poskytnout důkazy jak pro klinický přínos, tak pro nákladovou efektivitu.

K dnešnímu dni byly dostupné důkazy o nákladové efektivitě testu FGP založeny převážně na observačních studiích, obvykle historicky kontrolovaných provedeních před a po, spojených s vysokým rizikem zkreslení. Jediná studie, která měla dostatečnou kvalitu na to, aby mohla být zahrnuta do systematického přezkumu nákladové efektivity, používala jiný test založený na PCR. Protože se ukázalo, že test FGP má velmi podobné diagnostické charakteristiky v přímém srovnání s tímto jiným testem založeným na PCR, výsledky budou použity k informování primárního výsledku této studie. Ve studii Goldenberga et al. byly odhadnuty rozdíly ve dnech kontaktní izolace mezi konvenčním (pozorovaným) a testováním založeným na PCR (simulované) a bylo zjištěno, že vedly ke snížení kontaktních dní izolace o 34,3 % ve skupině založené na PCR. Mezi 800 pacienty to znamenalo průměrné snížení o 0,94 kontaktního dne izolace na pacienta. Intervaly spolehlivosti bohužel nebyly pro tento bodový odhad odhadnuty. Náklady na jeden den izolace byly za fiskální rok 2011/2012 vykázány jako přibližně 88 GBP (UK). Analýza zvratu prokázala, že ke kompenzaci zvýšených nákladů spojených s testem založeným na PCR bylo zapotřebí snížení o 252 dnů kontaktní izolace, tedy snížení o 11,4 %. Cena testu založeného na PCR použitého v této studii byla 0,4krát vyšší než cena testu FGP, což naznačuje, že počet kontaktních izolačních dnů potřebných k dosažení rovnováhy s testem FGP by mohl být až 635. V novější konferenční zprávě o randomizované studii ve Spojeném království využívající FGP odhadla průběžná analýza snížení počtu dní izolace kontaktu o 0,9 dne na pacienta (95% CI 0,4 až 1,6). Nebyly poskytnuty žádné údaje o nákladové efektivnosti. Vzhledem k rozsahu nejistoty ohledně klinické účinnosti a nákladové efektivity testu FGP by nejlepší možností k vyřešení těchto nejistot byla randomizovaná studie test-léčba.