Genová exprese PHF19 a delece genu EZH2 u akutní myeloidní leukémie

Akutní myeloidní leukémie (AML) je heterogenní klonální onemocnění charakterizované proliferací nezralých myeloidních buněk a selháním kostní dřeně. Diagnostika AML je založena na morfologické diagnostice s proliferací blastových buněk ≥ 20 % buněk kostní dřeně, průtokové cytometrické analýze a cytogenetických abnormalitách.

Etiologické agens a patogeneze AML nejsou zcela jasné, pouze několik případů AML lze přesně klasifikovat pomocí tradiční buněčné morfologické klasifikace. Je tedy velmi obtížné posoudit stav onemocnění a předpovědět prognózu. Nesprávná exprese specifických genů je běžným nálezem u AML a může indukovat klinicky relevantní biologické podskupiny. Cytogenetické abnormality a molekulární změny poskytují nejsilnější prognostické informace u AML. V důsledku toho identifikace nových biomarkerů, které by mohly předpovídat výsledek nebo vést volbu léčby, více přispěje ke klinické léčbě AML.

Genová represe je deaktivace aktivního genu, který způsobí zastavení transkripce a představuje mocný nástroj kontroly genové exprese, aby se zabránilo metabolické dysregulaci během vývoje nebo diferenciačního programu Polycomb repressive complex 2 (PRC2) je jediný enzymatický komplex schopný zavést genovou represi prostřednictvím vysokostupňové methylace histonu H3 na lysinu 27 (H3K27), proto hraje kritickou roli v regulaci normální krvetvorby. Enhancer of Zeste Homolog 2 (EZH2) gen je katalytická podjednotka PRC2, lokalizovaná na chromozomu 7q36.1. Gen EZH2 kóduje EZH2 methyltransferázu, která zprostředkovává transkripční inaktivaci prostřednictvím trimethylace lysinu 27 histonu H3 (H3K27me3). Methylační aktivita EZH2 usnadňuje tvorbu heterochromatinu, čímž umlčuje funkci genu, která je důležitá pro vývoj, diferenciaci a určení buněčného osudu.

Hromadné studie prokázaly, že dysregulace EZH2 se podílí na lidských rakovinách. EZH2 může mít dvojí roli ve vývoji rakoviny, působí jako nádorový supresor nebo onkogen v závislosti na typu rakoviny. Nadměrná exprese EZH2 byla pozorována u mnoha solidních nádorů a cílení na EZH2 může způsobit regresi karcinogeneze.

Inaktivace EZH2 medikovaná mutací nebo nedostatečnou expresí u myelo-dysplastických syndromů (MDS) nebo myeloproliferativních novotvarů (MPN) může přispívat k patogenezi onemocnění a je spojena se špatnou prognózou. U AML může dysregulace EZH2 způsobená mutací a nedostatečnou expresí působit jako potenciální biomarkery předpovídající prognózu a usměrňující volbu léčby mezi transplantací a chemoterapií. Bylo zjištěno, že EZH2 má tumor supresivní a onkogenní funkce v různých fázích AML.

Zbývá však definovat, zda se na rozvoji malignity podílí také deregulace různých partnerů spojených s ČLR2.

PHF 19 (PHD finger protein 19), polycomb-like člen PRC2 kofaktorů, působí jako kritický mediátor tumorigeneze. PHF 19 lokalizovaný v chromozomu 9q33.2, kóduje člen skupiny polycomb (PcG) proteinů, který funguje tak, že udržuje represivní transkripční stavy mnoha vývojových regulačních genů.

Ukázalo se, že PHF19 je hlavním modulátorem methylace histonů, čímž reguluje aktivitu transkripčního chromatinu. PHF19 přímo rekrutuje polycomb represivní komplex 2 (PRC2) prostřednictvím vazby na H3K36me3 a vede k aktivaci Enhancer of Zeste Homolog 2 (EZH2) jako enzymatické podjednotky PRC2, což vede k tri-methylaci H3K27. Předchozí studie potvrdily, že PHF19 je dysregulován u několika typů rakoviny, což vede k derepresi cílových genů PRC2 a může být použit jako marker agresivního onemocnění.

K dnešnímu dni nejsou zveřejněny žádné údaje o roli PHF19 a EZH2 v AML. Tato studie byla navržena tak, aby vysvětlila neprozkoumanou kritickou onkogenní dráhu AML, ve které vzor exprese PHF19 a delece genu EZH2 podporují maligní progresi a detekovaly jejich prognostickou roli.

Cíl práce:

1. Detekce vzoru exprese genu PHF19 pomocí polymerázové řetězové reakce (PCR) a delece genu EZH2 pomocí fluorescenční in situ hybridizace (FISH) u nově diagnostikovaných pacientů s AML.
2. Studovat souvislost mezi expresí genu PHF19 a delecí genu EZH2 u pacientů s AML.
3. Hodnocení role genů EZH2 a PHF19 jako prediktorových markerů výsledku u pacientů s AML.