Test delle feci con analisi molecolare per ridurre al minimo le precauzioni da contatto

La gastroenterite infettiva acuta può essere causata da virus, batteri o parassiti, causando una malattia diarroica che può essere accompagnata da febbre, dolore addominale e/o crampi, ematochezia, nausea e vomito. Dal 12,5% al ​​25% della popolazione sviluppa un'infezione gastrointestinale ogni anno, con la maggior parte dei casi autolimitanti e i sintomi che di solito si risolvono entro 14 giorni senza trattamento. Mentre la stragrande maggioranza dei 4 milioni stimati di canadesi che sviluppano la gastroenterite ha una malattia lieve e autolimitante, circa 9.250-14.150 vengono ricoverati ogni anno con l'1,6-2,2% che muore a causa della malattia.

Per i pazienti ospedalizzati, la maggior parte avrà campioni di feci raccolti e testati utilizzando metodi microbiologici standard che includono coltura per batteri, amplificazione dell'acido nucleico per virus e batteri e microscopia o immunodosaggi enzimatici per parassiti. Il numero di agenti patogeni che possono essere identificati è limitato nella maggior parte dei laboratori di microbiologia e il tempo di risposta alla segnalazione può richiedere fino a 3 giorni. Recentemente, sono state sviluppate nuove tecnologie di amplificazione dell'acido nucleico in grado di testare più agenti patogeni gastrointestinali in un'unica corsa che di solito richiede meno di 1 giorno di tempo per la segnalazione.

Il BioFire® FilmArray Gastrointestinal Panel (FGP) è un test di reazione a catena della polimerasi multiplex che può testare simultaneamente 22 diversi virus, batteri e parassiti con un'eccellente sensibilità e specificità con un tempo di risposta di 1 ora. Rispetto ai metodi di test convenzionali, l'FGP costa il 40% in più, o circa $ 180 (CDN) per test. Nonostante il rilevamento di più agenti patogeni in un periodo di tempo più breve, una recente revisione sistematica non ha trovato alcuna prova a sostegno di un impatto positivo sul miglioramento degli esiti dei pazienti o sul rapporto costo-efficacia rispetto ai test convenzionali. Poiché la maggior parte degli episodi di malattie gastrointestinali sono lievi e autolimitanti, potrebbe non essere possibile progettare uno studio randomizzato per dimostrare l'efficacia clinica del trattamento di prova, dato che la maggior parte dei 22 agenti patogeni rilevati dalla FGP non beneficia della terapia antimicrobica. Invece, la misurazione di altri risultati, come il ridotto utilizzo delle risorse ospedaliere, come i giorni di isolamento da contatto, potrebbe fornire prove sia del beneficio clinico che del rapporto costo-efficacia.

Ad oggi, le prove disponibili sull'efficacia in termini di costi del test FGP si sono basate in gran parte su studi osservazionali, solitamente storicamente controllati prima e dopo i disegni associati ad alto rischio di bias. L'unico studio di qualità sufficiente per essere incluso in una revisione sistematica del rapporto costo-efficacia ha utilizzato un diverso test basato sulla PCR. Poiché il test FGP ha dimostrato di avere caratteristiche diagnostiche molto simili in un confronto testa a testa con questo altro test basato su PCR, i risultati verranno utilizzati per informare l'esito primario di questo studio. Nello studio di Goldenberg et al., sono state stimate le differenze nei giorni di isolamento da contatto tra i test convenzionali (osservati) e basati su PCR (simulati) e si è riscontrato che si traducono in una riduzione del 34,3% nei giorni di isolamento da contatto nel gruppo basato su PCR. Tra gli 800 pazienti, ciò equivaleva a una riduzione media di 0,94 giorni di isolamento da contatto per paziente. Sfortunatamente, gli intervalli di confidenza non sono stati stimati per questa stima puntuale. Il costo di un singolo giorno di isolamento è stato riportato in circa £ 88 (Regno Unito) per l'anno fiscale 2011/2012. Un'analisi di pareggio ha dimostrato che era necessaria una riduzione di 252 giorni di isolamento da contatto, una riduzione dell'11,4%, per compensare l'aumento dei costi associati al test basato sulla PCR. Il costo del test basato sulla PCR utilizzato in questo studio era 0,4 volte il costo del test FGP, suggerendo che il numero di giorni di isolamento da contatto necessari per raggiungere il pareggio con il test FGP potrebbe arrivare fino a 635. In un più recente rapporto di una conferenza su uno studio randomizzato nel Regno Unito che utilizzava FGP, un'analisi ad interim ha stimato una riduzione dei giorni di isolamento da contatto di 0,9 giorni per paziente (IC 95% da 0,4 a 1,6). Non sono stati forniti dati sull'efficacia in termini di costi. Data l'entità dell'incertezza sull'efficacia clinica e sul rapporto costo-efficacia del test FGP, uno studio randomizzato test-treat sarebbe l'opzione migliore per risolvere queste incertezze.