Afføringstest med molekylær analyse for at minimere kontaktforholdsregler

Akut infektiøs gastroenteritis kan være forårsaget af vira, bakterier eller parasitter, hvilket resulterer i en diarrésygdom, der kan være ledsaget af feber, mavesmerter og/eller kramper, hæmatochezi, kvalme og opkastning. Op til 12,5 % til 25 % af befolkningen udvikler en gastrointestinal infektion hvert år, hvor størstedelen af ​​tilfældene er selvbegrænsende, og symptomerne forsvinder normalt inden for 14 dage uden behandling. Mens langt størstedelen af ​​de anslåede 4 millioner canadiere, der udvikler gastroenteritis, har en mild og selvbegrænset sygdom, bliver ca. 9 250 til 14 150 indlagt hvert år, og 1,6 % til 2,2 % dør af deres sygdom.

For hospitalsindlagte patienter vil størstedelen få afføringsprøver indsamlet og testet ved hjælp af standard mikrobiologiske metoder, der inkluderer dyrkning for bakterier, nukleinsyreamplifikation for vira og bakterier og mikroskopi eller enzymimmunoassays for parasitter. Antallet af patogener, der kan identificeres, er begrænset i de fleste mikrobiologiske laboratorier, og behandlingstiden til indberetning kan tage op til 3 dage. For nylig er der udviklet nye nukleinsyreamplifikationsteknologier, der kan teste for flere gastrointestinale patogener i en enkelt kørsel, der normalt tager mindre end 1 dags behandlingstid at rapportere.

BioFire® FilmArray Gastrointestinal Panel (FGP) er en multipleks polymerase-kædereaktionstest, der samtidigt kan teste for 22 forskellige vira, bakterier og parasitter med fremragende sensitivitet og specificitet med en behandlingstid på 1 time. Sammenlignet med konventionelle testmetoder koster FGP 40% mere, eller omkring $180 (CDN) pr. test. På trods af påvisning af flere patogener på kortere tid, fandt en nylig systematisk gennemgang ingen beviser, der understøtter en positiv indvirkning på hverken forbedrede patientresultater eller omkostningseffektivitet sammenlignet med konventionel test. Da de fleste gastrointestinale sygdomsepisoder er milde og selvbegrænsende, er det muligvis ikke muligt at designe et randomiseret forsøg til at demonstrere klinisk effektivitet af testbehandling, da størstedelen af ​​de 22 patogener, der er påvist af FGP, ikke har gavn af antimikrobiel behandling. I stedet kan måling af andre resultater som reduceret udnyttelse af hospitalsressourcer såsom kontaktisolationsdage give bevis for både klinisk fordel og omkostningseffektivitet.

Til dato har den tilgængelige evidens om omkostningseffektiviteten af ​​FGP-assayet i vid udstrækning været baseret på observationsstudier, normalt historisk kontrollerede før-efter-design forbundet med høj risiko for bias. Det eneste studie, der var af tilstrækkelig kvalitet til at indgå i en systematisk gennemgang af omkostningseffektivitet, benyttede en anden PCR-baseret test. Da FGP-assayet har vist sig at have meget lignende diagnostiske karakteristika i en head-to-head sammenligning med denne anden PCR-baserede assay, vil resultaterne blive brugt til at informere om det primære resultat for denne undersøgelse. I undersøgelsen af ​​Goldenberg et al. blev forskelle i kontakt isolation dage mellem konventionel (observeret) og PCR-baseret test (simuleret) estimeret og fundet at resultere i en reduktion på 34,3% i kontakt isolation dage i den PCR-baserede gruppe. Blandt de 800 patienter svarede dette til en gennemsnitlig reduktion på 0,94 kontaktisolationsdage pr. patient. Desværre blev konfidensintervaller ikke estimeret for dette punktestimat. Omkostningerne ved en enkelt isolationsdag blev rapporteret til ca. £88 (UK) for regnskabsåret 2011/2012. En break-even-analyse viste, at en reduktion på 252 kontaktisolationsdage, en reduktion på 11,4 %, var nødvendig for at opveje de øgede omkostninger forbundet med det PCR-baserede assay. Omkostningerne ved det PCR-baserede assay, der blev brugt i denne undersøgelse, var 0,4 gange prisen for FGP-assayet, hvilket tyder på, at antallet af kontaktisolationsdage, der er nødvendige for at breakeven med FGP-analysen, kunne være så højt som 635. I en nyere konferencerapport fra en randomiseret undersøgelse i Det Forenede Kongerige ved hjælp af FGP estimerede en interimsanalyse en reduktion i kontaktisolationsdage med 0,9 dage pr. patient (95 % CI 0,4 til 1,6). Der var ingen data for omkostningseffektivitet. I betragtning af omfanget af usikkerhed omkring både den kliniske effektivitet og omkostningseffektivitet af FGP-assayet, ville et randomiseret test-treat-forsøg være den bedste mulighed for at løse disse usikkerheder.